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基于基因組重測序和基因編輯技術的甌江彩鯉黑斑體色遺傳機制研究

發(fā)布時間:2024-06-30 02:43
  體色是動物最為明顯的表型性狀,具有多種生物學功能,同時也是自然選擇和人工選擇的目標之一。脊椎動物擁有最多的色素類型及圖案,其中又以硬骨魚類的色素模式最為豐富。由于脊椎動物的色素細胞均起源于神經嵴,而神經嵴又涉及到許多種類細胞的發(fā)育,因此研究魚類體色的形成機制以及進化過程,可以為脊椎動物的進化提供深入見解。魚類體色的形成涉及到色素的合成和轉移、色素細胞的分化和遷移等過程,這些生物學活動中涉及到許多調控通路和基因的作用,同時也受到環(huán)境的影響。硬骨魚類中,鯉科魚類是體色類型最為豐富的種群之一。經過多年選育,本實驗室已經建立了4種體色甌江彩鯉的純系,包括“大花”(紅色底色黑色斑塊,RB)、“粉花”(白色底色黑色斑塊,WB)、“全紅”(紅色,WR)和“粉玉”(白色,WW),并且4種體色可以穩(wěn)定遺傳給下一代,這為甌江彩鯉的體色遺傳研究奠定了基礎。為初步探明各體色鯉的進化關系,篩選與鯉體色相關的候選基因,以及體色相關基因的調控作用,本論文以上述4種體色甌江彩鯉、興國紅鯉、荷包紅鯉及野鯉為實驗材料,利用基因組重測序技術挖掘鯉的體色相關基因,并通過基因編輯技術,驗證這些基因的功能,相關研究成果如下:1....

【文章頁數】:99 頁

【學位級別】:博士

【部分圖文】:

圖1-16種色素細胞注:A為黑色素細胞,B為黃色素細胞,C為藍色素細胞,D為虹彩色素細胞,E為紅色素細胞,F為白色素細胞

圖1-16種色素細胞注:A為黑色素細胞,B為黃色素細胞,C為藍色素細胞,D為虹彩色素細胞,E為紅色素細胞,F為白色素細胞

上海海洋大學博士學位論文2性條紋形成的關鍵,許多細胞表面分子與信號系統是這些交互作用的介質[25-29]。這些研究都為魚類體色研究提供了重要的生物學信息。圖1-16種色素細胞注:A為黑色素細胞,B為黃色素細胞,C為藍色素細胞,D為虹彩色素細胞,E為紅色素細胞,F為白色素細胞Fig....


圖1-2黑色素合成通路Figure1-2Melaninsynthesispathway

圖1-2黑色素合成通路Figure1-2Melaninsynthesispathway

上海海洋大學博士學位論文3在各類色素的合成機制中,當屬黑色素合成通路的研究最為廣泛和深入。黑色素通路的末端最終合成真黑素和褐黑素,兩種色素之間的比例受到Agouti[35]、MC1R[36]等多種基因的調控。真黑素所占比例越高,呈現的顏色越偏向黑色,褐黑素所占比例越高,顏色越偏向....


圖2-1文庫構建與測序流程

圖2-1文庫構建與測序流程

上海海洋大學博士學位論文13Samtools軟件將比對結果按照染色體位置進行進一步的排序,利用Picard軟件對由于PCR過程中產生的重復reads進行標記,避免影響后續(xù)的變異檢測。圖2-1文庫構建與測序流程Figure2-1Thebasicprcessoflibrarycons....


圖2-27種鯉的主成分分析

圖2-27種鯉的主成分分析

上海海洋大學博士學位論文17Disruptiveinframeinsertion8370.0000Stopretainedvariant3750.0000Downstreamgenevariant3,708,6340.1281Synonymousvariant398,9130.0....



本文編號:3998268

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