本文關(guān)鍵詞：部分新型腸道病毒山東地方株全基因組分析及血清流行病學(xué)研究　出處：《山東大學(xué)》2014年碩士論文　論文類型：學(xué)位論文

  更多相關(guān)文章： 新型腸道病毒 山東地方株 基因組 血清流行病學(xué) 中和抗體

【摘要】：[背景] 人類腸道病毒(Enteroviruses, EVs)型別眾多,通常以無癥狀的隱性感染為主,但也可引起急性弛緩性麻痹(Acute Flaccid Paralysis, AFP)、腦膜炎或腦炎、手足口病(Hand, Foot and Mouth Disease, HFMD)、急性出血性結(jié)膜炎、心肌炎、類感冒病癥等多種疾病,是重要的人類致病病原。 EVs基因組全長約7.5kb,為單股正鏈RNA,包括5'端非編碼區(qū)(5'-nontranslated Region,5' NTR),編碼多聚蛋白的單一開放讀碼框(Open Reading Frame, ORF)和3'NTR3個組成部分。1999年,Oberste等首次提出了基于EV VP1序列的分子生物學(xué)定型方法。傳統(tǒng)血清學(xué)方法無法定型的EVs陸續(xù)被鑒定出來,目前已分離到40多個新型EVs基因型。其原型株的全基因組多數(shù)已經(jīng)測序完成,但其他分離株的全基因組序列信息有限。EVs進化活躍,目前已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的新型EVs,如EV-A76, EV-B74, EV-C96等,均有點突變和型內(nèi)重組發(fā)生。對新型EVs全基因組特征的分析,能夠全面掌握毒株的重組和進化特點,并為基因組數(shù)據(jù)庫提供全面的序列信息,對于分析病毒在地區(qū)及全球的傳播情況提供參考依據(jù)。 新型EVs雖然發(fā)現(xiàn)較晚,但已與多起疾病暴發(fā)相關(guān),如EV-A71已在東亞和東南亞地區(qū)引發(fā)數(shù)起HFMD大流行,成為全球的重大公共衛(wèi)生問題。另外,EV-B75、 EV-A76和EV-A89與2006年印度、西班牙等國家的病毒性腦炎暴發(fā)有關(guān)。某些新型EVs的感染還表現(xiàn)為發(fā)熱、消化道和／或呼吸道癥狀,常常不易鑒別,這給疾病的預(yù)防與早期診治帶來很大困難。進行EVs血清流行病學(xué)研究能夠掌握人群中EVs抗體攜帶情況,了解人群的易感性和免疫水平的動態(tài)變化,為疾病的預(yù)防提供參考依據(jù)。目前僅有少數(shù)新型EVs的血清流行病學(xué)研究報道。 [研究目的] 1.在前期研究的基礎(chǔ)上,繼續(xù)對發(fā)現(xiàn)的部分新型EVs山東分離株(EV-A71C2亞型,EV-B74, EV-B80, EV-B87)的全基因組特征進行分析； 2.選擇部分新型EVs山東分離株(EV-A71C4亞型,EV-B87, EV-A90),對健康人群的血清中和抗體水平進行檢測分析。 [研究方法] 1.對已經(jīng)鑒定出的新型EVs山東分離株(EV-A71C2亞型、EV-B74、 EV-B80、EV-B87)進行全基因組序列測定。 2.使用BioEdit7.1.7軟件,對新型EVs山東分離株與原型株間核苷酸、氨基酸序列相似性進行比對。 3.采用Mega4.0軟件,以鄰位法(Neighbor-joining Method)與同型分離株構(gòu)建P1、P2、P3區(qū)系統(tǒng)發(fā)生樹,對新型EVs山東分離株進行進化重組分析。 4.使用Simplot3.5.1軟件,分析新型EVs山東分離株與同型分離株在基因組中的重組。 5.選擇部分新型EVs山東分離株(EV-A71C4亞型,EV-B87, EV-A90),對健康人群血清中和抗體水平進行檢測分析。 [主要結(jié)果] 1.新型EVs全基因組序列特征分析 全基因組序列特征分析顯示,EV-A74、EV-B80、EV-B87的非結(jié)構(gòu)蛋白編碼區(qū)均發(fā)現(xiàn)了基因重組的證據(jù)。