目的通過生物信息學方法分析基因AL360181.1在結(jié)直腸癌進展及預后中的作用,并進一步預測可能的分子機制。方法從TCGA數(shù)據(jù)庫下載結(jié)直腸癌基因表達數(shù)據(jù)及臨床數(shù)據(jù),應用Perl及R軟件對數(shù)據(jù)整理后篩選出差異表達的基因,進一步對差異基因批量化行生存、獨立預后及臨床病理相關(guān)性分析,選取相關(guān)性最強的差異基因作為目的基因;分析目的基因的表達與結(jié)直腸癌不同臨床病理特征的相關(guān)性及對患者預后的影響;采用R軟件對不同的臨床病理特征行獨立預后分析;分析目的基因以及不同臨床病理與患者生存預后的關(guān)系;應用GSEA對目的基因行KEGG通路富集分析并利用R軟件分析目的基因與潛在靶基因的相關(guān)性,預測目的基因調(diào)控結(jié)直腸癌進展及預后可能的機制。結(jié)果基因AL360181.1在結(jié)直腸癌組織中顯著高表達（P<0.01）;AL360181.1與結(jié)直腸癌的分級、TNM分期具有相關(guān)性（P<0.05）;基因AL360181.1、年齡、腫瘤分級、TNM分期與患者預后相關(guān)（P<0.05）,且基因AL360181.1及年齡可作為評價患者預后的獨立風險因子;基因AL360181.1的表達水平、患者年齡、分級及TNM分期與... 

【文章來源】：西安交通大學學報(醫(yī)學版). 2020,41(05)北大核心CSCD

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【部分圖文】：

TCGA數(shù)據(jù)庫中基因AL360181.1在結(jié)直腸癌中的差異表達

分析不同臨床病理特征與基因AL360181.1表達之間的關(guān)系,結(jié)果顯示,基因AL360181.1的表達與患者腫瘤分級、TNM分期呈正相關(guān)(P<0.05),與患者年齡、性別無關(guān)(P>0.05,圖2)。推測基因AL360181.1可作為調(diào)節(jié)結(jié)直腸癌進展并影響患者預后的潛在靶標。2.4 臨床病理特征獨立預后分析情況

對各臨床病理特征進行單因素獨立預后分析的結(jié)果顯示,基因AL360181.1、年齡、分級及TNM分期與患者預后相關(guān)(P<0.05),患者性別與預后無關(guān)(P=0.653,圖3A);對各臨床病理特征的多因素獨立預后分析結(jié)果顯示,基因AL360181.1、年齡可作為評價患者預后的獨立危險因子(圖3B)。以上結(jié)果提示,基因AL360181.1可作為調(diào)節(jié)結(jié)直腸癌進展及預后的潛在靶標。2.5 生存分析結(jié)果


本文編號：3508013