本文關(guān)鍵詞：多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌整合子分型及流行病學(xué)研究

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【摘要】：鮑曼不動(dòng)桿菌(Acinetobacter baumannii A.ba)是不動(dòng)桿菌屬中最為常見(jiàn)的細(xì)菌,屬于非發(fā)酵菌。它不發(fā)酵葡萄糖、非苛養(yǎng)、不運(yùn)動(dòng)、嚴(yán)格需氧、觸媒陽(yáng)性、氧化酶陰性,為革蘭陰性球桿菌。近年來(lái)已成為醫(yī)院感染的主要病原菌,引起較高的發(fā)病率和死亡率。鮑曼不動(dòng)桿菌廣泛分布于醫(yī)院環(huán)境及人體的呼吸道、血液、胸腔積液、泌尿道、手術(shù)創(chuàng)傷、CNS、皮膚、眼,可引起醫(yī)院獲得性和呼吸機(jī)相關(guān)肺炎、菌血癥、尿路感染、手術(shù)部位的感染,對(duì)于ICU病房的患者更易感和致命。鮑曼不動(dòng)桿菌顯著地特點(diǎn)是對(duì)抗菌藥物耐藥越來(lái)越嚴(yán)重,并在世界范圍內(nèi)傳播和流行。多重耐藥和泛耐藥的鮑曼不動(dòng)桿菌已成為一個(gè)新興的全球公共衛(wèi)生問(wèn)題,其耐藥機(jī)制復(fù)雜,整合子作為耐藥基因的載體使其易于獲取外源性耐藥元件,產(chǎn)生多種耐藥表型。鮑曼不動(dòng)桿菌以克隆傳播方式在世界范圍內(nèi),主要流行克隆為國(guó)際克�、瘛ⅱ�、Ⅲ型。 本研究利用重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院2011.1-2011.12間臨床分離非重復(fù)鮑曼不動(dòng)桿菌189株,通過(guò)對(duì)抗生素耐藥性分析發(fā)現(xiàn),臨床分離的鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)15種檢測(cè)抗生素耐藥率均高于60%。MDR、PDR分別高達(dá)93.3%、38.7%。檢測(cè)抗生素的耐藥率分別是哌拉西林(92.7%)、氨芐西林/舒巴坦(84.5%)、替卡西林/克拉維酸(80.4%)、頭孢他啶(88.7%)、頭孢曲松(90.2%)、頭孢噻肟(92.2%)、頭孢吡肟(93.8%)、亞胺培南(72.2%)、阿米卡星(78.8%)、慶大霉素(81.4%)、妥布霉素(76.8%)、環(huán)丙沙星(89.7%)、加替沙星(62.6%)、左氧氟沙星(67%)和復(fù)方新諾明(81.4%)。值得關(guān)注的是敏感率大于20%的抗生素僅有碳青霉烯類的亞胺培南和氨基糖苷類的妥布霉素,敏感率分別為26.8%和21.1%。 通過(guò)對(duì)鮑曼不動(dòng)桿菌整合子的檢測(cè)與分析,發(fā)現(xiàn)Ⅰ型整合子檢出率為76.2%(144/189)。獲得的條帶大小分別為1.3kb、1.6kb、2kb、2.5kb及3.1kb,經(jīng)過(guò)序列分析發(fā)現(xiàn)五種耐藥基因盒分別為aadA2-HP-dfrA、aacCl-ORF1-ORF2-aadAl、 arr-3-aacA4、dfrA17-aadA5以及aadB-cat-blaOXA10-aadA1。其中aadA2-HP-dfrA型耐藥基因盒所占比例為83.9%(135/161),為本研究鮑曼不動(dòng)桿菌整合子所包括的主要耐藥基因組合形式。Ⅱ型整合子8株樣品中擴(kuò)增得到陽(yáng)性條帶,經(jīng)過(guò)序列分析發(fā)現(xiàn)Ⅱ型整合子所包括的基因?yàn)閜ilR以及sulfate adenylytransferase。未檢測(cè)到Ⅱ型整合子。整合子與耐藥的統(tǒng)計(jì)分析顯示整合子陽(yáng)性與整合子陰性的鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)15種抗生素的耐藥率均呈現(xiàn)顯著性差異(P0.01)。盡管喹諾酮耐受相關(guān)基因并沒(méi)有在整合子耐藥基因盒中檢出,但整合子陽(yáng)性同樣與喹諾酮類藥物高耐藥水平相關(guān)。 對(duì)ICU分離鮑曼不動(dòng)桿菌采用rep-PCR結(jié)合多位點(diǎn)序列分型(MultiLocus Sequence Typing, MLST)的方法進(jìn)行分型。設(shè)定相似性80%為閾值,相似性大于80%的菌株被認(rèn)為是同一菌株,ICU的鮑曼不動(dòng)桿菌可以分為3個(gè)亞群。從3個(gè)亞群中選取代表性菌株,通過(guò)多位點(diǎn)序列分型,確定重慶醫(yī)科大學(xué)附屬第二醫(yī)院ICU主要流行株為international clone2。ICU鮑曼不動(dòng)桿菌分離株耐藥率明顯高于整體A.ba。 通過(guò)本研究明確了重慶地區(qū)鮑曼不動(dòng)桿菌臨床分離株的分子流行病學(xué)特征、耐藥特征、整合子的攜帶情況以及整合子與鮑曼不動(dòng)桿菌耐藥之間的關(guān)系,為鮑曼不動(dòng)桿菌醫(yī)院感染和流行的控制以及鮑曼不動(dòng)桿菌感染抗生素的合理應(yīng)用和減少對(duì)抗生素耐藥提供科學(xué)依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】：鮑曼不動(dòng)桿菌 整合子 耐藥 分子流行病學(xué)
【學(xué)位授予單位】：西南大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號(hào)】：R378
【目錄】：

