中國布魯氏菌分離株REP-PCR基因分型研究與應用
本文關鍵詞:中國布魯氏菌分離株REP-PCR基因分型研究與應用
【摘要】:布魯氏菌病也就是布魯氏菌入侵機體而引發(fā)的傳染病,包括在人和動物之間極易感染,不僅在中國乃至全球都流行的人畜共患病。據(jù)統(tǒng)計全國共有25個省市自治區(qū)都有布魯氏菌病的分布,從1993年到2009年,布魯氏菌病發(fā)病率上升了130倍,嚴重影響了畜牧業(yè)的發(fā)展,一個多世紀以來,該病一直被列為世界性五大獸疫之一。 依據(jù)對宿主偏好性以及培養(yǎng)和生物學特性的不同,傳統(tǒng)的基因分型方法已經(jīng)將布魯氏菌分為9個種19個亞型,包括羊種1、2、3亞型,牛種1、2、3、4、5、6、7、9亞型,豬種1、2、3、4、5亞型,犬種,沙林鼠種,綿羊附睪種,田鼠型,鰭型和鯨型。 本實驗選取了來自我國26個省市自治區(qū)具有代表性的176株布魯氏菌流行株,對菌株來源信息進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計和分析;REP-PCR基因分型方法需要先進行條件摸索,建立布魯氏菌的REP-PCR分型技術;將已經(jīng)建立好的基因分型方法應用于布魯氏菌株鑒別,得出擴增圖譜;將菌株來源分析結果結合REP-PCR基因分型結果得出我國50年代到00年代之間布魯氏菌病的疫情動向和流行規(guī)律,為我國提出合理的防控措施提供依據(jù)。 從菌株來源分析得出我國布魯氏菌50年代流行布魯氏菌羊種3型和牛種1型,60年代流行布魯氏菌羊種2型,70年代流行布魯氏菌牛種6型,80年代流行犬種和牛種3型,90年代流行羊種1型,00年代以后流行羊種3型。 本實驗對影響REP-PCR反應的主要因素進行條件摸索,即模板、酶、引物和退火溫度。模板選擇采用試劑盒提取,在純度和濃度上都能滿足擴增的要求;rTaq酶用于REP擴增具有優(yōu)勢,后兩種酶擴增不出全部的條帶;引物濃度選擇10μM:40℃擴增的結果條帶是最清晰的,最終建立了布魯氏菌REP-PCR分型方法。從布魯氏菌株的聚類結果上看出牛種和羊種的親緣關系很近,部分豬種1型和豬種3型和牛種的關系很近,但羊種和牛種的關系比豬種的關系更近,更具有密切聯(lián)系。犬種和豬種、牛種的關系很近,它們之間存在著密切的關系。 羊種3型分別在50年代和00年代以后出現(xiàn)了兩次流行,50-90年代之間羊種3型感染范圍主要在西部和北部,00年代以后主要在東部、東北部和南部流行,從親緣關系上看東部的感染由北部傳播而來,東北部和南部的感染由西部傳播而來;牛種1型存在兩個分支,內(nèi)蒙古、北京、天津和河南地區(qū)菌株親緣關系近,而安徽、新疆和上海地區(qū)的菌株關系近。60年代以后山西、上海、青海、吉林、河南、山東、新疆陸續(xù)出現(xiàn)羊種2型感染疫情,其傳播動向和羊種3型一致。牛種6型主要流行于70年代,疫情主要范圍在內(nèi)蒙古、黑龍江、寧夏和西藏,黑龍江地區(qū)的菌株比其他地區(qū)的關系較遠。牛種3型80年代前的菌株聚為一支,80年代后的菌株聚為另一支,而80年代前以寧夏地區(qū)為主,80年代以后以內(nèi)蒙古和新疆地區(qū)為主。犬種布魯氏菌病主要流行于我國東部沿海城市,比如上海、江蘇、廣西、山東等地。90年代以羊種1型感染為主,其分離菌株主要出現(xiàn)在80年代以后,以內(nèi)蒙古地區(qū)感染為主
【學位授予單位】:西南大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2013
【分類號】:R378.5
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,本文編號:1163113
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