本文關(guān)鍵詞： EB病毒 vIL-10 鼻咽癌 胃癌 基因多態(tài)性　出處：《青島大學(xué)》2013年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

【摘要】：目的EB病毒(Epstein-Barr virus,EBV)開放讀碼框架BamHI-C片段(BCRFI)與人白介素-10(hIL-10)基因有高度同源性,其編碼的病毒IL-10(vIL-10)與hIL-10有相似的生物學(xué)活性,主要表現(xiàn)為免疫抑制活性。本研究旨在明確鼻咽癌(nasopharyngeal carcinoma, NPC)、EBV相關(guān)胃癌(EBV-associated gastric carcinoma, EBVaGC)和健康人群中vIL-10的變異規(guī)律,探討其變異意義。 方法對164例山東地區(qū)EBV陽性標(biāo)本,包括83例NPC和41例EBVaGC組織以及40例健康成年人咽漱液(Throat washing,TW)標(biāo)本提取DNA,采用PCR和DNA測序檢測vIL-10編碼基因BCRFI的序列,應(yīng)用DNAStar軟件對vIL-10基因核苷酸及氨基酸序列進行對比分析。與EBV標(biāo)準(zhǔn)株序列比較,根據(jù)vIL-10成熟蛋白和信號肽區(qū)域出現(xiàn)的特征性改變對變異進行分類,比較NPC、EBVaGC和健康人群變異型的分布,分析序列變異對蛋白功能的影響。同時與以往發(fā)表同一人群EBV基因組BamHIF片段缺乏或出現(xiàn)BamHI識別位點的F/f分型(F和f型EBV)、早期基因BARF1變異(B95-8、V29A和Others變異型)進行連鎖分析。 結(jié)果①應(yīng)用DNA Star MegAlign分析,NPC、EBVaGC和健康人群TW標(biāo)本中vIL-10基因序列相似性高達98.8%,126例(76.8%,126/164)標(biāo)本與標(biāo)準(zhǔn)株B95-8氨基酸序列一致,被分類為B95-8變異型。②vIL-10成熟蛋白序列未發(fā)現(xiàn)共有氨基酸突變,出現(xiàn)6處無規(guī)律散在突變；vIL-10基因信號肽序列共發(fā)現(xiàn)2處共有錯義突變(V6M和G23S)和4處散在突變(R4S、L5F、C21R和D25N)。32例(19.5%,32/164)標(biāo)本在信號肽區(qū)域發(fā)生氨基酸突變,被分類SPM變異型,另外6例(3.7%,6/164)標(biāo)本在成熟蛋白序列各出現(xiàn)1處無規(guī)律散在突變,分類為其它組(Others)。③vIL-10成熟蛋白序列受體結(jié)合區(qū)域及免疫抑制功能區(qū)域均高度保守,信號肽序列某些變異可能會影響信號序列的切割及蛋白質(zhì)分泌。④NPC、EBVaGC和健康人群均以B95-8變異型檢出率最高,但SPM變異型僅在25例NPC(30.1%,25/83))NPC組織標(biāo)本和7例(17.5%,7/40)健康人群TW標(biāo)本中檢出,EBVaGC組織中未發(fā)現(xiàn)該變異型,vIL-10變異型在NPC和健康人群的分布與EBVaGC明顯不同(EBVaGC vs NPC:P0.0001; EBVaGC vs TW:P=0.006), NPC和健康人群之間的分布無顯著性差異(P=0.255)。⑤F/f分型、BARF1和vIL-10變異均成功檢測的145例標(biāo)本共發(fā)現(xiàn)10種不同的連鎖基因型(BamHI F/BARF1/vIL-10),以typeF/B95-8/1395-8最為多見,占67.6%(98/145)。10種連鎖基因型在EBVaGC和健康人群之間的分布無顯著性差異(P=0.480),但二者與NPC的分布不同,差異有顯著性(NPC vs EBVaGC:P0.0001; NPC vs健康人群P=0.007), type f/V29A/SPM、 type F/V29A/B95-8和type F/B95-8/SPM在NPC具有相對較高的檢出率。F型和f型EBV毒株中BARF1/vIL-10基因型的分布不同(P0.0001),f型EBV主要對應(yīng)V29A/SPM,占78.6%(11/14),而F型EBV主要對應(yīng)B95-8/B95-8,占74.8%(98/131)。 結(jié)論①vIL-10基因序列高度保守,尤其是其功能區(qū)。高度保守的序列利于其發(fā)揮免疫抑制功能,從而幫助EBV逃避和抵抗宿主免疫系統(tǒng)的抗病毒作用,長期在宿主體內(nèi)寄生。②B95-8變異型是山東地區(qū)vIL-10主要型別,SPM變異型可能與鼻咽部和口咽部上皮細胞相關(guān)。③BamHI F、BARF1和vIL-10基因變異存在關(guān)聯(lián)性,NPC中f型EBV主要對應(yīng)V29A/SPM基因型,且type f/V29A/SPM連鎖基因型在NPC檢出率相對較高,提示其與NPC相關(guān)。BamHIF、BARF1和vIL-10基因變異與NPC發(fā)生的相關(guān)性尚需采集NPC高發(fā)區(qū)NPC和非NPC標(biāo)本加以證實。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：青島大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號】：R373.11

【參考文獻】

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1 王云;EB病毒相關(guān)腫瘤中病毒基因多態(tài)性研究[D];青島大學(xué);2010年

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本文編號：1470299