本文關(guān)鍵詞：我國幽門螺桿菌cagPAI序列特征分析及致炎機(jī)制研究　出處：《中國疾病預(yù)防控制中心》2010年博士論文　論文類型：學(xué)位論文

  更多相關(guān)文章： 幽門螺桿菌 cag致病島 序列特征 細(xì)胞因子

【摘要】： 幽門螺旋桿菌(Helicobacter pylori,簡稱HP)是一種微需氧、彎曲狀的革蘭氏陰性細(xì)菌,主要寄居在人的胃部。全世界一半以上的人口感染HP。世界衛(wèi)生組織在1994年將其列為Ⅰ類致癌因子。 cagPAI是長約37Kb的基因簇,是一段外源基因通過基因片段的水平轉(zhuǎn)移插在HP基因組的谷氨酸鹽消旋酶基因末端。cagPAI通常含有28個(gè)基因,編碼與HP毒力密切相關(guān)多種蛋白,且cagPAI的遺傳多態(tài)性影響菌株毒力。NCBI提交的完全測通的cagPAI序列有23條,序列比對顯示,cagPAI基因具有明顯的遺傳多樣性。目前,在NCBI上尚無中國地區(qū)完整的cagPAI序列信息,然而HP基因組高度的多態(tài)性及明顯的地域特征提示,在中國遼闊的地區(qū),cagPAI應(yīng)該有其獨(dú)特的地域性特點(diǎn)。充分認(rèn)識cagPAI多態(tài)性與地域性和疾病的相關(guān)性,有助于了解菌株與宿主的相互作用,了解菌株與致病性的關(guān)系,了解菌株與胃癌等嚴(yán)重胃腸道疾病相關(guān)性。 本研究選取了中國的四個(gè)地區(qū)86株分離自不同患者的HP,對其cagPAI進(jìn)行了測序,共測通77條cagPAI。基于77條完整的cagPAI核苷酸序列,我進(jìn)行了如下工作：①對cagPAI核苷酸序列特征進(jìn)行了描述,包括cagPAI上攜帶的基因、核苷酸長度及GC含量等；將77條cagPAI進(jìn)行多序列比對及聚類分析,發(fā)現(xiàn)中國菌株cagPAI上的8個(gè)高變區(qū),并對8個(gè)高變區(qū)、cagA/CagA、cagY和CagL等的遺傳多態(tài)性進(jìn)行了分析�；谏鲜龇治�,本研究認(rèn)為：①較NCBI提交菌株相比中國菌株cagPAI有著明顯的地域性特征；②中國不同地區(qū)的菌株之間也存在cagPAI的地域特征；③本研究報(bào)道了四株菌株的CagA羧基端發(fā)生大片段缺失現(xiàn)象,在NCBI尚無類似菌株報(bào)道；④本研究首先報(bào)道了在國內(nèi)菌株中位于CagA東西方型菌株保守序列區(qū)的氨基酸變異,且在NCBI發(fā)現(xiàn)只有越南和泰國上報(bào)道了四株類似菌株；⑤本研究發(fā)現(xiàn)不同菌株的cagY基因序列有著高度的異質(zhì)性,77株HP的cagY基因同源性僅為32.9%,基因長度范圍為3534-5394bp。經(jīng)過序列比對后發(fā)現(xiàn),中國菌株的cagY序列較NCBI提交菌株有一定的差異,表現(xiàn)在基因平均長度較NCBI提交菌株短1kb左右；且73株(約占94.8%)中國菌株的cagY重復(fù)片段連續(xù)集中在基因的一個(gè)區(qū)域內(nèi),而大多數(shù)西方菌株的重復(fù)片段分布在基因的兩個(gè)區(qū)域內(nèi)；⑥在CagL的氨基酸序列上發(fā)現(xiàn)了與HP粘附相關(guān)的AGD基序在某些菌株上發(fā)生了變異,而這種變異未見報(bào)道。 本研究中選用了26695、26695ΔcagA和中國株XA195、FJ21、FJ15攻擊AGS細(xì)胞,在14個(gè)時(shí)間點(diǎn)采集細(xì)胞培養(yǎng)上清液。利用液態(tài)芯片技術(shù)檢測了IL-10、IL-4、IL-6、IL-2、IL-12、IFN-γ、TNF-α、TGF-β、IL-8和VEGF等10種細(xì)胞因子的分泌水平。研究發(fā)現(xiàn)①與HP攻擊AGS密切相關(guān)的細(xì)胞因子有IL-8和VEGF,并據(jù)此推測了胃粘膜上皮細(xì)胞在應(yīng)對HP感染初時(shí)的功能；②缺失HP0521基因的XA195菌株仍能較高水平的刺激AGS細(xì)胞分泌細(xì)胞因子,提示HP0521基因的缺失不影響IL-8和VEGF的分泌；③本研究通過分析26695和26695ΔcagA與AGS細(xì)胞的相互作用證實(shí)了CagA參與了刺激AGS細(xì)胞產(chǎn)生IL-8和VEGF,并推算出了CagA刺激AGS細(xì)胞分泌細(xì)胞因子所需時(shí)間約為24-28h；④本研究通過分析XA195、FJ21和FJ15與AGS細(xì)胞的相互作用證實(shí)了CagA部分缺失影響了菌株刺激細(xì)胞因子分泌的能力；⑤本研究發(fā)現(xiàn)FJ21和FJ15菌株刺激AGS分泌的IL-8有顯著差異而FJ21和FJ15菌株刺激AGS分泌的VEGF無明顯差異,這個(gè)現(xiàn)象提示HP刺激AGS細(xì)胞分泌IL-8和VEGF的細(xì)胞通路是有差別的。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】：中國疾病預(yù)防控制中心
【學(xué)位級別】：博士
【學(xué)位授予年份】：2010
【分類號】：R378

【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前9條

1 何晉德;劉玉蘭;王懷唐;葉輝;張嬌;;幽門螺桿菌血清CagA抗體與消化系統(tǒng)惡性腫瘤的關(guān)系[J];中國醫(yī)師雜志;2006年05期

2 沈蘭蘭;幽門螺桿菌共識 1997年亞太地區(qū)關(guān)于幽門螺桿菌感染處理的共識會議報(bào)告[J];國外醫(yī)學(xué)(消化系疾病分冊);1998年02期

3 張建中;;對我國幽門螺桿菌研究的思考[J];胃腸病學(xué);2007年01期

4 徐順福;張國新;施瑞華;郝波;苗毅;;CagA蛋白序列可變區(qū)多態(tài)性分析[J];胃腸病學(xué);2007年06期

5 周建嫦;徐采樸;張建中;;幽門螺桿菌cagA/CagA分子生物學(xué)研究進(jìn)展[J];世界華人消化雜志;2001年05期

6 周軍,曾潯,尹焱,郭欣,張建中;幽門螺桿菌cagA基因及蛋白序列多態(tài)性分析[J];世界華人消化雜志;2004年06期

7 吳鶯;張尤歷;王文兵;陳勁頻;沈琰;;不同地區(qū)幽門螺桿菌cagA基因羧基端可變區(qū)及其蛋白序列差異分析[J];世界華人消化雜志;2007年07期

8 楊桂芳,鄧長生,熊永炎,羅峻,汪必成,田素芳,徐柯;核因子κB p65及靶基因在CagAHp胃癌及癌前病變中的表達(dá)研究[J];中華腫瘤雜志;2004年09期

9 黃志剛;段廣才;范清堂;郗園林;;幽門螺桿菌中國株cagA全長基因克隆及其分子特征分析[J];中國人獸共患病學(xué)報(bào);2007年05期

，

本文編號：1347721