基于SNP的SMAD7基因?qū)ξ赴┮赘行缘挠绊懷芯?/H1>
發(fā)布時間：2017-07-06 20:01
本文關(guān)鍵詞：基于SNP的SMAD7基因?qū)ξ赴┮赘行缘挠绊懷芯?/strong>
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【摘要】：胃癌是源自胃粘膜上皮細(xì)胞的惡性腫瘤,是全球范圍內(nèi)最常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率及死亡率在全球范圍內(nèi)一直居高不下。胃癌病例分布具有明顯的地域性及性別差異：北美、歐洲、非洲屬于低發(fā)地區(qū),亞洲則屬于胃癌的高發(fā)地區(qū),其發(fā)病率及死亡率的男女比例約為2：1。胃癌的病因現(xiàn)遠(yuǎn)未完全闡明,但普遍認(rèn)為多種因素的綜合影響在導(dǎo)致胃癌發(fā)生上起到重要作用。其中影響個體胃癌易感性的重要因素來自于個體的遺傳基礎(chǔ)。近年來,疾病易感單核苷酸多態(tài)性(SNP)受到了相當(dāng)?shù)年P(guān)注,包括胃癌。Smad7是轉(zhuǎn)化生長因子-β (TGF-β)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的抑制元件,可選擇性抑制TGF-β信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。已有的研究報道顯示,TGF-β信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的異常同胃腸道腫瘤的發(fā)生有關(guān)。因此,Smad7被認(rèn)為是包括胃癌在內(nèi)的消化系統(tǒng)腫瘤的一個候選基因。關(guān)于SMAD7基因上的多態(tài)性位點與胃癌相關(guān)的研究已見有報道,但在在不同地區(qū)人群當(dāng)中的基因型分布頻率不一致,易感性表現(xiàn)也存在差異。但目前尚缺乏云南人群的數(shù)據(jù)。故本研究期望基于SMAD7基因SNP數(shù)據(jù)的研究分析,評估SMAD7基因遺傳多態(tài)與云南人群胃癌的關(guān)聯(lián)性。本研究選取采集自云南省第一人民醫(yī)院的250例病例樣本和240例正常對照樣本納入研究,所有個體均為漢族。在酚氯仿法提取總DNA后,用PCR-RFLP方法對SMAD7基因的5個標(biāo)簽SNPs進(jìn)行基因型分型及等位基因、基因型與胃癌之間的logistic關(guān)聯(lián)回歸分析。結(jié)果顯示：SMAD7基因rs11874392、rs1316447多態(tài)位點可能與云南地區(qū)漢族人群胃癌的發(fā)病具有相關(guān)性。其中,尤其rs1316447位點值得進(jìn)一步關(guān)注：rs1316447的等位基因頻率和基因型頻率在胃癌病例組和對照組之間存在統(tǒng)計學(xué)差異,其突變型T等位基因表現(xiàn)出顯著的胃癌風(fēng)險易感：特別在性別分層后,其等位基因頻率和基因型頻率在男性中統(tǒng)計學(xué)差異顯著,表現(xiàn)出與男性胃癌發(fā)病的明顯相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】：胃癌 SMAD7基因 單核苷酸多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】：云南大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R735.2
【目錄】： - 摘要3-4
- Abstract4-6
- 一、引言6-16
- 1 胃癌的概述6-13
- 2 單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism, SNP)及其研究方法13-16
- 3 本研究的目的及意義16
- 二、實驗材料16-18
- 2.1 主要儀器及耗材16-17
- 2.2 主要試劑17
- 2.3 樣本采集17-18
- 三、實驗方法18-23
- 3.1 石蠟切片DNA的提取18
- 3.2 DNA標(biāo)化18
- 3.3 目標(biāo)SNPs的選取18-19
- 3.4 PCR-RFLP方法檢測SNPs19-22
- 3.5 統(tǒng)計分析22-23
- 四、結(jié)果23-44
- 1 胃癌病例組與對照組SNP位點基因型和等位基因頻率分析結(jié)果23-30
