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GRA24基因在不同地理位置和宿主來源的剛地弓形蟲株間的序列變異(英文)

發(fā)布時(shí)間:2017-11-03 09:04

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【摘要】:目的檢驗(yàn)來自不同地理位置和宿主,且歸屬于不同基因型的剛地弓形蟲的GRA24基因的序列變異情況,評(píng)價(jià)GRA24基因能否作為研究弓形蟲種群遺傳學(xué)的理想標(biāo)記。方法對(duì)所檢剛地弓形蟲的GRA24基因進(jìn)行了序列比對(duì),并使用了最大簡約法,最大似然法以及貝葉斯法對(duì)所檢驗(yàn)的蟲株進(jìn)行了系統(tǒng)進(jìn)化分析。結(jié)果所檢的蟲株GRA24基因的有兩種長度:6 240bp和6 264bp。所檢GRA24基因的A+T含量為40.82%~53.52%。序列比對(duì)顯示有173個(gè)核酸變異位點(diǎn)(0.05%~0.2%),其中有133變異位點(diǎn)個(gè)在9個(gè)內(nèi)含子上,40個(gè)變異位點(diǎn)在8個(gè)外顯子上;使用的3種方法構(gòu)建的GRA24基因系統(tǒng)進(jìn)化樹的結(jié)果一致,GRA24基因不能將3種典型基因型的弓形蟲蟲株區(qū)分開。結(jié)論 GRA24基因的序列變異率較低,所以GRA24基因并不是一個(gè)研究弓形蟲種群遺傳學(xué)的理想標(biāo)記。
【作者單位】: 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院蘭州獸醫(yī)研究所;
【關(guān)鍵詞】剛地弓形蟲 弓形蟲病 GRA 序列變異
【基金】:國家自然科學(xué)基金(No.31228022,31230073,31172316) 甘肅省創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)研究基金(No.1210RJIA06)聯(lián)合資助~~
【分類號(hào)】:R382.5
【正文快照】: Among all phylum apicomplexa parasites,T.gon-garding sequence diversity in GRA24gene has beendii is one of the most successful parasites with apreviously reported.wide range of host,including human[1-3].T.gon-  The objectives 

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4 孔t,

本文編號(hào):1135508


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