本文選題：miR + 生物信息學(xué)�。� 參考：《中華疾病控制雜志》2015年01期

【摘要】：目的對hsa-miR-487b進(jìn)行靶基因的預(yù)測及功能分析,為進(jìn)一步研究其功能提供線索。方法應(yīng)用Pubmed和Google檢索hsa-miR-487b相關(guān)文獻(xiàn),選擇miRanda和Target Scan兩種方法預(yù)測其靶基因,取其交集,合并已經(jīng)實驗證實的靶基因作為進(jìn)一步生物信息學(xué)分析的基因集合,對此基因集合進(jìn)行功能富集分析(GO分析)和Pathway分析。結(jié)果 hsa-miR-487b序列在各物種間高度保守;其預(yù)測靶基因富集于細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)錄調(diào)控、細(xì)胞內(nèi)信號傳導(dǎo)、膜轉(zhuǎn)運、染色體的結(jié)構(gòu)及修飾、基因表達(dá)調(diào)控、酪氨酸激酶活性等共16個生物學(xué)過程和功能上(P0.05),富集于Erb B信號通路、MAPK信號通路、Fc epsilon RI信號通路、癌癥信號通路等7個通路,以及甲狀腺癌、膀胱癌、子宮內(nèi)膜癌、結(jié)直腸癌、急、慢性白血病這些疾病通路中(P0.10)。結(jié)論 hsa-miR-487b可能參與腫瘤發(fā)生及預(yù)后的生物學(xué)過程,為進(jìn)一步實驗性研究提供了線索。
[Abstract]:Objective to predict and analyze the target gene of hsa-miR-487b and provide clues for further study of its function. Methods the hsa-miR-487b literatures were searched by Pubmed and Google. Two methods, miRanda and Target scan, were selected to predict their target genes, and the intersection of them was selected. The target genes which had been confirmed by experiments were used as the gene sets for further bioinformatics analysis. Functional enrichment analysis (go analysis) and Pathway analysis were performed for this gene collection. Results the hsa-miR-487b sequence was highly conserved among different species, and its predictive target gene was enriched in cell proliferation, transcriptional regulation, intracellular signal transduction, membrane transport, chromosome structure and modification, gene expression regulation, and so on. Tyrosine kinase activity was found in 16 biological processes and functions (P0.05). It was enriched in 7 pathways, such as FC epsilon RI signaling pathway, cancer signal pathway, thyroid carcinoma, bladder cancer, endometrial carcinoma, colorectal cancer, and erb B signaling pathway. Acute, chronic leukemia in these disease pathways (P0.10). Conclusion hsa-miR-487b may be involved in the biological process of tumorigenesis and prognosis, which may provide clues for further experimental research.
【作者單位】： 中國醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院流行病學(xué)教研室;沈陽醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生學(xué)院衛(wèi)生統(tǒng)計學(xué)教研室;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(81272293)
【分類號】：R3416

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本文編號：2073283