基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的大腸癌血、尿代謝譜特征研究
發(fā)布時(shí)間:2017-07-01 05:05
本文關(guān)鍵詞:基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的大腸癌血、尿代謝譜特征研究,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
【摘要】:目的: 通過用高效液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)分別對(duì)大腸癌患者和健康人血液、尿液進(jìn)行檢測,并運(yùn)用多種統(tǒng)計(jì)方法對(duì)所得到的數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,考察存在于大腸癌患者和健康人之間的代謝物差異,尋找與大腸癌相關(guān)的潛在生物標(biāo)記物,同時(shí)檢驗(yàn)這些標(biāo)記物對(duì)區(qū)分大腸癌患者和健康人的準(zhǔn)確性,為尋找大腸癌新的腫瘤標(biāo)志物和藥物靶點(diǎn)提供科學(xué)依據(jù)。 方法: 1、樣本處理:對(duì)血液、尿液樣本進(jìn)行高速離心(14000rpm,5min)等處理,取上清液供高效液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用儀檢測分析,以保證代謝圖譜的完整性。 2、LC-MS分析:采用高效液相色譜飛行時(shí)間質(zhì)譜聯(lián)用儀(HPLC-TOFMS)對(duì)樣本進(jìn)行檢測,獲得大腸癌患者和健康人血液、尿液各樣本的代謝圖譜及數(shù)據(jù)。 3、數(shù)據(jù)分析:運(yùn)用聚類分析(cluster analysis,CA)、主成分分析(principalcomponent analysis,PCA)、偏最小二乘判別分析(partial least square-discriminantanalysis, PLS-DA)、t檢驗(yàn)等統(tǒng)計(jì)方法對(duì)實(shí)驗(yàn)所得到的數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,檢驗(yàn)大腸癌患者和健康人之間的差異代謝,并找出對(duì)區(qū)分兩組貢獻(xiàn)較大的代謝物,同時(shí)檢驗(yàn)這些代謝物對(duì)大腸癌判別的準(zhǔn)確性。 結(jié)果: 1、在血液樣本的研究中,從PCA得分圖(score plot)可以看到大腸癌患者組和健康人組可以分離開,通過t檢驗(yàn)等統(tǒng)計(jì)學(xué)分析在正負(fù)離子模式下一共找到了18個(gè)對(duì)區(qū)分兩組貢獻(xiàn)較大的重要差異代謝物。通過ROC曲線法和均值柱狀圖最終找到了6個(gè)關(guān)鍵差異代謝物作為大腸癌的潛在生物標(biāo)記物,同時(shí)驗(yàn)證了這些生物標(biāo)記物對(duì)區(qū)分大腸癌組與正常組有很高的準(zhǔn)確性和特異性。 2、在尿液樣本的研究中,同樣運(yùn)用PCA法對(duì)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,從得分圖中可以看到大腸癌患者組和健康人組可以分離開,經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)分析在正負(fù)離子模式下共得到了19個(gè)重要差異代謝物。通過ROC曲線法和均值柱狀圖最終找到了8個(gè)關(guān)鍵差異代謝物作為大腸癌的潛在生物標(biāo)記物,同時(shí)驗(yàn)證了這些生物標(biāo)記物對(duì)區(qū)分大腸癌與正常組有很高的準(zhǔn)確性和特異性。 結(jié)論: 本研究用高效液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)分別對(duì)大腸癌患者和健康人血液、尿液進(jìn)行代謝組學(xué)研究,獲得大腸癌患者和健康人的代謝圖譜,運(yùn)用多種統(tǒng)計(jì)學(xué)分析方法分析得到了可作為大腸癌潛在生物標(biāo)記物的代謝物,并通過實(shí)驗(yàn)證明了這些標(biāo)記物對(duì)區(qū)分大腸癌與正常組有很高的準(zhǔn)確性和特異性。同時(shí)本研究證明了代謝組學(xué)是研究癌癥的強(qiáng)有力的工具。
【關(guān)鍵詞】:大腸癌 代謝組學(xué) 高效液相色譜-飛行時(shí)間質(zhì)譜聯(lián)用
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R735.34
【目錄】:
- 前言4-6
- 中文摘要6-8
- ABSTRACT8-13
- 第1章 綜述13-22
- 1.1 代謝組學(xué)概述13
- 1.2 代謝組學(xué)的發(fā)展13
- 1.3 代謝組學(xué)的研究層次13-14
- 1.4 代謝組學(xué)的研究方法14-20
- 1.4.1 樣本的采集14-15
- 1.4.2 樣本的預(yù)處理15
- 1.4.3 樣本的分析方法15-18
- 1.4.4 數(shù)據(jù)處理方法和代謝物分析18-20
- 1.5 代謝組學(xué)在腫瘤診斷中的應(yīng)用20-21
- 1.6 展望21-22
- 第2章 基于 HPLC-TOFMS 大腸癌血液代謝組學(xué)研究22-36
- 2.1 引言22
- 2.2 實(shí)驗(yàn)部分22-26
- 2.2.1 實(shí)驗(yàn)流程圖22-23
- 2.2.2 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器23
- 2.2.3 樣本來源23
- 2.2.4 樣本處理23-24
- 2.2.5 分析條件24-25
- 2.2.6 數(shù)據(jù)處理25
- 2.2.7 生物標(biāo)記物的分析25-26
- 2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果26-33
- 2.3.1 實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組血樣的 LC-MS 總離子流圖26
- 2.3.2 數(shù)據(jù)分析結(jié)果26-30
- 2.3.3 代謝物的結(jié)構(gòu)鑒定30-31
- 2.3.4 關(guān)鍵差異代謝物的發(fā)現(xiàn)31-33
- 2.3.5 尋找差異代謝物相關(guān)代謝路徑33
- 2.4 討論33-34
- 2.5 小結(jié)34-36
- 第3章 基于 HPLC-TOFMS 大腸癌尿液代謝組學(xué)研究36-46
- 3.1 引言36
- 3.2 實(shí)驗(yàn)部分36
- 3.2.1 實(shí)驗(yàn)流程圖36
- 3.2.2 實(shí)驗(yàn)材料、試劑與儀器36
- 3.2.3 樣本來源36
- 3.2.4 樣本處理36
- 3.2.5 分析條件36
- 3.2.6 數(shù)據(jù)處理36
- 3.2.7 生物標(biāo)記物的分析36
- 3.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果36-44
- 3.3.1 實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組尿樣的 LC-MS 總離子流圖36-37
- 3.3.2 數(shù)據(jù)分析結(jié)果37-41
- 3.3.3 代謝物的結(jié)構(gòu)鑒定41-42
- 3.3.4 關(guān)鍵差異代謝物的發(fā)現(xiàn)42-43
- 3.3.5 尋找差異代謝物相關(guān)代謝路徑43-44
- 3.4 討論44-45
- 3.5 小結(jié)45-46
- 第4章 總結(jié)與展望46-47
- 4.1 總結(jié)46
- 4.2 展望46-47
- 參考文獻(xiàn)47-53
- 附表53-63
- 作者簡介及在學(xué)期間所取得的科研成果63-64
- 致謝64
【參考文獻(xiàn)】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 張瑜;高一萌;李文燕;彭慧娟;劉斌;王輝;令狐華;;鳥嘌呤核苷交換因子Dock180與Elmo1在卵巢癌細(xì)胞中的共表達(dá)[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2012年13期
本文關(guān)鍵詞:基于液相色譜質(zhì)譜聯(lián)用技術(shù)的大腸癌血、尿代謝譜特征研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。
本文編號(hào):504633
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