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中國鵝掌楸纖維素合酶的CRISPR/Cas9基因敲除系統(tǒng)的gRNA表達(dá)載體構(gòu)建

發(fā)布時間:2021-11-20 11:01
  CRISPR/Cas系統(tǒng)最早發(fā)現(xiàn)于細(xì)菌,對入侵的病毒或噬菌體DNA具有免疫作用。基于CRISPR/Cas的免疫機(jī)制,設(shè)計開發(fā)的CRISPR/Cas9基因編輯系統(tǒng)已經(jīng)成為真核生物基因編輯的主流工具,在擬南芥、水稻等高等植物的基因組功能研究中已經(jīng)廣泛應(yīng)用。本研究以中國鵝掌楸纖維素合酶(Cellulose synthase,CESA)為研究對象,首次構(gòu)建了具有表達(dá)中國鵝掌楸纖維素合酶(Cellulose synthase,CESA)gRNA(guide RNA)的CRISPR/Cas9基因敲除系統(tǒng),以LcCESA1基因外顯子5’端的第一個外顯子區(qū)域的GN19NGG序列設(shè)計gRNA引物;以p201N-Cas9為載體,Gibson Assembly誖Master Mix為連接酶,通過Gibson Assembly連接技術(shù),將CESA1-gRNA連入p201N-Cas9中,獲得p201N-Cas9-CESA1-gRNA載體。根據(jù)載體中插入序列,設(shè)計了兩對檢測引物,經(jīng)PCR鑒定,均獲得了相應(yīng)大小的序列;測序分析進(jìn)一步證實確認(rèn)gRNA已經(jīng)完整準(zhǔn)確地連入載體。p201N-Cas9-CESA1-gRNA載... 

【文章來源】:分子植物育種. 2017,15(06)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:5 頁

【部分圖文】:

中國鵝掌楸纖維素合酶的CRISPR/Cas9基因敲除系統(tǒng)的gRNA表達(dá)載體構(gòu)建


重組質(zhì)粒及其PCR檢測電泳分析

堿基序列,載體,纖維素合酶,中國鵝掌楸


(hairpin)的部分堿基序列重疊。表1所用引物序列Table1Theprimersequences引物序列(5'-3')Primersequences(5'-3')TCAAGCGAACCAGTAGGCTTGAAACGAGTTCGTAATGATTAACTTGCTATTTCTAGCTCTAAAACAATCATTACGAACTCGTTTCACATGCACCTAATTTCACTAGATGTGTGATCGATTACCCTGTTATCCCTAG引物名稱PrimernamegRNA-FgRNA-RUbi3p218(F)ISceIR(R)中國鵝掌楸纖維素合酶的CRISPR/Cas9基因敲除系統(tǒng)的gRNA表達(dá)載體構(gòu)建ExpressionVectorConstructionofCelluloseSynthasegRNAWithCRISPR/Cas9GeneKnockoutSystemofL.chinense圖2p201N-Cas9-CESA1-gRNA載體結(jié)構(gòu)Figure2p201N-Cas9-CESA1-gRNAcarrierstructure2197

電泳分析,PCR檢測,重組質(zhì)粒,纖維素合酶


Cas系統(tǒng)來進(jìn)行基因組的定點編輯(Lietal.,2013;Nekrasovetal.,2013)。但CRISPR/Cas系統(tǒng)在鵝掌楸基因編輯中的應(yīng)用暫時還未見報道。本研究利用克隆獲得中國鵝掌楸(Liriodendronchinense)纖維素合酶1(CESA1)基因序列,設(shè)計CESA1-gRNA,建立一步法獲得表達(dá)gRNA的p201N-Cas9載體,作為后期鵝掌楸纖維素合酶基因編輯研究的載體工具。1結(jié)果與分析1.1PCR檢測本試驗選取對1號單克隆菌液提取的重組質(zhì)粒進(jìn)行PCR擴(kuò)增,用2組引物均可以擴(kuò)增得到相應(yīng)大小的片段,與預(yù)期的條帶大小一致,證實其為陽性重組子(圖1)。1.2測序基因編輯的效率與gRNA序列有關(guān)。將陽性菌液送樣測序,重復(fù)測序3次,證實插入的gRNA序列圖1重組質(zhì)粒及其PCR檢測電泳分析注:M1:DL15000DNAmarker;M2:DL2000DNAmarker;1和2代表p201N-Cas9-CESA1-gRNA質(zhì)粒;3和4分別代表引物1和引物2Figure1RecombinantplasmidanditsPCRdetectionelec-trophoresisanalysisNote:M1:DL15000DNAmarker;M2:DL2000DNAmarker;1and2representedp201N-Cas9-CESA1-gRNAplasmid;3and4representedprimer1andprimer22196

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
[1]鵝掌楸紙漿林種源選擇與生長過程研究[D]. 駱羿.中南林業(yè)科技大學(xué) 2007



本文編號:3507183

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