在該區(qū)域,EV-A74山東株與E13和E19原型株序列同源性較高；EV-B80山東株與E19、E27和E13原型株序列同源性較高；EV-B87山東株與CVB2、EV-B85和EV-B98原型株序列同源性較高。EV-B80山東株相比其原型株,在衣殼蛋白VPl編碼區(qū)3'端有36個核苷酸插入。插入位點正是不同基因型間衣殼蛋白編碼區(qū)長度變化的區(qū)域。 EV-A71C2亞型山東株96200的全基因組序列分析發(fā)現(xiàn),96200在P1、P2和P3區(qū)與EV-A71C2亞型的澳大利亞分離株7F/AUS/6/99、臺灣分離株NCKU9822、Tainan/5746/98/TW/1998和pinf7-54A均在同一分支；與類EV-A71C2亞型臺灣分離株2008-00643僅P1區(qū)在同一分支,在P2和P3區(qū)分屬不同分支。Simplot同源重組分析發(fā)現(xiàn),在P1、P2和P3區(qū),96200與7F/AUS/6/99、NCKU9822、Tainan/5746/98/TW/1998和pinf7-54A序列相似性均超過90‰與2008-00643、EV-A71原型株BrCr及EV-A71山東地方株JN01/10的相似性,P1區(qū)明顯高于P2和P3區(qū)。 2.新型EVs血清流行病學(xué)分析 血清流行病學(xué)研究所用標本來自2010年脊髓灰質(zhì)炎病毒中和抗體監(jiān)測用血清標本,標本來自10個年齡組,共計390份。EV-A71、EV-B87和EV-A90在人群中的抗體陽性率分別為46.0%、47.0%和8.8%。EV-A71、EV-B87和EV-A90在人群中的抗體陽性率與年齡關(guān)系較為密切,在7個月～2歲左右出現(xiàn)最低值,之后逐漸增高。 EV-A71、EV-B87和EV-A90在人群中幾何平均滴度(Geometric Mean Titer,GMT)分別為1：5.20、1：4.02和1：1.49,在7個月-2歲左右出現(xiàn)最低值,在5-14歲學(xué)齡段出現(xiàn)高值。3.5%的人群EV-A71的GMT≥1：256,符合HFMD實驗室診斷病例的標準。僅有0.3%的調(diào)查者出現(xiàn)EV-A90的GMT≥1：256,無調(diào)查者出現(xiàn)EV-B87的GMT≥1：256。 [主要結(jié)論] 1.本研究對EV-A71C2亞型以及EV-B74、EV-B80和EV-B87型山東地方株進行了全基因組序列分析。除EV-B74之外,其他均為國內(nèi)首次報道的全基因序列。 2. EV-A71C2亞型分離株在1996～1999年間較為保守,根據(jù)現(xiàn)有的基因組數(shù)據(jù)庫資料未發(fā)現(xiàn)重組的證據(jù)。相比1996～1999年的EV-A71C2亞型分離株,2008年臺灣類EV-A71C2亞型分離株2008-00643已經(jīng)發(fā)生了重組。 3. EV-B74、EV-B80、EV-B87山東分離株與其他EV-B組腸道病毒在P2和P3非結(jié)構(gòu)蛋白編碼區(qū)發(fā)生重組。EV-B80的基因組比對結(jié)果顯示,核苷酸的插入和缺失也是EV結(jié)構(gòu)蛋白基因進化的機制之一。 4.7個月-2歲兒童EV-A71、EV-B87和EV-A90抗體陽性率最低,可能是EV的易感人群。 5.EV-B87可能與某些流行的EVs間存在交叉抗體反應(yīng),人群中天然形成了EV-B87免疫屏障,由此推測EV87可能不會引發(fā)大范圍的流行。 6.EV-A90在人群中抗體陽性率較低,而全球和國內(nèi)分離毒株相對較多,涉及地理范圍廣,需要對其加強監(jiān)測。 7.5-14歲年齡組兒童EV-A71、EV-B87和EV-A90中和抗體GMT最高,是感染易發(fā)生的年齡段,應(yīng)加強在學(xué)齡兒童中的預(yù)防工作,必要時應(yīng)研發(fā)疫苗開展預(yù)防接種。
【學(xué)位授予單位】：山東大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號】：R373.2

