表皮生長因子受體基因突變檢測方法改進(jìn)及初步應(yīng)用評估
本文關(guān)鍵詞:表皮生長因子受體基因突變檢測方法改進(jìn)及初步應(yīng)用評估
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【摘要】:目的:我們在現(xiàn)有的檢測表皮生長因子受體(EGFR)基因突變的熒光PCR法基礎(chǔ)上做了進(jìn)一步改進(jìn),并開發(fā)出新的試劑盒,本研究將其與直接測序法和A RMS法進(jìn)行對比,驗證該試劑盒用于臨床診斷的敏感性、特異性和準(zhǔn)確性。方法:收集2013年6月至2015年8月手術(shù)確診的141例非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)的FFPE組織標(biāo)本。采用盲法分別使用直接測序法、ARMS法和新試劑盒檢測EGFR突變,比較新試劑盒與其他兩種檢測方法的差異,結(jié)果不一致時采用三種方法分別重復(fù)檢驗一次。結(jié)果:三種方法檢測成功率均為100%,新試劑盒與直接測序法測得結(jié)果完全一致的比率達(dá)75.9%(107/141),在直接測序法測得的96例突變陽性中,92例在新試劑盒檢測中得到驗證(95.8%)。而直接測序法顯示突變陰性的45例中,新試劑盒檢測發(fā)現(xiàn)了23例突變陽性,兩種檢測方法的結(jié)果存在統(tǒng)計學(xué)差異(X2=40.745,p0.05)。以直接測序法為金標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行比較,新試劑盒檢測EGFR突變的敏感性、特異性分別為95.8%、48.9%,陽性預(yù)測值、陰性預(yù)測值分別為80.0%、84.6%,檢測準(zhǔn)確度為80.9%。新試劑盒與ARMS檢測法比較,測得結(jié)果完全一致的比率達(dá)84.4%(119/141),兩者的一致性比較好(k=0.749,p0.05)。結(jié)論:改進(jìn)后的試劑盒在技術(shù)上較好地控制了檢測結(jié)果的假陽性和假陰性,該檢測方法較直接測序法具有更好的敏感性和準(zhǔn)確性,與現(xiàn)有的ARMS法一致性較高。
【關(guān)鍵詞】:表皮生長因子受體 非小細(xì)胞肺癌 基因突變 直接測序法 擴增阻滯突變系統(tǒng)
【學(xué)位授予單位】:南華大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號】:R734.2
【目錄】:
- 中文摘要4-5
- Abstract5-7
- 主要縮略詞中英文索引7-9
- 前言9-12
- 第1章 實驗材料與方法12-16
- 第2章 實驗結(jié)果16-22
- 第3章 討論22-26
- 第4章 結(jié)論26-28
- 參考文獻(xiàn)(REFERENCES)28-32
- 綜述:表皮生長因子受體基因突變的臨床意義及檢測方法的研究進(jìn)展32-46
- 參考文獻(xiàn)39-46
- 攻讀碩士學(xué)位期間完成、發(fā)表論文情況46-48
- 致謝48
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,本文編號:554698
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