本文關(guān)鍵詞：噬病毒體啟動子模體的初步預(yù)測分析

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【摘要】：噬病毒體作為遺傳信息的承載者和傳播者,在生態(tài)系統(tǒng)中有著舉足輕重的作用。為了探索噬病毒體以及噬病毒體與其宿主巨病毒間的調(diào)控模式和進化關(guān)系,本文基于MEME啟動子預(yù)測分析工具,對噬病毒體ORF上游部分序列(包括起始密碼子ATG)中的啟動子模體進行了預(yù)測分析。依據(jù)預(yù)測得到的啟動子模體E值和在基因組上的位置、數(shù)量和長度等信息,共得到17個潛在的啟動子模體。sputnik的模體2和zamilon的模體2都存在一個富含AT的區(qū)域,廣泛分布在基因組上,可能調(diào)控大部分ORF的表達;mavirus啟動子模體中存在TCTA盒子,而ALM啟動子模體中存在ATCT盒子,這兩個模體可能為后期啟動子模體;OLV的模體2、YSLV1和2的模體3、YSLV3的模體1以及YSLV4的模體1和2都存在富含AT的區(qū)域,廣泛存在各基因組上,為各噬病毒體的潛在啟動子模體。該結(jié)果為進一步研究噬病毒體ORF的表達時序及其與宿主巨病毒之間的協(xié)同調(diào)控表達奠定了一定的理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 上海海洋大學(xué)食品學(xué)院;上海水產(chǎn)品加工及貯藏工程技術(shù)研究中心;農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)品貯藏保鮮質(zhì)量安全風(fēng)險評估實驗室(上海);
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助項目(No.41376135) 教育部高等學(xué)校博士點基金(No.20133104110006) 上海市教委科研創(chuàng)新重點項目(No.14ZZ144) 上海市科委工程中心建設(shè)(No.11DZ2280300)
【分類號】：R373
【正文快照】： 3.農(nóng)業(yè)部水產(chǎn)品貯藏保鮮質(zhì)量安全風(fēng)險評估實驗室(上海),上海201306)噬病毒體(virophage)這一新的病毒類型最早在2008年于法國巴黎的一座冷水塔中發(fā)現(xiàn)[1]。因其能伴隨著巨病毒(Giant virus,如mimivirus[1-2]、Organic lake phycodnavirus(OLPV)[3]、Cafeteriaroenbergensis vir

【共引文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 李亞東;寸椺;;巨大病毒的發(fā)現(xiàn)及研究進展[J];生命科學(xué);2014年08期

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 趙霞;通過RNA-seq初步考察銅綠假單胞菌噬菌體PaP3對宿主轉(zhuǎn)錄組的全局性調(diào)控作用[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2013年

2 張航烽;應(yīng)用SELDI-TOF MS質(zhì)譜技術(shù)構(gòu)建臨床常見病原菌蛋白指紋數(shù)據(jù)庫[D];瀘州醫(yī)學(xué)院;2013年

3 張稚蘭;海洋球石藻（Emiliania huxleyi）病毒兩種功能基因的克隆表達及其初步應(yīng)用研究[D];集美大學(xué);2011年

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 ;南極湖中發(fā)現(xiàn)第三種噬病毒體會快速繁殖[J];河南醫(yī)學(xué)研究;2011年02期

2 ;南極湖里發(fā)現(xiàn)第三種噬病毒體[J];水產(chǎn)養(yǎng)殖;2011年07期

3 龔岷;病毒體作為聯(lián)合疫苗的載體[J];國外醫(yī)學(xué).預(yù)防.診斷.治療用生物制品分冊;1996年04期

4 陳巴特爾,劉太平;檢測“3194病毒”的一種方法[J];內(nèi)蒙古民族師院學(xué)報(自然科學(xué)版);1998年01期

5 ;病毒[J];科學(xué)之友;2004年06期

6 楊世誠;病毒正向人類宣戰(zhàn)[J];科學(xué)中國人;1997年Z1期

7 卪俊;朱既明;;一種新的小白鼠病毒的研究 Ⅱ.病毒的生物學(xué)性狀[J];微生物學(xué)報;1956年01期

8 聞玉梅;;新現(xiàn)與再現(xiàn)的病毒及朊毒子[J];國外醫(yī)學(xué)(微生物學(xué)分冊);2002年01期

9 ;納米[J];廣州醫(yī)藥;1994年04期

10 Bror Morein ,Kai Simons ,李建中;用病毒體、分子團和其它蛋白復(fù)合物制備抗包膜病毒亞單位疫苗[J];微生物學(xué)免疫學(xué)譯刊;1987年01期

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 劉霞;南極湖中發(fā)現(xiàn)第三種噬病毒體[N];科技日報;2011年

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本文編號：1281006