- 2 胃癌病例組和對照組SMAD7基因5個SNPs位點不同遺傳模型分析結(jié)果30-44
- 五、討論44-46
- 參考文獻(xiàn)46-49
- 致謝49
【相似文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 湯麗霞;楊光;譚家駒;;Smad7抑制肝星狀細(xì)胞膠原蛋白表達(dá)[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報;2009年10期
2 王丹茹,劉偉,武曉莉,吳娟娟,陸峻泓,劉德莉,曹誼林,張滌生;人Smad7腺病毒表達(dá)載體的構(gòu)建及體外表達(dá)[J];生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)雜志;2005年04期
3 包柳郁,牛忠英,史俊南,汪平;細(xì)胞內(nèi)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)分子——Smad7在人牙胚發(fā)育中的表達(dá)和意義[J];華西口腔醫(yī)學(xué)雜志;2003年06期
4 馬立彬;劉麗蓉;劉曉城;徐鋼;曾銳;何曉峰;劉蔚;;MG132對TGF-β1誘導(dǎo)的人腎小管上皮細(xì)胞Smad泛素化調(diào)節(jié)因子2和Smad7的影響[J];中華腎臟病雜志;2006年12期
5 何朝生;史偉;劉雙信;梁馨苓;葉智明;章斌;;轉(zhuǎn)化生長因子β及Smad7在原發(fā)性腎小球疾病中的作用[J];中華腎臟病雜志;2006年12期
6 陳潔,董戴玉,楊鏡明,周欣;Smad7在人慢性髓細(xì)胞白血病細(xì)胞株K562中的表達(dá)[J];臨床血液學(xué)雜志;2005年04期
7 孫遼;;基因轉(zhuǎn)染Smad7對高糖介導(dǎo)大鼠腎小管上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)分化的影響[J];中國預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2008年11期
8 王琳,鄧躍毅,陳以平;Smad7對TGF-β/Smad信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的調(diào)節(jié)及其在腎纖維化中的作用[J];第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報;2004年02期
9 任韞卓;段惠軍;史永紅;高峰;曹延萍;;p-Smad2/3、Smad7在大鼠實驗性腎間質(zhì)纖維化模型中的表達(dá)[J];基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床;2006年08期
10 孫遼;孫惠力;李曉艷;王向陽;陳文芳;駱寧;孫艷艷;董秀清;余學(xué)清;;Smad7對終末期糖基化產(chǎn)物介導(dǎo)大鼠腎小管上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)分化及Ⅰ型膠原合成的影響[J];中華內(nèi)分泌代謝雜志;2007年06期
中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條
1 陳海勇;黃曉茹;柳飛;付平;Rainer L.Heuchel;A.J.Szalai;鐘志剛;藍(lán)輝耀;;Smad7在糖尿病腎病的保護(hù)和治療作用[A];中國生理學(xué)會第十一屆張錫鈞基金全國青年優(yōu)秀生理學(xué)學(xué)術(shù)論文交流及評獎會議綜合摘要[C];2011年
2 林尊文;寧璞;劉德伍;鐘世鎮(zhèn);;粉防己堿對Smad7沉默增生性瘢痕成纖維細(xì)胞Smads信號通路的干預(yù)作用[A];第十屆全國藥用植物及植物藥學(xué)術(shù)研討會論文摘要集[C];2011年
3 阮藝華;劉海林;;上調(diào)Smad7基因表達(dá)對肝星狀細(xì)胞生物學(xué)特性的作用[A];中華醫(yī)學(xué)會第七次全國消化病學(xué)術(shù)會議論文匯編（下冊）[C];2007年
4 潘姝;利天增;李葉揚;陳曉東;謝舉臨;徐盈斌;祁少海;;積雪草甙對增生性瘢痕成纖維細(xì)胞增殖與Smad7蛋白的影響[A];第八屆全國燒傷外科學(xué)年會論文匯編[C];2007年
