本文關(guān)鍵詞：RhD抗體ssDNA適配體結(jié)構(gòu)分析

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【摘要】：目的預(yù)測RhD抗體核酸適配體序列庫中優(yōu)勢適配體,為實(shí)驗(yàn)室驗(yàn)證做準(zhǔn)備。方法對以RhD抗體為目標(biāo)靶分子而篩選出的適配體序列庫做克隆測序;使用ClustalⅩ軟件對陽性克隆子序列做同源性分析;使用DNA folding form在線分析工具對陽性克隆子堿基序列做最小自由能及二級結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果 RhD抗體28個陽性克隆子堿基序列按照基序的不同可分為3個家族,家族1和2中的適配體又可分為不同的亞家族;可形成由2-4個多分支環(huán)組成的二級結(jié)構(gòu),最小自由能在(-7.47--5.09)kcal/mol。結(jié)論 RhD家族1中的亞家族3和4適配體二級結(jié)構(gòu)較為穩(wěn)定,最小自由能較低,是RhD抗體適配體庫中的優(yōu)勢適配體。
【作者單位】： 深圳市血液中心;陜西省血液中心;廣州中醫(yī)藥大學(xué)第二附屬醫(yī)院輸血科;
【基金】：深圳市科技計(jì)劃項(xiàng)目(JCYJ20140403092619633)
【分類號】：R392
【正文快照】： 核酸適配體(Aptamer)是通過指數(shù)富集的配體系統(tǒng)進(jìn)化(Systematic Evolution of Ligands by Exponential Enrichment,SELEX)技術(shù)篩選獲得的單鏈寡核苷酸,可與目標(biāo)靶分子特異性結(jié)合,具有抗體的性質(zhì)[1]。近年來核酸適配體的研究在臨床診斷及靶向藥物研究等方面得以廣泛應(yīng)用[2]。Rh

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本文編號：1247391