啟動(dòng)子區(qū)甲基化對(duì)肝癌細(xì)胞miRNA-214表達(dá)及細(xì)胞增殖活性的影響
發(fā)布時(shí)間:2017-07-06 00:02
本文關(guān)鍵詞:啟動(dòng)子區(qū)甲基化對(duì)肝癌細(xì)胞miRNA-214表達(dá)及細(xì)胞增殖活性的影響
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【摘要】:研究目的:研究肝癌細(xì)胞株miRNA-214啟動(dòng)子區(qū)的甲基化狀態(tài)。在不同濃度下,甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑對(duì)其啟動(dòng)子區(qū)甲基化及miRNA-214的影響,進(jìn)一步分析該RNA甲基化抑制對(duì)肝癌細(xì)胞系增殖的影響。研究方法:運(yùn)用生物信息學(xué)在線軟件預(yù)測(cè)miRNA-214啟動(dòng)子區(qū)域及CpG位點(diǎn);提取L0-2、Huh7、HepG2和QSG-7701四種肝細(xì)胞株DNA,通過(guò)亞硫酸氫鹽測(cè)序法(bisulfite-sequencing PCR,BSP)分析該mi-RNA CpG位點(diǎn)的甲基化;使用0umol/L,5umol/L和10umol/L三種不同濃度的甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑(5-Aza-CdR)干擾肝細(xì)胞株啟動(dòng)子區(qū)甲基化,并通過(guò)RT-PCR方法檢測(cè)不同濃度處理組的miRNA-214表達(dá);通過(guò)細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)檢測(cè)以上三種濃度下抑制劑對(duì)肝細(xì)胞增殖的影響。研究結(jié)果:(1)根據(jù)BSP計(jì)算,miRNA-214啟動(dòng)子區(qū)甲基化頻率,未處理組結(jié)果顯示, L0-2、Huh7、HepG2和QSG-7701四種肝細(xì)胞的啟動(dòng)子區(qū)甲基化程度分別為51.42%、80.00%、60.00%和68.57%。與正常肝細(xì)胞(L0-2)比較,肝癌細(xì)胞(Huh7、HepG2和QSG-7701)的miRNA-214啟動(dòng)子區(qū)甲基化程度均明顯升高,差異有明顯差異(F=25.9,p(0.001)。(2)經(jīng)PCR檢測(cè),未處理組4種肝細(xì)胞(L0-2、Huh7、HepG2和QSG-7701)的miRNA-214表達(dá)量分別為2.84±0.52、1.00±0.08、1.00±0.06和1.00±0.12。與正常肝細(xì)胞比較,三種肝癌細(xì)胞的miRNA-214表達(dá)水平較低,結(jié)果具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=35.39,p0.001).在5umol/L和10umol/L兩種濃度下,處理組四種肝細(xì)胞miRNA-214表達(dá)水平分別為1.66±0.06、0.58±0.12、0.73±0.13和0.83_±0.04;1.00±0.29、0.34±0.07、0.10±0.01和0.30±0.06。隨著干擾素濃度升高,四種肝細(xì)胞的miRNA-214表達(dá)水平降低。三個(gè)遞增濃度處理組比較,miRNA-214表達(dá)具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=21.9,p0.001;F=40.5,p<0.001;F=98.1,p<0.001;F=61.6,p0.001)。(3)細(xì)胞增殖實(shí)驗(yàn)中,未處理組4種肝細(xì)胞系(L0-2、Huh7、HepG2和QSG-7701)增殖水平分別為0.18±0.03、0.81±0.61、0.68±0.28和3.79±0.16;在5μmol/L和10μmol/L濃度下,處理組肝細(xì)胞(L0-2、Huh7、 HepG2和QSG-7701)增殖水平為0.17±0.07、1.14±0.76、0.42±0.18和2.70±0.107;0.16±0.04、1.55±0.87、0.37±0.19和0.45±0.37。與正常肝細(xì)胞比較,Huh7細(xì)胞經(jīng)去甲基化處理后細(xì)胞增殖活性增加(F=72.89,p0.05),HepG2細(xì)胞和QSG-7701經(jīng)去甲基化處理后細(xì)胞增殖活性略降低(F=95.36,p0.05;F=381.46,p0.05),差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。研究結(jié)論:通過(guò)BSP計(jì)算,我們發(fā)現(xiàn)3種肝癌細(xì)胞均呈現(xiàn)miRNA-214啟動(dòng)子區(qū)高甲基化。經(jīng)不同濃度甲基化轉(zhuǎn)移酶抑制劑干擾處理,肝癌細(xì)胞miRNA-214啟動(dòng)子區(qū)甲基化顯著下降,miRNA-214表達(dá)水平降低,但是促進(jìn)了肝癌細(xì)胞增殖。我們的結(jié)果證實(shí),DNA甲基化可調(diào)控肝癌細(xì)胞中miRNA-214的表達(dá),進(jìn)一步影響肝癌的進(jìn)展。
【關(guān)鍵詞】:肝癌 啟動(dòng)子 甲基化 miRNA-214
【學(xué)位授予單位】:廣西醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:R735.7
【目錄】:
- 個(gè)人簡(jiǎn)歷3-6
- 英文縮略詞索引6-8
- 摘要8-10
- ABSTRACT10-13
- 前言13-18
- 一、材料與方法18-32
- 1 實(shí)驗(yàn)材料18-21
- 1.1 主要儀器設(shè)備18-19
- 1.2 細(xì)胞19
- 1.3 主要試劑19
- 1.4 常用試劑的配制19-21
- 1.5 生物信息學(xué)分析21
- 2 實(shí)驗(yàn)方法21-31
- 2.1 啟動(dòng)子區(qū)域的生物信息學(xué)分析21-22
- 2.2 細(xì)胞培養(yǎng)22
- 2.3 miRNA-214啟動(dòng)子區(qū)甲基化水平檢測(cè)22-28
- 2.4 miRNA-214的定量檢測(cè)28-31
- 2.5 細(xì)胞增殖活性檢測(cè)31
- 3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理31-32
- 二、結(jié)果32-36
- 1 啟動(dòng)子區(qū)域的生物信息學(xué)分析32-33
- 1.1 CpG島位置32
- 1.2 BSP引物32-33
- 1.3 基因組DNA的提取結(jié)果33
- 2 啟動(dòng)子CpG位點(diǎn)甲基化狀態(tài)分析33-34
- 3 甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑對(duì)啟動(dòng)子甲基化的影響34
- 4 5-Aza-CdR對(duì)不同肝細(xì)胞系miRNA-214表達(dá)水平的影響34-36
- 5 5-Aza-CdR對(duì)不同肝細(xì)胞系細(xì)胞增殖的影響36
- 三、討論36-40
- 1. 去甲基化對(duì)miRNA-214啟動(dòng)子區(qū)甲基化程度的分析38-39
- 2. 去甲基化對(duì)miRNA-214表達(dá)水平的分析39
- 3. 去甲基化對(duì)細(xì)胞增殖活性的分析39-40
- 4. 問(wèn)題與展望40
- 四、結(jié)論40-41
- 參考文獻(xiàn)41-49
- 綜述49-65
- 參考文獻(xiàn)57-65
- 致謝65-66
- 攻讀學(xué)位期間發(fā)表及待發(fā)表的文章66
【相似文獻(xiàn)】
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3 黃勝藍(lán);miRNA-214促進(jìn)胃癌SGC7901/DDP細(xì)胞對(duì)順鉑耐藥及相關(guān)機(jī)制的研究[D];中南大學(xué);2013年
,本文編號(hào):524028
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