本文關(guān)鍵詞：結(jié)核分枝桿菌FadD3結(jié)構(gòu)與功能的生物信息學(xué)分析

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【摘要】：目的應(yīng)用生物信息學(xué)分析軟件預(yù)測結(jié)核分枝桿菌脂酰輔酶A合成酶(FadD3)氨基酸序列的結(jié)構(gòu)與功能。方法應(yīng)用生物信息學(xué)在線工具NCBI(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/)、Expasy(http://ca.expasy.org/)、SWISSMODEL(http://swissmodel.expasy.org/)、客戶端軟件clustalx等進行多重序列比較、同源性分析、同源模建及蛋白功能活性位點分析;應(yīng)用ProtParam軟件(http://web.expasy.org/protparam)預(yù)測FadD3基因編碼FadD3的蛋白理化性質(zhì);采用最小值進化法(the Minimum Evolution method)構(gòu)建分子進化樹。結(jié)果 FadD3(Mt-FACS)與其他物種的脂酰輔酶A合成酶(FACS)含相同的保守序列及催化活性位點,第174-185氨基酸殘基是AMP結(jié)合部位,也是FadD3的保守區(qū)域;第422-497氨基酸殘基是FACS與底物(脂酸)結(jié)合的部位,亦是結(jié)核分枝桿菌脂酰輔酶A合成酶的C末端。分子進化分析表明結(jié)核分枝桿菌脂酰輔酶A合成酶(Mt-FACS)與睪丸酮叢毛單胞菌脂酰輔酶A合成酶(CtFACS)的進化關(guān)系較近,與黑腹果蠅脂酰輔酶A合成酶(Dm-FACS)的進化關(guān)系較遠。結(jié)論生物信息學(xué)預(yù)測提示FadD3是結(jié)核分枝桿菌脂類代謝及耐藥性研究的潛在靶蛋白。
【作者單位】： 昆明醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院生物化學(xué)與分子生物學(xué)系;昆明醫(yī)科大學(xué)現(xiàn)代教育技術(shù)中心;昆明醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院細胞生物學(xué)與遺傳學(xué)系;
【關(guān)鍵詞】： 結(jié)核分枝桿菌 脂酰輔酶A合成酶 結(jié)構(gòu) 功能 生物信息學(xué)
【分類號】：R378.911
【正文快照】： *?結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis)是引起結(jié)核病(tuberculosis)的病原菌。目前全世界約有1/3的人受到結(jié)核分枝桿菌的感染,每年約有800萬新病例發(fā)生,至少有200萬人死于該病。近年來,由于多耐藥性結(jié)核分枝桿菌菌株的出現(xiàn)和HIV的協(xié)同作用,使得結(jié)核病卷土重來,成為世界

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本文編號：990642