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mmu-miR-107調(diào)控Cacna2d1基因的mRNA水平

發(fā)布時(shí)間:2017-12-25 21:30

  本文關(guān)鍵詞:mmu-miR-107調(diào)控Cacna2d1基因的mRNA水平 出處:《廣東醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào)》2015年05期  論文類型:期刊論文


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【摘要】:目的生物信息學(xué)預(yù)測并實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證mmu-miR-107的靶基因。方法利用Target Scan、miRanda、Clip-seq及miRDB預(yù)測mmu-miR-107靶基因,分別構(gòu)建含有候選靶基因(Cacna2d1、Capza2、Celsr2、Csnk1g2和Tmem47)3'UTR的熒光素酶報(bào)告載體p GL3,通過雙熒光素酶檢測系統(tǒng)、時(shí)實(shí)定量PCR進(jìn)一步驗(yàn)證預(yù)測的靶基因。結(jié)果成功構(gòu)建分別含有5個(gè)候選靶基因3'UTR的熒光素酶報(bào)告載體;與mi R-NC組相比,mi R-107組共轉(zhuǎn)染p GL3-Cacna2d1 3'UTR、p GL3-Cav13'UTR的熒光素酶活性均顯著下降(P0.01或0.05);其余候選靶基因Capza2、Celsr2、Csnk1g2和Tmem47的共轉(zhuǎn)染組熒光素酶活性差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P0.05);過表達(dá)或下調(diào)C2C12細(xì)胞的miR-107,可有效降低或提高Cacna2d1的mRNA水平表達(dá)(P0.05)。結(jié)論初步驗(yàn)證Cacna2d1是mmu-miR-107的靶基因。
【作者單位】: 廣東醫(yī)學(xué)院衰老研究所;廣東醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)學(xué)院;廣東醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)研究所;廣東省分子診斷重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;重慶醫(yī)科大學(xué)檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)院;
【基金】:國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.81170327) 廣東省醫(yī)學(xué)科研基金(No.A2014470) 東莞市醫(yī)療衛(wèi)生一般項(xiàng)目(No.201410515200159;2011108102031) 廣東醫(yī)學(xué)院科研基金項(xiàng)目(No.M2013002;M2010007) 廣東醫(yī)學(xué)院大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(No.201310571009;1057113036) 廣東醫(yī)學(xué)院建博科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(No.STIF201102)
【分類號】:R3416
【正文快照】: 與細(xì)胞生物學(xué)和分子生物學(xué)研究相互補(bǔ),生物信息學(xué)在推進(jìn)mi RNAs研究的進(jìn)程中發(fā)揮著非常重要的作用。mi RNA與靶基因m RNAs的3'UTR結(jié)合而發(fā) 揮生理功能,生物信息技術(shù)可預(yù)測受mi RNA調(diào)控的相關(guān)m RNA[1]。前期研究發(fā)現(xiàn)[2],mi R-107在核纖層蛋白病相關(guān)動物模型Lmna-/-與野生型小

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本文編號:1334522

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