5 孫艷艷;余學(xué)清;黃鋒先;聶靜;李曉燕;駱寧;王涌濤;朱風(fēng)新;;上調(diào)表達(dá)Smad7對大鼠腹膜纖維化的治療作用[A];中華醫(yī)學(xué)會腎臟病學(xué)分會2006年學(xué)術(shù)年會論文集[C];2006年
6 劉果;;益氣活血解毒法對UC患者結(jié)腸粘膜Smad7的影響[A];第二十二屆全國中西醫(yī)結(jié)合消化系統(tǒng)疾病學(xué)術(shù)會議暨消化疾病診治進(jìn)展學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2010年
7 馮麗園;趙宗江;楊美娟;;糖腎寧膠囊對糖尿病腎病大鼠腎臟保護(hù)作用及其對TGF-β1/Smad7信號通路影響的實驗研究[A];第十一屆全國中西醫(yī)結(jié)合腎臟病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2010年
8 朱靜偉;;腎炎方對腎間質(zhì)纖維化實驗大鼠腎組織中ColⅠ和Smad7表達(dá)的影響[A];第三十屆航天醫(yī)學(xué)年會、第十三屆航天護(hù)理年會暨第四屆航天醫(yī)院管理論壇論文匯編[C];2014年
9 馮麗園;趙宗江;張新雪;楊美娟;;糖腎寧膠囊對糖尿病腎病大鼠腎臟保護(hù)作用及其對TGF-β1/Smad7信號通路影響的實驗研究[A];第十一屆全國中西醫(yī)結(jié)合腎臟病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2010年
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 彭衛(wèi)生;上調(diào)表達(dá)Smad7對腹膜纖維化大鼠模型腹膜轉(zhuǎn)運功能的影響及其機(jī)制的研究[D];中南大學(xué);2006年
2 徐國萍;TGF-β1對Smad7基因轉(zhuǎn)染大鼠肺泡Π上皮細(xì)胞表型的影響及其相關(guān)機(jī)制的研究[D];復(fù)旦大學(xué);2007年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 潘祝彬;5-氟尿嘧啶對體外培養(yǎng)瘢痕疙瘩成纖維細(xì)胞Smad7和轉(zhuǎn)化生長因子βⅠ型受體表達(dá)的影響[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2009年
2 許維;Smad7在肝內(nèi)膽管細(xì)胞癌中的表達(dá)及臨床意義[D];華中科技大學(xué);2010年
3 蔡得漢;延遲性上調(diào)Smad7對大鼠腹膜纖維化模型腹膜炎癥的影響[D];南昌大學(xué);2007年
4 徐晶;BMP-7對足細(xì)胞轉(zhuǎn)分化及Smad7表達(dá)的影響[D];青島大學(xué);2013年
5 邵文靜;CD44v6、Smad7在子宮內(nèi)膜異位癥中表達(dá)的研究[D];中南大學(xué);2009年
6 范曉軍;喉鱗癌組織中TGF-β1、TβRⅠ、TβRⅡ和Smad7表達(dá)及相關(guān)研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2010年
7 寧華英;鯉魚湯對阿霉素腎病大鼠腎組織TGF-β1/Smad7信號通路表達(dá)的影響[D];青島大學(xué);2013年
8 張坤揚;復(fù)方云南燈盞花膠囊對慢性腎衰竭大鼠Smad7、CTGF表達(dá)的研究[D];云南中醫(yī)學(xué)院;2014年
9 陳雨;Smad7、C-myc、Cox-2在大腸腫瘤中的表達(dá)及意義[D];川北醫(yī)學(xué)院;2011年
10 張波;TGF-β1，Smad7及TFF1在胃癌及其相應(yīng)正常黏膜組織中的表達(dá)的研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2007年
，
本文編號：527578
