本文關(guān)鍵詞：人源α-烯醇化酶B細(xì)胞表位鑒定及其與牙齦卟啉單胞菌烯醇化酶的交叉反應(yīng)預(yù)測

  更多相關(guān)文章： 抗原表位 人源α-烯醇化酶 牙齦卟啉單胞菌烯醇化酶 交叉反應(yīng)

【摘要】：目的:預(yù)測鑒定人源α-烯醇化酶蛋白的B細(xì)胞抗原表位,探討人源α-烯醇化酶與牙齦卟啉單胞菌烯醇化酶之間的交叉反應(yīng)性。方法:以人源α-烯醇化酶蛋白序列為基礎(chǔ),綜合應(yīng)用多個軟件預(yù)測B細(xì)胞線性表位;再以人源α-烯醇化酶的蛋白晶體結(jié)構(gòu)為基礎(chǔ),采用4個生物信息學(xué)軟件綜合預(yù)測B細(xì)胞構(gòu)象表位;利用原核表達(dá)系統(tǒng)對人源α-烯醇化酶蛋白進(jìn)行表達(dá)、親和層析法進(jìn)行,純化抗原免疫BALB/c小鼠,化學(xué)合成預(yù)測的線性表位片段檢測抗體反應(yīng),確定人源α-烯醇化酶蛋白B細(xì)胞表位。利用Clustal X進(jìn)行蛋白質(zhì)序列比對和Swiss-Model進(jìn)行同源模建,研究人源α-烯醇化酶和牙齦卟啉單胞菌烯醇化酶的交叉反應(yīng)性。結(jié)果:人源α-烯醇化酶線性B細(xì)胞表位優(yōu)勢區(qū)域為9-25aa,28-43aa,70-85aa,163-178aa,229-244aa,280-295aa;構(gòu)象性B細(xì)胞表位優(yōu)勢區(qū)域為:1-4/24-30/77-86/124aa,9-16/51-59aa,250-254/262-268/271-274aa;合成的線性表位片段中9-25aa免疫應(yīng)答反應(yīng)最強(qiáng)烈,其次是70-85aa,再次為28-43aa,163-178aa,229-244aa,280-295aa;牙齦卟啉單胞菌烯醇化酶和人源α-烯醇化酶氨基酸序列同源性高達(dá)50.11%,兩者在線性B細(xì)胞表位優(yōu)勢區(qū)域的9-24aa和32-42aa序列高度相似;空間構(gòu)象比對結(jié)果顯示牙齦卟啉單胞菌烯醇化酶和人源α-烯醇化酶之間的RMSD值為1.055姒,且兩者在3個構(gòu)象性B細(xì)胞表位優(yōu)勢區(qū)域的空間構(gòu)象高度相似,推測二者可能在上述區(qū)域發(fā)生交叉反應(yīng)。結(jié)論:預(yù)測并鑒定了人源α-烯醇化酶蛋白的B細(xì)胞抗原表位,比較其與牙齦卟啉單胞菌的烯醇化酶可能發(fā)生交叉反應(yīng)的位點,為研究人源α-烯醇化酶蛋白的自身抗原性和類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎發(fā)病機(jī)制提供了理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 華中師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 湖北省遺傳調(diào)控與整合生物學(xué)重點實驗室;華中科技大學(xué)附屬協(xié)和醫(yī)院風(fēng)濕免疫科;
【關(guān)鍵詞】： 抗原表位 人源α-烯醇化酶 牙齦卟啉單胞菌烯醇化酶 交叉反應(yīng)
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.30972693,21473065) 湖北省自然科學(xué)基金重點項目(2014CFA079) 中央高�？蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項資金(CCNU13F011)基金資助
【分類號】：R392.11
【正文快照】： 1本文受國家自然科學(xué)基金(No.30972693,21473065)、湖北省自然科學(xué)基金重點項目(2014CFA079)和中央高�？蒲袠I(yè)務(wù)費(fèi)專項資金(CCNU13F011)基金資助。2華中科技大學(xué)附屬協(xié)和醫(yī)院風(fēng)濕免疫科,武漢430022。類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎(Rheumatoid arthritis,RA)是一種以滑膜炎癥、關(guān)節(jié)軟骨損壞為主

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 黃艷新;鮑永利;李玉新;;抗原表位預(yù)測的免疫信息學(xué)方法研究進(jìn)展[J];中國免疫學(xué)雜志;2008年09期

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 張瑩;李敏;劉宇;韓忷s，

本文編號：874536