鼻咽癌差異miRNAs表達譜研究
本文關鍵詞:鼻咽癌差異miRNAs表達譜研究
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【摘要】:[目的]:通過miRNA芯片技術獲得鼻咽癌組織與鼻咽部慢性炎性組織的miRNAs差異表達譜;通過qRT-PCR技術驗證鼻咽癌組織及鼻咽癌細胞中兩個差異miRNAs的表達水平;生物信息學分析兩個差異miRNAs所涉及的信號通路。[方法]:收集鼻咽癌組織及鼻咽部慢性炎性組織,提取RNA,檢測總RNA純度,通過miRNA芯片獲得鼻咽癌組織和鼻咽部慢性炎性組織中差異表達的miRNAs;在鼻咽部慢性炎性組織與鼻咽癌組織,人類永生化鼻咽粘膜上皮細胞NP69、鼻咽癌細胞6-10B、5-8F、CNE1、CNE2中,通過qRT-PCR技術檢測miR-205和miR-34c-3p的表達水平,并與基因芯片結果進行比較;生物信息學分析獲得的差異miRNAs所涉及的信號通路。[結果]:1.通過miRNA基因芯片獲得了鼻咽癌的差異miRNAs表達譜,芯片結果顯示了133個差異表達的miRNAs,其中鼻咽癌組織中下調的miRNAs有31個,上調的miRNAs有102個,其中,miR-205的上調倍數(shù)最大,miR-34c-3p的下調倍數(shù)最大。2.miR-205、miR-34c-3p在鼻咽癌組織和鼻咽部慢性炎性組織中的表達的相差倍數(shù)分別是5.458和-3.098倍,qRT-PCR與基因芯片結果方向一致。3.miR-205在不同分化和轉移的鼻咽癌細胞中,其表達水平高于NP69細胞,差異具有顯著性意義(p0.01)。miR-205表達水平在高轉移細胞株5-8F中高于低轉移細胞株6-10B,在低分化細胞株CNE2中高于高分化細胞株CNE1(p0.01)。4.miR-34c-3p在不同分化和轉移的鼻咽癌細胞中,其表達水平低于NP69細胞,差異均有顯著性意義(p0.01)。miR-34c-3p表達水平在高轉移細胞株5-8F和低轉移細胞株6-10B中表達水平無顯著性差異(p0.05),在低分化細胞株CNE2中高于高分化細胞株CNE1(p0.01)。5.差異miRNAs調控的靶基因當中,所涉及到的信號通路主要包括:MAPK,Focaladhesion,Insulin,Neurotrophin,ErbB,Axonguidance。其中,MAPK信號通路與鼻咽癌發(fā)生發(fā)展關系密切。[結論]:1.獲得鼻咽癌組織和鼻咽部慢性炎性組織中差異表達的miRNAs表達譜,其中上調的有102個,下調的有31個。2.miR-205和miR-34c-3p的表達水平在鼻咽癌組織與細胞中的表達水平與基因芯片所獲得的結果方向一致,芯片結果是可靠的。3.miR-205的上調與miR-34c-3p的下調在鼻咽癌的發(fā)生發(fā)展中起了重要作用。4.miR-205表達與鼻咽癌分化和轉移有關,miR-34c-3p表達與鼻咽癌分化有關,而和轉移無關。
【關鍵詞】:鼻咽癌 miRNA 差異表達譜 miR-205 miR-34c-3p
【學位授予單位】:南華大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:R739.63
【目錄】:
- 摘要5-7
- Abstract7-10
- 主要縮略英文索引10-14
- 第1章 前言14-18
- 1.1 鼻咽癌發(fā)病與診療現(xiàn)狀14
- 1.2 miRNA與腫瘤關系14-15
- 1.3 差異miRNAs芯片在腫瘤研究中作用15-16
- 1.4 研究內容16-18
- 第2章 材料與方法18-28
- 2.1 材料18-21
- 2.2 實驗方法21-28
- 第3章 結果28-46
- 3.1 鼻咽癌組織和鼻咽部慢性炎性組織的總RNA的抽提過程28-29
- 3.2 基因芯片檢測差異表達miRNAs29-33
- 3.3 qRT-PCR檢測miR-205,miR-34c-3p在組織中的表達水平33-34
- 3.4 qRT-PCR檢測miR-205,miR-34c-3p在細胞中的表達水平34-38
- 3.5 差異表達miRNAs的生物信息學分析38-46
- 第4章 討論46-50
- 4.1 miRNA在鼻咽癌中的研究現(xiàn)狀46-47
- 4.2 miR-205與鼻咽癌的關系47-48
- 4.3 miR-34c-3p的研究進展48
- 4.4 差異miRNAs的功能分析48-50
- 第5章 結論50-52
- 參考文獻52-58
- 文獻綜述58-66
- 參考文獻62-66
- 攻讀學位期間的科研成果66-68
- 致謝68-70
- 附表70-75
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1 ;Impact of tiny miRNAs on cancers[J];World Journal of Gastroenterology;2007年04期
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6 William CS CHO;南娟;;miRNAs作為癌癥預測和預后標志物的巨大潛能[J];中國肺癌雜志;2013年01期
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9 Wen Luo,;Qinghua Nie;Xiquan Zhang;;MicroRNAs Involved in Skeletal Muscle Differentiation[J];遺傳學報;2013年03期
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4 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];2011醫(yī)學科學前沿論壇第十二屆全國腫瘤藥理與化療學術會議論文集[C];2011年
5 任波;馬迪;李毅;;地高辛標記探針結合化學發(fā)光技術快速靈敏檢測植物總RNA中的miRNAs方法[A];中國植物病理學會2005年學術年會暨植物病理學報創(chuàng)刊50周年紀念會論文摘要集[C];2005年
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8 ;Bioinformatic identification and expression analysis of new microRNAs from Medicago truncatula[A];華東六省一市生物化學與分子生物學會2008年學術交流會論文摘要匯編[C];2008年
9 ;Cell-free miRNAs may indicate diagnosis and docetaxel sensitivity of tumor cells in malignant effusions[A];中華醫(yī)學會腫瘤學分會第七屆全國中青年腫瘤學術會議——中華醫(yī)學會腫瘤學分會“中華腫瘤 明日之星”大型評選活動暨中青年委員全國遴選論文匯編[C];2011年
10 ;miRNAs involved in Tau expression of BMSCs induced neurons[A];中國神經(jīng)科學學會第九屆全國學術會議暨第五次會員代表大會論文摘要集[C];2011年
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,本文編號:571679
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