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【摘要】：胃癌是源自胃粘膜上皮細(xì)胞的惡性腫瘤,是全球范圍內(nèi)最常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)病率及死亡率在全球范圍內(nèi)一直居高不下。胃癌病例分布具有明顯的地域性及性別差異：北美、歐洲、非洲屬于低發(fā)地區(qū),亞洲則屬于胃癌的高發(fā)地區(qū),其發(fā)病率及死亡率的男女比例約為2：1。胃癌的病因現(xiàn)遠(yuǎn)未完全闡明,但普遍認(rèn)為多種因素的綜合影響在導(dǎo)致胃癌發(fā)生上起到重要作用。其中影響個體胃癌易感性的重要因素來自于個體的遺傳基礎(chǔ)。近年來,疾病易感單核苷酸多態(tài)性(SNP)受到了相當(dāng)?shù)年P(guān)注,包括胃癌。Smad7是轉(zhuǎn)化生長因子-β (TGF-β)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的抑制元件,可選擇性抑制TGF-β信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路。已有的研究報道顯示,TGF-β信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的異常同胃腸道腫瘤的發(fā)生有關(guān)。因此,Smad7被認(rèn)為是包括胃癌在內(nèi)的消化系統(tǒng)腫瘤的一個候選基因。關(guān)于SMAD7基因上的多態(tài)性位點與胃癌相關(guān)的研究已見有報道,但在在不同地區(qū)人群當(dāng)中的基因型分布頻率不一致,易感性表現(xiàn)也存在差異。但目前尚缺乏云南人群的數(shù)據(jù)。故本研究期望基于SMAD7基因SNP數(shù)據(jù)的研究分析,評估SMAD7基因遺傳多態(tài)與云南人群胃癌的關(guān)聯(lián)性。本研究選取采集自云南省第一人民醫(yī)院的250例病例樣本和240例正常對照樣本納入研究,所有個體均為漢族。在酚氯仿法提取總DNA后,用PCR-RFLP方法對SMAD7基因的5個標(biāo)簽SNPs進(jìn)行基因型分型及等位基因、基因型與胃癌之間的logistic關(guān)聯(lián)回歸分析。結(jié)果顯示：SMAD7基因rs11874392、rs1316447多態(tài)位點可能與云南地區(qū)漢族人群胃癌的發(fā)病具有相關(guān)性。其中,尤其rs1316447位點值得進(jìn)一步關(guān)注：rs1316447的等位基因頻率和基因型頻率在胃癌病例組和對照組之間存在統(tǒng)計學(xué)差異,其突變型T等位基因表現(xiàn)出顯著的胃癌風(fēng)險易感：特別在性別分層后,其等位基因頻率和基因型頻率在男性中統(tǒng)計學(xué)差異顯著,表現(xiàn)出與男性胃癌發(fā)病的明顯相關(guān)性。
【關(guān)鍵詞】：胃癌 SMAD7基因 單核苷酸多態(tài)性
【學(xué)位授予單位】：云南大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號】：R735.2
【目錄】：
- 摘要3-4
- Abstract4-6
- 一、引言6-16
- 1 胃癌的概述6-13
- 2 單核苷酸多態(tài)性（single nucleotide polymorphism, SNP)及其研究方法13-16
- 3 本研究的目的及意義16
- 二、實驗材料16-18
- 2.1 主要儀器及耗材16-17
- 2.2 主要試劑17
- 2.3 樣本采集17-18
- 三、實驗方法18-23
- 3.1 石蠟切片DNA的提取18
- 3.2 DNA標(biāo)化18
- 3.3 目標(biāo)SNPs的選取18-19
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- 3.5 統(tǒng)計分析22-23
- 四、結(jié)果23-44
- 1 胃癌病例組與對照組SNP位點基因型和等位基因頻率分析結(jié)果23-30
- 2 胃癌病例組和對照組SMAD7基因5個SNPs位點不同遺傳模型分析結(jié)果30-44
- 五、討論44-46
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- 致謝49
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1 湯麗霞;楊光;譚家駒;;Smad7抑制肝星狀細(xì)胞膠原蛋白表達(dá)[J];南方醫(yī)科大學(xué)學(xué)報;2009年10期
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8 王琳,鄧躍毅,陳以平;Smad7對TGF-β/Smad信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的調(diào)節(jié)及其在腎纖維化中的作用[J];第二軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報;2004年02期
