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人博卡病毒1-4型重組分析及人博卡病毒1型相關質粒的構建

發(fā)布時間:2017-09-20 05:34

  本文關鍵詞:人博卡病毒1-4型重組分析及人博卡病毒1型相關質粒的構建


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【摘要】:目的1.人博卡病毒(Human Bocavirus, HBoV)1-4型中僅HBoV1具有完整的基因組序列;且研究發(fā)現(xiàn)HBoV1-4之間可能存在基因重組。因此,獲得HBoV1-4的全基因組或近似全基因組序列,對全面深入分析和研究HBoVs的基因特征及重組具有重要的科學意義。2.反向末端重復序列(inverted terminal repeat,ITR)對腺相關病毒的包裝和感染力具有顯著的影響,利用外源質粒提供Rep蛋白和Cap蛋白可以體外完成腺相關病毒或重組病毒的病毒包裝和釋放。因此,構建具有HBoV1 ITR的重組質粒和NS1、NP1、VP1/2的真核表達質粒對于HBoV1重組病毒相關研究具有重要的科學價值。對象和方法1.我國HBoV 1-4型的全基因組擴增及重組分析從南京和蘭州地區(qū)腹瀉患兒糞便標本中選擇HBoV單陽性的標本,以GenBank來源的近似全基因組為參考株,用primer premier 5.0軟件設計引物,采用普通PCR及接頭法PCR擴增各基因片段,拼接后獲得HBoV 1-4全基因組。對所獲得的近似全基因組進行同源性比對及進化分析,利用RDP4軟件分析HBoV 1-4間的基因重組關系。2.HBoV1型相關質粒的構建將從pEGFP-N1質粒上酶切下的EGFP熒光蛋白基因連接于酶切去除NS1、NP1和VP1/2的pIHBoV1質粒上,構建pITRGFP質粒;將HBoV1的編碼區(qū)基因用PCR及酶切的方法最后連接在pcDNA3.1(+)上,構建pcRC質粒,將pITRGFP及pcRC共轉染入HEK293細胞,SDS-PAGE鑒定上述載體構建成功與否。結果1.分別從南京和蘭州地區(qū)的標本中擴增得到2條HBoV1、2條HBoV2、2條HBoV3、1條HBoV4近似全基因組序列,其中HBoV4為國內首次獲得,HBoV2-NC為目前國內外最長全基因組序列;2.HBoV1和HBoV3在各編碼區(qū)變異率較小,而HBoV2和HBoV4變異率較大,可能是潛在HBoV重組病毒株的來源;HBoV3可能由HBoV1和HBoV4重組進化而來,HBoV4可能由HBoV2與HBoV3重組進化而來。3.成功構建了HBoV1的相關載體pITRGFP和pcRC,上述載體在HEK293細胞中成功表達了GFP標簽蛋白和HBoV1 VP2蛋白。結論1.擴增得到HBoV1-4的近似全基因組序列;2.HBoV1-4間存在著基因重組;3.成功構建了pITRGFP和pcRC質粒,對HBoV1的相關研究有著重要意義。
【關鍵詞】:人博卡病毒1-4 基因重組 質粒構建
【學位授予單位】:蘭州大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R725.1
【目錄】:
  • 中文摘要3-5
  • Abstract5-8
  • 第一章 引言8-17
  • 1.1 HBoV的分子生物學特征9-12
  • 1.2 HBoV的致病機制12
  • 1.3 HBoV與疾病相關性12-14
  • 1.4 HBoV的診斷與治療14
  • 1.5 HBoV在基因治療載體領域中的初步研究14-15
  • 1.6 研究的目的和意義15-17
  • 第二章 人博卡病毒1-4型重組分析17-54
  • 2.1 實驗材料17-18
  • 2.2 實驗方法18-27
  • 2.3 結果27-51
  • 2.4 討論51-54
  • 第三章 人博卡病毒1型相關質粒的構建54-70
  • 3.1 實驗材料54-55
  • 3.2 實驗方法55-63
  • 3.3 實驗結果63-68
  • 3.4 討論68-70
  • 結論70-71
  • 全文創(chuàng)新點71-72
  • 參考文獻72-77
  • 在學期間的研究成果77-78
  • 致謝78-79
  • 中英文對照表79

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本文編號:886223

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