本文關(guān)鍵詞：中國MERS輸入病例病毒基因組測序及分析　出處：《中國科學(xué):生命科學(xué)》2015年08期 　論文類型：期刊論文

  更多相關(guān)文章： 基因組 測序 中東呼吸綜合征 冠狀病毒

【摘要】：為測定分析中國第一例輸入性中東呼吸綜合征冠狀病毒基因組序列.采用PCR分段擴(kuò)增、測序、拼接的方法,組裝病毒基因組序列,應(yīng)用BLAST,MEGA6.0,SIMPLOT,RDP等軟件分析病毒序列的相似性、變異、進(jìn)化、重組事件.結(jié)果發(fā)現(xiàn),所完成的病毒序列長度為29928 bp,與韓國報(bào)道的序列最為接近.病毒核苷酸序列與近期中東地區(qū)分離到的病毒株序列相似性高達(dá)99.53%~99.92%;在多聚蛋白ORF1ab中有3個(gè)新發(fā)突變,而S,E,M,N蛋白未出現(xiàn)變異;核苷酸序列無明顯的片段重組現(xiàn)象.本研究表明,中國廣東第一例輸入性MERS患者的序列沒有出現(xiàn)明顯的變異,一些位點(diǎn)突變后功能變化仍需進(jìn)一步研究.
[Abstract]:In order to determine and analyze the genome sequence of the first imported Middle East Respiratory Syndrome coronavirus from China, the genome sequence of the virus was assembled by PCR fragment amplification, sequencing and splicing, and BLAST was used. MEGA 6.0 / simple RDP software was used to analyze the similarity, variation, evolution and recombination of virus sequence. The result showed that the length of virus sequence was 29928 BP. The nucleotide sequence of the virus is similar to that of the virus strain isolated recently in the Middle East, and the similarity of the nucleotide sequence of the virus is 99.53 and 99.92 respectively. There were three new mutations in the polymorphic protein ORF1ab, but no mutation in the protein. There was no significant fragment recombination in nucleotide sequence. This study showed that there was no significant variation in the sequence of the first imported MERS patient in Guangdong, China, and the functional changes after some locus mutations still need to be further studied.
【作者單位】： 南方醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生與熱帶醫(yī)學(xué)學(xué)院;廣東省疾病預(yù)防控制中心微生物檢驗(yàn)所;
【基金】：NFSC-廣東省聯(lián)合基金(批準(zhǔn)號(hào):U1132002) 廣東省科技計(jì)劃項(xiàng)目(批準(zhǔn)號(hào):2010A40302003) 國家自然科學(xué)基金(批準(zhǔn)號(hào):81272483)資助
【分類號(hào)】：R373.1
【正文快照】： 引用格式:謝茜,曹宇娟,蘇娟,等.中國MERS輸入病例病毒基因組測序及分析.中國科學(xué):生命科學(xué),2015,45:799 803自2012年9月第一例中東呼吸綜合征(MiddleEast Respiratory Syndrome,MERS)患者確診以來[1,2],該病波及23個(gè)國家,死亡率達(dá)近40%[3],成為全球威脅人類健康的重要疾病.近

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本文編號(hào)：1397360