9 任韞卓;段惠軍;史永紅;高峰;曹延萍;;p-Smad2/3、Smad7在大鼠實驗性腎間質(zhì)纖維化模型中的表達(dá)[J];基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)與臨床;2006年08期
10 孫遼;孫惠力;李曉艷;王向陽;陳文芳;駱寧;孫艷艷;董秀清;余學(xué)清;;Smad7對終末期糖基化產(chǎn)物介導(dǎo)大鼠腎小管上皮細(xì)胞轉(zhuǎn)分化及Ⅰ型膠原合成的影響[J];中華內(nèi)分泌代謝雜志;2007年06期
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1 陳海勇;黃曉茹;柳飛;付平;Rainer L.Heuchel;A.J.Szalai;鐘志剛;藍(lán)輝耀;;Smad7在糖尿病腎病的保護(hù)和治療作用[A];中國生理學(xué)會第十一屆張錫鈞基金全國青年優(yōu)秀生理學(xué)學(xué)術(shù)論文交流及評獎會議綜合摘要[C];2011年
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6 劉果;;益氣活血解毒法對UC患者結(jié)腸粘膜Smad7的影響[A];第二十二屆全國中西醫(yī)結(jié)合消化系統(tǒng)疾病學(xué)術(shù)會議暨消化疾病診治進(jìn)展學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2010年
7 馮麗園;趙宗江;楊美娟;;糖腎寧膠囊對糖尿病腎病大鼠腎臟保護(hù)作用及其對TGF-β1/Smad7信號通路影響的實驗研究[A];第十一屆全國中西醫(yī)結(jié)合腎臟病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2010年
8 朱靜偉;;腎炎方對腎間質(zhì)纖維化實驗大鼠腎組織中ColⅠ和Smad7表達(dá)的影響[A];第三十屆航天醫(yī)學(xué)年會、第十三屆航天護(hù)理年會暨第四屆航天醫(yī)院管理論壇論文匯編[C];2014年
9 馮麗園;趙宗江;張新雪;楊美娟;;糖腎寧膠囊對糖尿病腎病大鼠腎臟保護(hù)作用及其對TGF-β1/Smad7信號通路影響的實驗研究[A];第十一屆全國中西醫(yī)結(jié)合腎臟病學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2010年
中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 彭衛(wèi)生;上調(diào)表達(dá)Smad7對腹膜纖維化大鼠模型腹膜轉(zhuǎn)運功能的影響及其機(jī)制的研究[D];中南大學(xué);2006年
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1 潘祝彬;5-氟尿嘧啶對體外培養(yǎng)瘢痕疙瘩成纖維細(xì)胞Smad7和轉(zhuǎn)化生長因子βⅠ型受體表達(dá)的影響[D];安徽醫(yī)科大學(xué);2009年
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4 徐晶;BMP-7對足細(xì)胞轉(zhuǎn)分化及Smad7表達(dá)的影響[D];青島大學(xué);2013年
5 邵文靜;CD44v6、Smad7在子宮內(nèi)膜異位癥中表達(dá)的研究[D];中南大學(xué);2009年
6 范曉軍;喉鱗癌組織中TGF-β1、TβRⅠ、TβRⅡ和Smad7表達(dá)及相關(guān)研究[D];河北醫(yī)科大學(xué);2010年
7 寧華英;鯉魚湯對阿霉素腎病大鼠腎組織TGF-β1/Smad7信號通路表達(dá)的影響[D];青島大學(xué);2013年
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9 陳雨;Smad7、C-myc、Cox-2在大腸腫瘤中的表達(dá)及意義[D];川北醫(yī)學(xué)院;2011年
10 張波;TGF-β1，Smad7及TFF1在胃癌及其相應(yīng)正常黏膜組織中的表達(dá)的研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2007年
，本文編號：527578
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