【相似文獻】

相關(guān)期刊論文 前10條

1 胡玉山;王鳴;杜琳;江麗芳;鄧志愛;劉俊華;候水平;林云萬;莫自耀;;副溶血性弧菌流行群特異多重PCR鑒定[J];中國公共衛(wèi)生;2007年05期

2 陸琴,黃愛民,楊幼明,楊俊華,楊惠珍;貓弓形蟲感染的血清流行病學(xué)調(diào)查[J];上海實驗動物科學(xué);1996年Z1期

3 楊華,彭克發(fā);彭水縣2001至2002年鉤端螺旋體病血清流行病學(xué)監(jiān)測分析[J];西南師范大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2005年02期

4 楊培榮;郭淑霞;譚曉華;楊磊;付碧石;王林定;張景玉;張國寧;;新疆某地維吾爾族男性吸毒者KSHV血清流行病學(xué)初步分析[J];石河子大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);2010年01期

5 吳家駒;劉延明;張齊良;胡必勇;陳茂義;;急性出血性結(jié)膜炎流行后居民中柯薩奇病毒A24變種抗體水平的變化[J];中國病毒學(xué);1992年02期

6 段幸生;李紹東;周亞敏;普建剛;刀偉英;;獼猴B病毒相關(guān)抗體調(diào)查[J];實驗動物與比較醫(yī)學(xué);1993年02期

7 高一彤;曲京華;趙玫;;絲狀病毒出血熱的血清流行病學(xué)調(diào)查研究及現(xiàn)狀[J];微生物學(xué)雜志;2006年02期

8 洪濤,王長安,周德南,范瑞蓮,張家駒,趙同興,杜治冰,尹愛紅,張永和,鄧秉鈞,吳文翰;成人腹瀉輪狀病毒的血清流行病學(xué)[J];病毒學(xué)報;1985年03期

9 呂志;付士紅;王鳳田;Kosoy Olga L;Nasci Roger S;梁國棟;;中國新疆維吾爾自治區(qū)不明原因發(fā)熱人群中Tahyna病毒感染狀況調(diào)查[J];病毒學(xué)報;2011年01期

10 劉君俠 ,剡根強 ,費偉蓮;石河子地區(qū)部分雞場馬立克氏病血清流行病學(xué)[J];石河子大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版);1986年02期

相關(guān)會議論文 前10條

1 楊秀惠;嚴延生;;福建省HEV71引起手足口病流行的原因探討——HEV71血清流行病學(xué)及分子流行病學(xué)研究[A];華東地區(qū)第十次流行病學(xué)學(xué)術(shù)會議暨華東地區(qū)流行病學(xué)學(xué)術(shù)會議20周年慶典論文匯編[C];2010年

2 向華;黃元;王貴平;宣華;江禹;扈榮良;夏咸柱;涂長春;;犬群免疫國產(chǎn)狂犬病弱毒疫苗后的血清流行病學(xué)調(diào)查分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會獸醫(yī)公共衛(wèi)生學(xué)分會成立大會暨第一次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2008年

3 張加勇;孫剛;朱琪;趙曉春;李鑫;李海山;郭昭林;楊本;;黑龍江省豬圓環(huán)病毒Ⅱ型血清流行病學(xué)調(diào)查[A];第一屆中國養(yǎng)豬生產(chǎn)和疾病控制技術(shù)大會——2005中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會學(xué)術(shù)年會論文集[C];2005年

4 胡必杰;;培育醫(yī)院流行病學(xué)專家,提高我國醫(yī)院感染綜合管理能力[A];中國醫(yī)院協(xié)會第十六屆全國醫(yī)院感染管理學(xué)術(shù)年會資料匯編[C];2009年

5 王建敏;張艷;馬德蘭;劉嵐錚;韓秀云;;濟南市麻疹血清流行病學(xué)監(jiān)測分析[A];山東預(yù)防醫(yī)學(xué)會首屆學(xué)術(shù)年會資料匯編[C];2003年

6 周緒斌;秦云;丹尼;李聰;栗娟;雷健良;張波;歐陽寬忠;周克鋼;;豬偽狂犬病的控制——2007年中國規(guī)�；i場偽狂犬病野毒血清流行病學(xué)系統(tǒng)監(jiān)測與分析[A];2008年中國豬業(yè)進展[C];2008年

7 周緒斌;Daniel Torrents;李聰;栗娟;雷健良;歐陽寬忠;周克鋼;張波;;六個未免疫喘氣病疫苗的規(guī)模化豬場肺炎支原體血清學(xué)動態(tài)監(jiān)測與啟示[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會動物傳染病學(xué)分會第三屆豬病防控學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2008年

8 鄭英杰;葛勝祥;張軍;郭清順;吳文翰;王法弟;夏寧邵;姜慶五;;豬是人戊型肝炎病毒感染的主要宿主[A];全國人畜共患病學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2006年

9 周緒斌;雷健良;周克鋼;鐵軍;Daniel Torrents;葉陽;歐陽寬忠;鄢長瑞;王士祥;楊雄華;阮志勇;李聰;栗娟;秦云;;2008年中國11省市規(guī)�；i場偽狂犬病野毒血清流行病學(xué)系統(tǒng)監(jiān)測與分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會家畜傳染病學(xué)分會第七屆全國會員代表大會暨第十三次學(xué)術(shù)研討會論文集（上冊）[C];2009年

