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基因表達(dá)譜在甲狀腺乳頭狀癌的診斷與鑒別診斷中的應(yīng)用

發(fā)布時(shí)間:2017-07-18 22:17

  本文關(guān)鍵詞:基因表達(dá)譜在甲狀腺乳頭狀癌的診斷與鑒別診斷中的應(yīng)用


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【摘要】:[目的] 利用基因芯片檢測(cè)甲狀腺乳頭狀癌組織、相應(yīng)癌旁組織、頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性甲狀腺乳頭狀癌組織、肺腺癌及相應(yīng)癌旁組織的共同基因表達(dá)和差異基因表達(dá)。尋求甲狀腺乳頭狀癌具有特征性或相對(duì)特征性的表達(dá)基因,探討基因表達(dá)譜在甲狀腺乳頭狀癌病理診斷與鑒別診斷中的應(yīng)用。[方法] 選取昆明醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院外科手術(shù)切除標(biāo)本,術(shù)中冰凍及術(shù)后病理進(jìn)一步確診。共甲狀腺乳頭狀癌6例、相應(yīng)癌旁組織6例、頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性甲狀腺乳頭狀癌2例、肺腺癌8例及相應(yīng)癌旁組織8例。用Trzol提取相應(yīng)組織的RNA,合成cDNA探針,再與含41000個(gè)基因的微陣列雜交,篩選表達(dá)倍數(shù)≥3倍及P-value≤0.05的數(shù)據(jù)作為差異表達(dá)基因。[結(jié)果] 甲狀腺乳頭狀癌與相應(yīng)癌旁組織比較,共有差異表達(dá)基因2255個(gè),其表達(dá)上調(diào)基因1481個(gè),表達(dá)下調(diào)基因774個(gè);其中上調(diào)的有MMP13、MMP11、RETN、 SYT12、CLDN10、 COL1A1、NKX3-2、NMU、LAMB3、THBS4、SFTPB、ZNF469、EREG、 RETN、DPP4、LIPH、ALPK2、CSTA、STMN2、ASPN等,下調(diào)的有TSG101、RN7SK、 CUX2、EDN3、DIRAS2、HBB、MLN、WSCD2、MATN2、MT1G、LRRC7、GPR83、TFF3、 UNC5A、HBG1、TFCP2L1、AQP4、BMP8A、GPR158、LRRC2、FAT3等。頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性甲狀腺乳頭狀癌與癌旁組織比較,共有差異表達(dá)基因12691個(gè),其表達(dá)上調(diào)基因5640個(gè),表達(dá)下調(diào)基因7051個(gè);其中上調(diào)的有MAGEA6、HMGA2、SPINK1、EDN2、 BPIFA1、AGR3、GSTT1、MMP1、MMP10、KRT (7,8,18,6A,6B)、RUNX1等,下調(diào)的有RPS4Y1、DAPL1、SFTPC、CYP2B6、KAL1、KRT6C等。肺腺癌組織與相應(yīng)癌旁組織比較,共有差異基因表達(dá)3790個(gè);其表達(dá)上調(diào)1917個(gè),表達(dá)下調(diào)1873個(gè);其中上調(diào)的有MAGEA6、HMGA2、SPINK1、EDN2、MAGEA2B、CTSE、CTAGIA、GSTT1等,下調(diào)的有RPS4Y1、DDX3Y、DAPL1、HBD、SFTPC、AGER、CYP2B6、SFTPA2等。甲狀腺乳頭狀癌與肺腺癌比較,得出甲狀腺乳頭狀癌特異或相對(duì)特異性差異表達(dá)基因976個(gè),其表達(dá)上調(diào)基因476個(gè),表達(dá)下調(diào)基因500個(gè);其中上調(diào)的有ECT2L、C7orf34、GPR62、MGEA5、SAMD4A、SYN2、FGF6、ORC6、PTPN6、MFNG、 DEFB103B、LOC100130920、EFCAB10、SLC10Al等,下調(diào)的有HEBP1、NPIPB15、DID01、 HCFC2、ZNF311、UFC1、SLFN12、SLC2A9、MTHFD2L、NBAS、NDNF、GPC5、CAT、 TOMM70A等。根據(jù)GO分析,具有甲狀腺乳頭狀癌器官特異性或相對(duì)特異性基因有EMP2、TRIM14、TIMP3、GALNT11、PTGIS、COL11A1、ZC3H7B、ARHGAP33、PGPEPIL、 PGPEP1L等。[結(jié)論] 甲狀腺乳頭狀癌和相應(yīng)癌旁組織存在差異基因表達(dá),頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性甲狀腺乳頭狀癌與甲狀腺乳頭狀癌相應(yīng)癌旁組織比較存在差異表達(dá)基因。這些甲狀腺乳頭狀癌與頸部淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移性甲狀腺乳頭狀癌各自得到的差異表達(dá)基因再比較,所得到共同表達(dá)基因,結(jié)合GO分析。尋求具有甲狀腺乳頭狀癌特異性或相對(duì)特異性基因的共同基因,為甲狀腺乳頭狀癌診斷提供了依據(jù),也為轉(zhuǎn)移性甲狀腺乳頭狀癌定位診斷提供了客觀的指標(biāo)。且甲狀腺乳頭狀癌與肺腺癌組織的比較存在基因差異表達(dá),這為甲狀腺乳頭狀癌與肺腺癌的鑒別診斷提供了依據(jù),也為與其他腫瘤相區(qū)別及不明原發(fā)灶轉(zhuǎn)移性腫瘤的鑒別診斷提供了新方法和思路。
【關(guān)鍵詞】:甲狀腺乳頭狀癌 肺腺癌 基因芯片 基因表達(dá)譜
【學(xué)位授予單位】:昆明醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R734.2
【目錄】:
  • 英文縮略詞5-6
  • 中文摘要6-8
  • 英文摘要8-11
  • 引言11-13
  • 材料與方法13-22
  • 結(jié)果22-41
  • 討論41-48
  • 結(jié)論48-49
  • 參考文獻(xiàn)49-54
  • 綜述54-62
  • 參考文獻(xiàn)59-62
  • 發(fā)表文章62-63
  • 致謝63

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

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2 張曉霞;費(fèi)軍偉;叢云鳳;任麗群;李相軍;;Prostasin基因在卵巢癌組織中的表達(dá)及其意義[J];中國婦幼保健;2008年36期

3 ;Down-regulation of miR-622 in gastric cancer promotes cellular invasion and tumor metastasis by targeting ING1 gene[J];World Journal of Gastroenterology;2011年14期

4 顏登國;王國棟;程海玉;;基因芯片技術(shù)分析結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移患者免疫基因表達(dá)的變化[J];中國普外基礎(chǔ)與臨床雜志;2012年11期

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本文編號(hào):560052

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