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東北地區(qū)手足口病病毒流行株EV71的分子生物學(xué)研究

發(fā)布時間:2017-10-06 18:25

  本文關(guān)鍵詞:東北地區(qū)手足口病病毒流行株EV71的分子生物學(xué)研究


  更多相關(guān)文章: HFMD EV71 系統(tǒng)進化樹 基因重組


【摘要】:手足口病是近年來多發(fā)于嬰幼兒中的傳染病,它由多種腸道病毒引起,多數(shù)患者癥狀比較輕微,也有少數(shù)患者病情進展迅速,甚至導(dǎo)致死亡。 我們利用Real-Time PCR的方法,將2010年8月至10月里在吉林大學(xué)第一醫(yī)院傳染病科室收集到的253例手足口病患者的咽N子樣本進行檢測,其中196例為腸道病毒陽性患者,感染EV71的患者約占腸道病毒感染總數(shù)的42.8%,其次為CA16感染,約占腸道病毒感染總數(shù)的28.6%。 我們將長春3株EV71病毒株與腸道病毒的其他類型進行全基因組的系統(tǒng)進化樹分析,可以看出長春的EV71流行株與近幾年我國大陸的流行株一樣,均為C4亞型。我們用相同的參考株,對病毒的VP1區(qū)進行了系統(tǒng)進化樹分析,得出的結(jié)果卻與全基因組分析結(jié)果并不相同,這就暗示病毒中出現(xiàn)了基因重組的現(xiàn)象。 為了進一步驗證病毒的基因重組,我們又對長春3株EV71病毒株與其他亞型的腸道病毒進行了相似性和重組分析,發(fā)現(xiàn)在P2和P3區(qū)確實存在著組間和組內(nèi)的重組現(xiàn)象。5’UTR區(qū)的系統(tǒng)進化樹更是與全基因組的系統(tǒng)進化樹有著非常大的不同,,這說明病毒的基因重組與5’UTR區(qū)也有著密切的關(guān)系。 在253例樣本中,我們有22.5%的手足口病患者沒有檢測出腸道病毒感染,結(jié)合5’UTR區(qū)的系統(tǒng)進化樹分析,我們認為導(dǎo)致長春手足口病的病原體,除了最常見的EV71和CA16,還有其他沒有確定的非主流病原體。而確定非EV71和CA16的腸道通用陽性病毒,對未來手足口病流行的預(yù)測、疫苗的研制和治療都具有非常重要的意義。
【關(guān)鍵詞】:HFMD EV71 系統(tǒng)進化樹 基因重組
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R373.9
【目錄】:
  • 前言4-6
  • 摘要6-7
  • Abstract7-11
  • 第1章 緒論11-20
  • 1.1 手足口病的定義及 EV71 的研究概況11-15
  • 1.1.1 手足口病的發(fā)病概況11-13
  • 1.1.2 手足口病的臨床特征及其鑒定診斷13-14
  • 1.1.3 手足口病的預(yù)防及應(yīng)對措施14-15
  • 1.2 腸道病毒 71 型的分子生物學(xué)特征15-20
  • 1.2.1 EV71 的一般特性及基因組結(jié)構(gòu)特征15-17
  • 1.2.2 EV71 的致病性及分子流行病學(xué)17-18
  • 1.2.3 系統(tǒng)進化樹18-20
  • 第2章 實驗研究20-44
  • 2.1 材料和方法20-32
  • 2.1.1 研究對象20
  • 2.1.2 手足口病的診斷標準及病毒感染確診20
  • 2.1.3 試劑盒、工具酶和化學(xué)試劑20-22
  • 2.1.4 主要儀器22
  • 2.1.5 實驗方法22-32
  • 2.2 實驗結(jié)果32-44
  • 2.2.1 腸道病毒的鑒定32-35
  • 2.2.2 分離得到的腸道病毒的分子生物學(xué)35-37
  • 2.2.3 系統(tǒng)進化樹分析及基因重組37-44
  • 第3章 結(jié)論44-46
  • 參考文獻46-50
  • 作者簡介及在學(xué)期間所取得的科研成果50-51
  • 致謝51

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本文編號:984309

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