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基于紅系終末期單細胞表達譜構(gòu)建珠蛋白基因共表達網(wǎng)絡(luò)

發(fā)布時間:2021-12-30 04:37
  研究背景:人類紅系分化終末期是紅細胞發(fā)育成熟的關(guān)鍵階段,紅細胞主要在該階段啟動珠蛋白表達,對該階段紅細胞轉(zhuǎn)錄活動的研究有助于深入理解紅細胞成熟過程的轉(zhuǎn)錄組動態(tài)變化以及珠蛋白基因的依賴調(diào)控關(guān)系。近幾年快速發(fā)展的單細胞轉(zhuǎn)錄組研究技術(shù)取得了很大的進展,使得研究者可以深度描述并解析異質(zhì)性組織的細胞組成和基因特征表達,從而有機會從單個細胞水平探索基因之間的調(diào)控關(guān)系。然而目前還沒有體內(nèi)來源的骨髓終末期單細胞測序來揭示細胞的異質(zhì)性組成和珠蛋白基因的依賴調(diào)控關(guān)系。研究目的:本研究以3例成人骨髓CD235a+細胞為基本材料,實施單細胞RNA測序(scRNA-seq),以探究紅系分化終末期的細胞組成和基因表達情況,并在單細胞水平圍繞珠蛋白基因構(gòu)建局部的基因共表達網(wǎng)絡(luò)以發(fā)掘潛在的紅系調(diào)控因子。結(jié)果:經(jīng)單細胞測序一共獲得了 8,668個有效的CD235a+細胞,涵蓋了約15,000個轉(zhuǎn)錄本。細胞的類型鑒定和擬時間分析表明紅細胞終末期分化過程呈連續(xù)狀態(tài),各個細胞類型的數(shù)量為:85個proE細胞,446個basoE細胞,2,185個polyE細胞,5,952 個 orthoE細胞,其中polyE被細分為 tran... 

【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省

【文章頁數(shù)】:85 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于紅系終末期單細胞表達譜構(gòu)建珠蛋白基因共表達網(wǎng)絡(luò)


圖1-2.紅系發(fā)生過程以及細胞變化??Figure?1-2.?Erythropoiesis?and?changes?along?differentiation??

基于紅系終末期單細胞表達譜構(gòu)建珠蛋白基因共表達網(wǎng)絡(luò)


圖1-3.晚幼紅細胞在巨噬細胞的幫助下進行脫核??Figure?1-3.?Erythroblast?enucleation?with?help?of?macrophages??

基于紅系終末期單細胞表達譜構(gòu)建珠蛋白基因共表達網(wǎng)絡(luò)


圖1-5.人體不同發(fā)育時期的珠蛋白表達轉(zhuǎn)換??Figurel-5.?Hemoglobin?switching?in?human?different?development?stage??


本文編號:3557490

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