10 秦毅斌;趙武;何蘋萍;李茂寧;梁家幸;何穎;盧冰霞;李斌;肖愛歡;劉芳;蘇乾蓮;梁保忠;覃勇;張偉;韋建華;曹國敏;黃偉堅;;廣西豬羊乙型腦炎血清流行病學(xué)調(diào)查[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會獸醫(yī)公共衛(wèi)生學(xué)分會第二次學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2010年

相關(guān)重要報紙文章 前10條

1 孟剛邋通訊員 黃顯斌;全國人群乙肝血清流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果公布[N];中國消費者報;2008年

2 駐滬記者 張莉;乙肝疫苗,你打了嗎？[N];醫(yī)藥經(jīng)濟報;2008年

3 樊丹;我國乙肝表面抗原攜帶者9300萬人[N];中國中醫(yī)藥報;2008年

4 單輝;肺炎也會導(dǎo)致脈硬化[N];醫(yī)藥養(yǎng)生保健報;2006年

5 馬洪波;珠海局一研究項目通過科技成果鑒定[N];中國國門時報;2007年

6 黃顯斌;丙肝——悄悄害你沒商量[N];中國中醫(yī)藥報;2006年

7 梅子;我國兒童感染乙肝人數(shù)減少近8000萬[N];中國改革報;2008年

8 勵俊;全國首個小學(xué)生肝炎知識教育項目啟動[N];科技日報;2008年

9 本報記者 向杰;血樣測試：破解SARS隱身術(shù)[N];科技日報;2003年

10 李學(xué)梅;今冬諾瓦克病毒引起腹瀉者增多[N];北京日報;2007年

相關(guān)博士學(xué)位論文 前8條

1 張麗;乙肝疫苗使用20年后山東省乙型病毒性肝炎血清和分子流行病學(xué)研究[D];山東大學(xué);2009年

2 楊勇;人類皰疹病毒6型感染腎臟移植受者的臨床實驗研究[D];中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué);1995年

3 孫虹;我國南方口岸流行性乙型腦炎和人禽流行性感冒監(jiān)測與分子流行病學(xué)研究[D];第一軍醫(yī)大學(xué);2006年

4 康殿民;山東省腎綜合征出血熱時空流行動態(tài)研究[D];山東大學(xué);2006年

5 陳弟詩;豬乙型腦炎病毒—細小病毒—偽狂犬病毒活載體疫苗的研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

6 初小輝;吉林省豬偽狂犬病流行病學(xué)調(diào)查與防控措施的研究及應(yīng)用[D];吉林大學(xué);2011年

7 辛九慶;牛傳染性胸膜肺炎診斷技術(shù)與分子流行病學(xué)研究[D];吉林農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

8 顏其貴;PRRSV-SCQ株結(jié)構(gòu)基因生物信息學(xué)及人工感染仔豬病理變化與超微結(jié)構(gòu)研究[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

相關(guān)碩士學(xué)位論文 前10條

1 劉曉林;部分新型腸道病毒山東地方株全基因組分析及血清流行病學(xué)研究[D];山東大學(xué);2014年

2 戴迎春;諾瓦克樣病毒血清流行病學(xué)及基因型別分析研究[D];第一軍醫(yī)大學(xué);2004年

3 高招;河北省乙型肝炎病毒感染血清流行病學(xué)特征分析[D];河北醫(yī)科大學(xué);2013年

4 于德憲;重組人干擾素α-2b噴霧劑人群應(yīng)用的安全性及其預(yù)防呼吸道病毒感染的效果評價[D];第一軍醫(yī)大學(xué);2005年

5 常昭瑞;SARS-CoV結(jié)構(gòu)蛋白血清IgG抗體變化規(guī)律及恢復(fù)期SARS患者排毒監(jiān)測[D];山西醫(yī)科大學(xué);2004年

6 張媛媛;確定化療目標對象的新型血吸蟲病診斷體系的研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2006年

7 李永成;乙型肝炎病毒感染現(xiàn)狀、影響因素及乙肝疫苗免疫持久性研究[D];天津醫(yī)科大學(xué);2008年

8 王俊明;1986、2005年黑龍江省肇東農(nóng)村HBV感染標志分析及五種乙肝診斷試劑對比評價[D];河北醫(yī)科大學(xué);2006年

9 陳雅紅;泉州市麻疹流行因素研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2009年

10 高洪彩;云南省某地艾滋病病毒和其他性傳播感染的流行病學(xué)研究[D];東南大學(xué);2006年

，

本文編號：1334618