本文選題：分子生物學(xué) + γ-氨基丁酸受體��； 參考：《深圳大學(xué)學(xué)報(bào)(理工版)》2015年02期

【摘要】：提出一種多學(xué)科交叉結(jié)合的策略,試圖初步獲得系統(tǒng)性調(diào)控γ-氨基丁酸(gamma-aminobutyric acid,GABA)受體基因的轉(zhuǎn)錄因子線索.利用基于功能基因組學(xué)方法的DNA元件百科全書(shū)計(jì)劃已發(fā)表的數(shù)據(jù),系統(tǒng)性地獲得GABA受體基因的開(kāi)放染色質(zhì)序列,并以此作為固相化探針,捕獲與其特異性相互作用的蛋白質(zhì)分子,并利用質(zhì)譜分析鑒定蛋白.結(jié)果發(fā)現(xiàn),對(duì)不同腦區(qū)獲得的核蛋白,探針都能捕獲到同樣的特異性條帶,然而,作為對(duì)照的天門(mén)冬氨酸(N-methyl-D-aspartate,NMDA)受體基因相關(guān)的開(kāi)放染色質(zhì)探針,在不同腦區(qū)中并未檢獲上述特異信號(hào),說(shuō)明結(jié)合蛋白是特異的.質(zhì)譜分析表明,與GABA受體基因相關(guān)的開(kāi)放染色質(zhì)特異相互作用的蛋白是核膜血影重復(fù)蛋白-1(nuclear envelop spectrin repeatprotein-1,Nesprin-1),又稱synaptic nuclear envelope-1(SYNE-1).進(jìn)一步的調(diào)控網(wǎng)絡(luò)生物信息學(xué)分析表明,Nesprin-1可能與MAFA、IRX2、BCL6、CEBPA以及RP58等轉(zhuǎn)錄因子形成復(fù)合物,并與GABA受體基因GABRA5、GABRA6、GABBR1和GABBR2等共表達(dá).表明GABA受體基因在不同腦區(qū)是通過(guò)相同的轉(zhuǎn)錄調(diào)控機(jī)制進(jìn)行表達(dá)的,Nesprin-1可能與MAFA、IRX2、BCL6、CEBPA以及RP58等轉(zhuǎn)錄因子形成復(fù)合物進(jìn)而調(diào)控GABA受體基因表達(dá),該特異的轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)有望用于誘導(dǎo)多能干細(xì)胞或是前體細(xì)胞直接分化為GABA能神經(jīng)元.
[Abstract]:A multidisciplinary cross-binding strategy was proposed to obtain the transcriptional factor clues for systematic regulation of gamma-aminobutyric GABA receptor gene. Using published data from the Encyclopedia of DNA components based on functional Genomics approach, the open chromatin sequence of GABA receptor gene was systematically obtained and used as a solid-phase probe. Protein molecules interacting with them were captured and identified by mass spectrometry. The results showed that the probes could capture the same specific bands for nuclear proteins obtained from different brain regions. However, the open chromatin probes associated with the gene of N-methyl-D-aspartate NMDA-receptor of aspartate were used as controls. These specific signals were not seized in different brain regions, indicating that the binding protein was specific. Mass spectrometric analysis showed that the open chromatin specific interaction protein associated with GABA receptor gene was nuclear envelop spectrin repeat protein -1 and nuclear envelop spectrin repeat protein-1, also known as synaptic nuclear envelope 1 and SYNE-1. Further bioinformatics analysis of regulatory networks suggested that Nesprin-1 may form complexes with transcription factors such as MAFAAIRX2BCL6, CEBPA and RP58, and co-express with GABA receptor gene GABRA5, GABRA6GABBR1 and GABBR2. It is suggested that the expression of GABA receptor gene in different brain regions is through the same transcriptional regulation mechanism. Nesprin-1 may be a complex of transcription factors, such as MAFA-IRX2BCL6, CEBPA and RP58, and then regulate the expression of GABA receptor gene. This specific transcription factor regulatory network is expected to be used to induce pluripotent stem cells or progenitor cells to differentiate directly into GABA neurons.
【作者單位】： 中山大學(xué)附屬第六醫(yī)院神經(jīng)科;深圳大學(xué)光電工程學(xué)院;
【基金】：廣東省醫(yī)學(xué)科學(xué)技術(shù)研究基金資助項(xiàng)目(A2012211) 廣州市天河區(qū)科技計(jì)劃重點(diǎn)資助項(xiàng)目(201404KW028)~~
【分類號(hào)】：R3416

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

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【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1869233