病毒性腦炎病例中?刹《11型病毒的基因特征分析
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【摘要】:分析?刹《11型(Echovirus 11,ECHO 11)福建龍巖分離株的分子生物學特征。收集龍巖市第一醫(yī)院2011年1~12月臨床診斷為病毒性腦炎或中樞神經(jīng)系統(tǒng)感染的住院病例腦脊液標本進行病毒分離鑒定,從7株經(jīng)血清中和鑒定的ECHO 11分離株中,選取4株測定VP1完整編碼區(qū)序列,與GenBank上已發(fā)表的ECHO 11型病毒VP1區(qū)進行同源性比較及遺傳進化分析。4株ECHO 11分離株VPl區(qū)序列長度為600個核苷酸,編碼200個氨基酸;4株之間的核苷酸同源性為100%,氨基酸同源性為99%~100%;與1953年Gregory原型株之間的核苷酸同源性為75%~76%,氨基酸同源性為90%;與2007年荷蘭株(GU393773)之間核苷酸的同源性為94%~95%,氨基酸同源性為98%~99%,同源性最高;與國內(nèi)2010年山東株之間核苷酸的同源性為74%,氨基酸同源性為88%~89%。系統(tǒng)進化樹分析顯示,4株龍巖分離株同屬D5型,其與D5型病毒株(GU393713)之間核苷酸的同源性為93%,氨基酸同源性為99%。國內(nèi)分離株之間相對較低的相似性提示國內(nèi)ECHO 11病毒可能存在不同的傳播鏈。
【作者單位】: 龍巖市疾病預防控制中心;福建醫(yī)科大學龍巖市疾病預防控制中心教學點;
【關(guān)鍵詞】: 病毒性腦炎 埃可病毒型 基因特征
【基金】:福建省衛(wèi)生廳青年科研課題項目(2012-2-126)
【分類號】:R512.3;R373
【正文快照】: 人腸道病毒(Human enterovirus,HEV)屬小RNA病毒科(Picornaviridae)中腸道病毒屬。?刹《(Echovirus,ECHO)屬于HEV B組,可以引起幾乎所有的HEV性疾病,大多沒有明顯的臨床癥狀,但也可以引起無菌性腦膜炎、手足口病等較為嚴重的疾病[1-5]。ECHO 11是世界各地最常分離出的HEV之
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