• 縮略詞表4-8
• 摘要8-10
• Abstract10-12
• 第1章 綜述12-28
• 1.1 鮑曼不動(dòng)桿菌流行與耐藥12-15
• 1.2 鮑曼不動(dòng)桿菌的耐藥機(jī)制15-17
• 1.2.1 對(duì)β-內(nèi)酰胺類抗生素的耐藥機(jī)制15-16
• 1.2.2 對(duì)氨基糖苷類抗生素的耐藥機(jī)制16
• 1.2.3 對(duì)喹諾酮類抗生素的耐藥機(jī)制16
• 1.2.4 對(duì)四環(huán)素類抗生素的耐藥機(jī)制16
• 1.2.5 對(duì)多粘菌素的耐藥機(jī)制16-17
• 1.3 整合子的結(jié)構(gòu)、分類、功能17-24
• 1.3.1 整合子的結(jié)構(gòu)17-18
• 1.3.2 整合子的分類18-19
• 1.3.3 基因盒(gene cassette)19-20
• 1.3.4 基因盒的結(jié)構(gòu)20-21
• 1.3.5 整合子的功能21-23
• 1.3.6 基因盒表達(dá)的調(diào)節(jié)23-24
• 1.3.7 基因盒的表達(dá)24
• 1.3.8 整合子與耐藥的關(guān)系24
• 1.4 鮑曼不動(dòng)桿菌耐藥性與整合子的關(guān)系24-27
• 1.4.1 鮑曼不動(dòng)桿菌I整合子攜帶的耐藥基因及其編碼蛋白24-26
• 1.4.2 鮑曼不動(dòng)桿菌基因組中整合子元件所包含的耐藥基因盒26-27
• 1.5 展望27-28
• 第2章 前言28-29
• 第3章 實(shí)驗(yàn)材料和方法29-35
• 3.1 實(shí)驗(yàn)材料29-31
• 3.1.1 實(shí)驗(yàn)菌株29
• 3.1.2 質(zhì)控菌株29
• 3.1.3 培養(yǎng)基和主要試劑29-31
• 3.1.4 主要儀器31
• 3.2 實(shí)驗(yàn)方法31-35
• 3.2.1 鮑曼不動(dòng)桿菌的分離培養(yǎng)31
• 3.2.2 鮑曼不動(dòng)桿菌的鑒定與藥敏試驗(yàn)31-32
• 3.2.3 鮑曼不動(dòng)桿菌的保存與復(fù)蘇32
• 3.2.4 鮑曼不動(dòng)桿菌基因組的提取32-33
• 3.2.5 鮑曼不動(dòng)桿菌流行病學(xué)特征檢測(cè)33
• 3.2.6 鮑曼不動(dòng)桿菌整合子的檢測(cè)33-34
• 3.2.7 鮑曼不動(dòng)桿菌MLST分型34-35
• 第4章 結(jié)果與分析35-42
• 4.1 鮑曼不動(dòng)桿菌的藥敏結(jié)果35-36
• 4.2 臨床分離鮑曼不動(dòng)桿菌整合子分布與基因盒檢測(cè)36-37
• 4.3 鮑曼不動(dòng)桿菌整合子分布與耐藥表型分析37-38
• 4.4 重癥監(jiān)護(hù)室來(lái)源鮑曼不動(dòng)桿菌分型38-42
• 第5章 結(jié)論與展望42-44
• 5.1 結(jié)論42-43
• 5.1.1 鮑曼不動(dòng)桿菌對(duì)常用抗生素的耐藥性42
• 5.1.2 臨床分離鮑曼不動(dòng)桿菌整合子分布與基因盒分布42
• 5.1.3 鮑曼不動(dòng)桿菌整合子分布與耐藥表型的關(guān)系42
• 5.1.4 ICU鮑曼不動(dòng)桿菌流行、耐藥特征42-43
• 5.2 展望43-44
• 5.2.1 鮑曼不動(dòng)桿菌的耐藥性43
• 5.2.2 鮑曼不動(dòng)桿菌耐藥機(jī)制43
• 5.2.3 鮑曼不動(dòng)桿菌的流行43-44
• 參考文獻(xiàn)44-51
• 致謝51-52
• 在學(xué)期間所發(fā)表和撰寫(xiě)的文章52

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本文編號(hào)：1135832