目的了解中國大陸腸道病毒71型（EV71）VP1區(qū)基因特征和基因亞型,為更好地預(yù)防和控制兒童感染EV71型手足口病提供參考。方法在GenBank檢索并下載中國大陸1996至2018年全部EV71病毒株（除去重復(fù)序列,共計3 102株）及已知EV71基因亞型參考株（30株）的VP1基因序列,使用MEGA 6.0軟件進(jìn)行比對分析和構(gòu)建種系進(jìn)化樹,分析VP1蛋白氨基酸同源性、遺傳變異情況和基因亞型。結(jié)果 3 102株分離株（不包括參考株）的同源性為88.33%～100.00%,包括參考株的同源性為87.34%～100.00%,與疫苗株H07的氨基酸同源性為93.47%～100.00%,與疫苗株FY7VP5及FY-23K-B的氨基酸同源性均為93.04%～100.00%。2000年起,EV71的流行株以C4亞型為主,2005至2018年以C4a亞型為主,C4b亞型次之,其他亞型散在出現(xiàn)。EV71的VP1區(qū)部分氨基酸變異頻率較高,包括A293S（16.75%）、S283T（15.73%）、A289T（12.44%）、E98K（7.22%）、H22Q（6.66%）、N31D（4.50%）和V249... 

【文章來源】：中華臨床感染病雜志. 2020,13(05)CSCD

【文章頁數(shù)】：6 頁

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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