THAP11調控基因轉錄的分子機制研究
本文選題:THAP11 切入點:轉錄 出處:《安徽醫(yī)科大學》2010年碩士論文 論文類型:學位論文
【摘要】: THAP11屬于新發(fā)現(xiàn)的THAP蛋白質家族成員。該蛋白家族是一類鋅離子依賴的DNA結合蛋白質,廣泛參與細胞增殖、凋亡調控,并可能與染色體修飾與重構相關。前期研究表明THAP11可通過直接結合c-Myc啟動子區(qū)抑制c-Myc表達,進而抑制細胞增殖。此外,THAP11還可調控胚胎干細胞(ES)的自我更新和增殖。但目前對其作用機制尚無深入研究。本研究利用哺乳動物雙雜交系統(tǒng),發(fā)現(xiàn)THAP11同時具有轉錄激活和轉錄抑制活性,并通過系列缺失,確定了其功能結構域, N端82個氨基酸區(qū)具有轉錄抑制活性,C端185個氨基酸區(qū)具有轉錄激活活性。THAP11發(fā)揮轉錄抑制活性與染色體修飾相關因子關系。進一步利用酵母雙雜交技術,從成人肝臟cDNA文庫中篩選到CtBP1可與THAP11發(fā)生相互作用。利用免疫共沉淀技術,我們證實了THAP11與CtBP1存在相互作用,并確定了兩種相互作用結構域。鑒于該蛋白可通過直接的蛋白質相互作用參與轉錄因子發(fā)揮轉錄抑制的過程,THAP11與CtBP1相互作用可能是THAP11發(fā)揮轉錄抑制活性的方式。為進一步探討THAP11調控基因表達的分子機制,對全基因組進行THAP11潛在結合位點的檢索,發(fā)現(xiàn)Oct4啟動子含有THAP11潛在的結合位點。分離人Oct4啟動子區(qū),構建報告基因載體,發(fā)現(xiàn)THAP11可激活Oct4啟動子轉錄,這種激活活性依賴于其C端轉錄激活區(qū),而與其DNA結合能力無關。EMSA實驗證實THAP11能夠結合預測的結合位點結合,但系列缺失突變實驗證實THAP11對Oct4啟動子的激活并不依賴該結合位點,表明THAP11可能通過其它機制調控Oct4的表達。利用Real-time PCR實驗表明,在PA-1細胞中過表達THAP11可明顯上調內源Oct4的表達,表明Oct4是THAP11調控的靶基因。為進一步在ES細胞中檢測THAP11功能及作用機制,構建了人THAP11的慢病毒表達載體,并對慢病毒進行了包裝,獲得了THAP11慢病毒顆粒,為后續(xù)的研究提供了有力的工具。
[Abstract]:THAP11 is a newly discovered member of THAP protein family, which is a zinc ion-dependent DNA binding protein, which is widely involved in cell proliferation and apoptosis regulation. Previous studies have shown that THAP11 can inhibit c-Myc expression by direct binding to c-Myc promoter region. In addition, THAP11 can also regulate the self-renewal and proliferation of embryonic stem cell (es). However, there is no in-depth study on the mechanism of its action. In this study, the mammalian two-hybrid system was used. We found that THAP11 has both transcriptional activation and transcriptional inhibitory activity, and through a series of deletions, Its functional domain was determined. The N-terminal 82 amino acid regions had transcriptional inhibitory activity and C-terminal 185 amino acid regions had transcriptional activation activity. THAP11 played a role in the relationship between transcription inhibitory activity and chromosome modification. Further more, yeast two-hybrid technique was used. CtBP1 could interact with THAP11 from adult liver cDNA library. We confirmed that there was interaction between THAP11 and CtBP1 by immunoprecipitation. Two kinds of interaction domains were identified. In view of the direct protein interaction this protein can participate in the process of transcription inhibition by transcription factors. The interaction between THAP11 and CtBP1 may be the way in which THAP11 exerts its transcription inhibitory activity. In order to further explore the molecular mechanism of gene expression regulated by THAP11, By searching the whole genome for the potential binding sites of THAP11, we found that the Oct4 promoter contains the potential binding site of THAP11. The reporter gene vector was constructed by isolating the promoter region of human Oct4. It was found that THAP11 could activate the transcription of Oct4 promoter. This activation activity is dependent on its C-terminal transcriptional activation region, but independent of its DNA binding ability. EMSA experiments confirm that THAP11 can bind to predicted binding sites. However, a series of deletion mutation experiments confirmed that the activation of Oct4 promoter by THAP11 does not depend on the binding site, suggesting that THAP11 may regulate the expression of Oct4 through other mechanisms. Overexpression of THAP11 in PA-1 cells significantly upregulated the expression of endogenous Oct4, suggesting that Oct4 was a target gene regulated by THAP11. In order to further detect the function and mechanism of THAP11 in es cells, the lentivirus expression vector of human THAP11 was constructed. The lentivirus was packaged and THAP11 lentivirus particles were obtained, which provided a powerful tool for further research.
【學位授予單位】:安徽醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2010
【分類號】:R346
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,本文編號:1573218
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