河西走廊地域分離幽門螺桿菌vacA和cagA基因遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2017-11-07 11:33
本文關(guān)鍵詞:河西走廊地域分離幽門螺桿菌vacA和cagA基因遺傳多樣性分析
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【摘要】:目的: 1.探討河西走廊地域流行幽門螺桿菌(Helicobacter pylori, Hp)重要毒力基因vac A和cagA基因遺傳多樣性和進(jìn)化特征,進(jìn)一步探討當(dāng)?shù)厣舷兰膊「甙l(fā)原因。 2.探討河西走廊胃癌高發(fā)區(qū)患者Hp vacA i區(qū)基因型的分布,為進(jìn)一步研究Hp生物學(xué)特性、致病性和致病機(jī)制、研制有效疫苗打下基礎(chǔ)。方法: 1.采用微需氧培養(yǎng)技術(shù),通過觀察培養(yǎng)特性結(jié)合形態(tài)學(xué)、快速尿素酶、氧化酶和觸酶試驗(yàn),從河西走廊地域上消化道疾病患者胃粘膜分離和鑒定Hp。 2.從河西走廊地域Hp菌株中選取30株,PCR擴(kuò)增Hp vacA和cagA全基因序列,并對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行測序。 3.利用NCBI數(shù)據(jù)庫及MEGA5.1軟件分析河西走廊地域Hp vacA和cagA基因的測序結(jié)果,構(gòu)建遺傳進(jìn)化樹進(jìn)行相似性和進(jìn)化距離分析,分析河西走廊地域Hp vacA和cagA與臨床病理特征及地域的關(guān)系。 4.從河西走廊地域及蘭州市分離的61株Hp菌株中,PCR擴(kuò)增Hp vacA基因i區(qū)(i1、i)。分析不同的vacA i區(qū)基因型與臨床病理特征、年齡以及性別的關(guān)系。結(jié)果: 1.從河西走廊地域的三家醫(yī)院分離出的30株Hp,經(jīng)過PCR擴(kuò)增,成功獲得Hp vacA全基因樣本22份,Hp cagA全基因26份。所有樣本均成功測序,獲得了vacA和cagA全基因序列信息。 2.經(jīng)過同源性分析發(fā)現(xiàn),在建立的進(jìn)化樹中,河西走廊地域分離的Hp vacA進(jìn)化更趨近于處在其右側(cè)的SNT49India、F30Japan、F32Japan等亞洲菌株,進(jìn)化樹的平均進(jìn)化距離為2.53747128;河西走廊地域分離的Hp vacA在進(jìn)化樹中呈集中聚集現(xiàn)象。 3.在建立的進(jìn)化樹中河西走廊地域Hp cagA進(jìn)化更趨近于處在其右側(cè)的F57Japan、F32Japan等亞洲菌株,進(jìn)化樹的平均進(jìn)化距離為4.2434595460;河西走廊地域Hp cagA在進(jìn)化樹中集中聚集,并且cagA分別在張掖、金昌、武威各地聚集。 4.在建立的進(jìn)化樹中vacA和cagA基因的進(jìn)化趨勢與疾病的臨床病理特征不存在明顯相關(guān)性。 5.61株Hp vac A i1和i2型的構(gòu)成比分別為86.89%(53/61)和13.11%(8/61)。vac A i1型在0-40歲、41~60歲年齡組、同性別以及相同病理類型的患者中的感染率均顯著高于vacA i2(P0.05),同型的vacA i1和f2在不同性別、60歲以下各年齡間和不同病理類型患者間感染率無顯著性差別(P0.05)。60歲以上患者中:Hp vac A i2型感染率顯著高于60歲以下各年齡段人群(P0.05)。結(jié)論: 1.河西走廊地域流行Hp菌株vacA和cagA基因在進(jìn)化上更趨同于亞洲株系型。 2.河西走廊地域流行Hp菌株cagA較vac A具有更大的變異性。 3.河西走廊地域Hp菌株vacA和cagA在遺傳進(jìn)化上存在地方聚集性,vacA和cagA進(jìn)化分布與疾病病理類型無關(guān)。 4.河西走廊地域流行Hp菌株vacA i區(qū)基因均為陽性,以i1型為主。 5.河西走廊地域流行Hp vacA i區(qū)基因型分布與患者的疾病類型、性別等無關(guān);Hp vac A i2型感染呈現(xiàn)隨年齡增高而上升的趨勢。
【學(xué)位授予單位】:蘭州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R378
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 楊蘭澤;高靜;米建強(qiáng);謝順清;楊冬梅;;胃癌及癌前病變組織中幽門螺桿菌感染與p53、p21WAF1、PCNA、cyclinA蛋白表達(dá)的相關(guān)性研究[J];實(shí)用癌癥雜志;2007年02期
,本文編號:1152254
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