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布氏菌分離株16SrDNA基因遺傳進化分析

發(fā)布時間:2017-10-22 15:30

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【摘要】:目的檢測內(nèi)蒙古布氏菌臨床分離株的16SrDNA基因序列,構(gòu)建16SrDNA遺傳進化樹,確定該菌株的分類地位。方法用BCSP31-PCR對臨床分離株檢測,再進行16SrDNA雙向測序;從GeneBank下載標準參考菌株和與布氏菌有共同抗原細菌的16SrDNA基因序列;用Mega6.0進行序列比對并構(gòu)建遺傳進化樹。結(jié)果 BCSP31-PCR結(jié)果顯示均有223bp擴增條帶,16SrDNA測序得到單一基因序列;比對后發(fā)現(xiàn)有4處特異片段,經(jīng)Blast比對,位于844-1224包括380bp的片段為布氏菌獨有;進化樹顯示布氏菌臨床分離株與標準菌株聚在1個末端分支上,遺傳距離接近0,無法精細區(qū)分相互關(guān)系;與人蒼白桿菌聚集在1個亞分支上,遺傳距離0.019;與其它試驗菌株如霍亂弧菌、小腸結(jié)腸炎耶爾菌遺傳進化距離較遠,遺傳距離0.02。結(jié)論從遺傳進化角度對布氏菌分離株與標準菌株的親緣關(guān)系進行分析,布氏菌所有種型遺傳距離接近,提示布氏菌16SrDNA為高度保守序列,不宜做遺傳進化分析的靶基因;布氏菌與人蒼白桿菌有較近的親緣關(guān)系;布氏菌屬16SrDNA特有的380bp的基因片段可作為布氏菌快速鑒定的靶序列。
【作者單位】: 內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學獸醫(yī)學院;烏蘭察布市地方病防治中心;中國疾病預防中心傳染病預防控制所傳染病預防控制國家重點實驗室感染性疾病診治協(xié)同創(chuàng)新中心;軍事醫(yī)學科學院軍事獸醫(yī)研究所;
【關(guān)鍵詞】布氏菌 SrDNA 遺傳進化 分析
【基金】:Funded by the Health Scientific Research Project of Health and Family Planing Commission of Inner Mongolia Autonomous Region(No.201301094)
【分類號】:R378
【正文快照】: Funded by the Health Scientific Research Project of Health and Family Planing Commission of Inner Mongolia Autonomous Re-gion(No.201301094)布氏菌病(brucellosis)是由布氏菌引起的人獸共患傳染病,世界范圍廣泛流行,在我國流行的主要是羊、牛種布氏菌;羊種菌造成人

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2 Q,

本文編號:1078995


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