本文關(guān)鍵詞：果蠅Tap蛋白結(jié)構(gòu)與功能的生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： Tap蛋白 螺旋-環(huán)-螺旋構(gòu)型 分子結(jié)構(gòu) 計(jì)算生物學(xué) 果蠅 黑腹

【摘要】：目的利用生物信息學(xué)方法分析果蠅Tap蛋白的結(jié)構(gòu)和功能。方法基于NCBI數(shù)據(jù)庫中果蠅Tap蛋白的氨基酸序列,從蛋白質(zhì)理化性質(zhì)、跨膜區(qū)、信號肽、亞細(xì)胞定位、結(jié)構(gòu)域、三維結(jié)構(gòu)及物種間同源蛋白進(jìn)化關(guān)系等方面進(jìn)行分析。結(jié)果Tap蛋白為不穩(wěn)定親水性蛋白,無跨膜區(qū)和信號肽,在細(xì)胞核中發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng),具有堿性螺旋-環(huán)-螺旋(bHLH)結(jié)構(gòu)域。Tap蛋白與來源于NeuroD1的模板2ql2.1.B有61.02%的氨基酸序列一致,Tap蛋白與人類和嚙齒動物的編碼產(chǎn)物高度同源,在系統(tǒng)發(fā)生樹中距離最近。結(jié)論果蠅Tap蛋白具有bHLH蛋白家族的典型結(jié)構(gòu),可能在果蠅胚胎發(fā)育早期的神經(jīng)發(fā)生、分化等過程中發(fā)揮作用。
【作者單位】： 河南科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中心/神經(jīng)遺傳實(shí)驗(yàn)室;河南科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院人體解剖與組織胚胎學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： Tap蛋白 螺旋-環(huán)-螺旋構(gòu)型 分子結(jié)構(gòu) 計(jì)算生物學(xué) 果蠅 黑腹
【基金】：國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目(31171256) 自然科學(xué)基金河南科技大學(xué)配套經(jīng)費(fèi)(09001504) 河南科技大學(xué)博士啟動基金(13530057)
【分類號】：R384.2
【正文快照】： 堿性螺旋-環(huán)-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)蛋白家族廣泛分布于生物界,存在較高的保守性。大部分bHLH蛋白以同源二聚體或異源二聚體發(fā)揮轉(zhuǎn)錄因子作用,主要調(diào)節(jié)各種干細(xì)胞向終末細(xì)胞的分化,在骨骼肌、胰腺發(fā)育、血液發(fā)生、果蠅神經(jīng)干細(xì)胞分化以及脊椎動物脊髓、端腦皮層的

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 Geetha Govindan;Achuthsankar S.Nair;;Bagging with CTD A Novel Signature for the Hierarchical Prediction of Secreted Protein Trafcking in Eukaryotes[J];Genomics,Proteomics & Bioinformatics;2013年06期

2 李巖;徐志勝;譚國飛;賈曉玲;王楓;熊愛生;;芹菜熱激轉(zhuǎn)錄因子基因AgHSFB2的克隆及不同溫度處理下的表達(dá)響應(yīng)[J];南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2015年03期

3 劉洪超;李玉秀;鄒先明;涂心明;;黑腹果蠅CG18853基因編碼蛋白的生物信息學(xué)分析[J];生物技術(shù);2014年04期

4 周雅;高貝;張道遠(yuǎn);;齒肋赤蘚早期光誘導(dǎo)蛋白ELIPs的生物信息學(xué)分析[J];生物信息學(xué);2014年04期

5 Guillaume Daniel;Udo Schmidt-Edelkraut;Dietmar Spengler;Anke Hoffmann;;Imprinted Zac1 in neural stem cells[J];World Journal of Stem Cells;2015年02期

6 沈建英;林玲;鄭志z，

本文編號：887055