本文關鍵詞：2012-2013年湖北省麻疹病毒流行株核蛋白N基因和血凝素蛋白H基因特征分析

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【摘要】：目的分析近年湖北省麻疹病毒流行株基因型別以及血凝素蛋白(H)基因特性。方法對2012-2013年麻疹病毒核酸檢測陽性的患者標本,直接提取核酸,采用one-step逆轉錄—聚合酶鏈反應方法擴增核蛋白(N)和血凝素蛋白(H)基因,測序后進行同源性和進化分析。結果湖北省麻疹病毒流行株主要為H1基因型的H1a亞型,發(fā)現(xiàn)一株D8基因亞型。與中國麻疹疫苗株上海191株的N和H基因比較,其核苷酸同源性分別為91.6%~92.4%和94.6%~94.8%。對湖北省H1a亞型麻疹病毒H基因進化分析發(fā)現(xiàn)均屬lineage 3b,H蛋白序列分析發(fā)現(xiàn)第240和第397位氨基酸分別發(fā)生Ser→Asn、Pro→Leu的變異。運用貝葉斯中的馬爾科夫鏈的蒙特卡洛方法,估計H1a基因亞型H基因核苷酸的平均堿基替代率為7.619×10-4取代/位點/年,估算其共同祖先大約出現(xiàn)在1980年。結論湖北省2012-2013年麻疹病毒流行株主要H1a基因型,僅1例D8亞型;與中國疫苗株滬191株相比較,兩者在基因特性上存在明顯差異,需進一步加強對麻疹病毒基因型別和變異程度的監(jiān)測。
【作者單位】： 湖北省疾病預防控制中心傳染病防治研究所病原微生物檢測中心;
【關鍵詞】： 麻疹病毒 核蛋白 血凝素蛋白 基因進化
【基金】：“十二五”國家科技重大專項(2012ZX10004207) 湖北省醫(yī)學領軍人才培養(yǎng)工程(2014年)
【分類號】：R373.11
【正文快照】： (Chin J Dis Control Prev 2015,19(8):760-764)物學。麻疹是常見的高傳染性急性呼吸系統(tǒng)傳染病,其病原體麻疹病毒(measles virus,MV)屬于副黏病毒科麻疹病毒屬,僅1個血清型。麻疹病毒基因遺傳性較穩(wěn)定,但從20世紀80年代初以來,國內外陸續(xù)發(fā)現(xiàn)新分離的麻疹病毒野毒株,這些野毒

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本文編號：1120007