基于紅系終末期單細(xì)胞表達(dá)譜構(gòu)建珠蛋白基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)
發(fā)布時間:2021-12-30 04:37
研究背景:人類紅系分化終末期是紅細(xì)胞發(fā)育成熟的關(guān)鍵階段,紅細(xì)胞主要在該階段啟動珠蛋白表達(dá),對該階段紅細(xì)胞轉(zhuǎn)錄活動的研究有助于深入理解紅細(xì)胞成熟過程的轉(zhuǎn)錄組動態(tài)變化以及珠蛋白基因的依賴調(diào)控關(guān)系。近幾年快速發(fā)展的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組研究技術(shù)取得了很大的進(jìn)展,使得研究者可以深度描述并解析異質(zhì)性組織的細(xì)胞組成和基因特征表達(dá),從而有機(jī)會從單個細(xì)胞水平探索基因之間的調(diào)控關(guān)系。然而目前還沒有體內(nèi)來源的骨髓終末期單細(xì)胞測序來揭示細(xì)胞的異質(zhì)性組成和珠蛋白基因的依賴調(diào)控關(guān)系。研究目的:本研究以3例成人骨髓CD235a+細(xì)胞為基本材料,實施單細(xì)胞RNA測序(scRNA-seq),以探究紅系分化終末期的細(xì)胞組成和基因表達(dá)情況,并在單細(xì)胞水平圍繞珠蛋白基因構(gòu)建局部的基因共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)以發(fā)掘潛在的紅系調(diào)控因子。結(jié)果:經(jīng)單細(xì)胞測序一共獲得了 8,668個有效的CD235a+細(xì)胞,涵蓋了約15,000個轉(zhuǎn)錄本。細(xì)胞的類型鑒定和擬時間分析表明紅細(xì)胞終末期分化過程呈連續(xù)狀態(tài),各個細(xì)胞類型的數(shù)量為:85個proE細(xì)胞,446個basoE細(xì)胞,2,185個polyE細(xì)胞,5,952 個 orthoE細(xì)胞,其中polyE被細(xì)分為 tran...
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2.紅系發(fā)生過程以及細(xì)胞變化??Figure?1-2.?Erythropoiesis?and?changes?along?differentiation??
圖1-3.晚幼紅細(xì)胞在巨噬細(xì)胞的幫助下進(jìn)行脫核??Figure?1-3.?Erythroblast?enucleation?with?help?of?macrophages??
圖1-5.人體不同發(fā)育時期的珠蛋白表達(dá)轉(zhuǎn)換??Figurel-5.?Hemoglobin?switching?in?human?different?development?stage??
本文編號:3557490
【文章來源】:南方醫(yī)科大學(xué)廣東省
【文章頁數(shù)】:85 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1-2.紅系發(fā)生過程以及細(xì)胞變化??Figure?1-2.?Erythropoiesis?and?changes?along?differentiation??
圖1-3.晚幼紅細(xì)胞在巨噬細(xì)胞的幫助下進(jìn)行脫核??Figure?1-3.?Erythroblast?enucleation?with?help?of?macrophages??
圖1-5.人體不同發(fā)育時期的珠蛋白表達(dá)轉(zhuǎn)換??Figurel-5.?Hemoglobin?switching?in?human?different?development?stage??
本文編號:3557490
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