本文關鍵詞：人類細胞周期及凋亡網絡的模型建立與模擬分析研究　出處：《哈爾濱工業(yè)大學》2010年碩士論文　論文類型：學位論文

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【摘要】：系統(tǒng)生物學的發(fā)展使得生物建模和計算機模擬成為生物過程模擬中越來越重要的手段,可以有力地支持生物學家及其他研究人員在醫(yī)學和制藥等領域的研究。將生物實驗的機理抽象轉化為相應的數(shù)學模型,是目前系統(tǒng)生物學與生物信息學的主要任務之一。另一方面,將這些數(shù)學模型在軟件平臺上可視化的表達與實現(xiàn),已經成為了模擬生物網絡強有力的輔助手段,可以進行生物實驗中不便于展開的操作。 細胞周期的生物機理已經展開了大量的研究,但是直到最近仍然有新的實驗結論出現(xiàn)。一些非編碼的miRNA已經被確認能夠參與細胞網絡中的調控,例如細胞周期網絡。本文整合最新發(fā)現(xiàn)的生物實驗結論,將這些結論結合到已有的細胞周期模型中,定性的將miRNA對靶mRNA的調控也加入其中。更進一步的設計出定性合理的可伸縮時鐘模型,可以更好的模擬該網絡。然后將整合好的模型通過CellMatlab軟件平臺模擬實現(xiàn),驗證了該模型。并且通過一系列的模擬實驗預測了在同時受到miRNA抑制的前提下,miRNA的靶mRNA具有正協(xié)同作用;miRNA與細胞周期網絡的系統(tǒng)一樣,具有飽和性。 細胞凋亡網絡的機理仍在廣泛的研究中,其中p53居于其上游的核心位置。更是有研究表明,該網絡與細胞周期網絡存在著緊密聯(lián)系。二者的相互作用在醫(yī)療領域研究對癌癥的治療具有重要意義。本文主要考察細胞凋亡網絡重要轉錄因子p53與周期網絡重要轉錄因子E2F的關系,逐步抽象建立了關于二者的負反饋環(huán)模型。在此模型基礎上,通過穩(wěn)態(tài)分析,推導并討論了p53抑制E2F通路對細胞狀態(tài)的影響。然后通過CellMatlab軟件平臺進行模擬實驗,預測了p53與E2F共同影響了細胞的狀態(tài)。更進一步的通過模擬實驗進行暫態(tài)研究,發(fā)現(xiàn)預測了p53具備原癌與抑癌的雙重功能。最后由此總結了針對E2F表達量對應著細胞的不同狀態(tài),如何抑制腫瘤細胞的定性方法。
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【學位授予單位】：哈爾濱工業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2010
【分類號】：R329

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1 劉，

本文編號：1350027