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利用偏差振幅識別與分析阿爾茲海默病的候選基因

發(fā)布時間:2017-09-17 09:05

  本文關(guān)鍵詞:利用偏差振幅識別與分析阿爾茲海默病的候選基因


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【摘要】:阿爾茲海默病是老年癡呆最常見的形式,是一種進行性發(fā)展的神經(jīng)退行性疾病,到現(xiàn)在為止還沒有找到能有效治療這種病的措施,因此這種病不能被治愈,最后會導(dǎo)致死亡。目前,全球大約有2500萬阿爾茲海默病患者。專家估計,到2020年,中國的老年癡呆癥患者將達到1020萬,到2040年則將達到2250萬,到那時,中國的阿爾茲海默病患者將約占世界患者數(shù)量的四分之一。阿爾茲海默病正在成為威脅老年人健康的主要疾病之一,醫(yī)學(xué)界現(xiàn)在還沒有能治愈這種病的有效方法,所以,,弄清楚這種病的發(fā)病原因,設(shè)計能治療或者阻止這種病的藥物成為了全社會共同關(guān)心的問題。為了找到治療阿爾茲海默病的方法,必須先了解這種病的發(fā)病機制。通過尸檢發(fā)現(xiàn)患者最主要的病理特征是腦內(nèi)出現(xiàn)老年斑和神經(jīng)纖維纏結(jié)以及神經(jīng)元的大量死亡。目前關(guān)于阿爾茲海默病成因比較主流的說法是A假說,該假說認為-淀粉樣蛋白(-amyloid peptide,A)沉積是造成阿爾茲海默病的主要原因。因此,越來越多的研究者開始將目光集中到尋找導(dǎo)致A沉積的基因上。隨著DNA微陣列技術(shù)的成熟,利用計算機與數(shù)學(xué)相結(jié)合的方法,設(shè)計算法對基因表達數(shù)據(jù)進行處理,尋找與阿爾茲海默病相關(guān)的致病基因變得可行。本文利用雜技演員走鋼絲的思想,設(shè)計算法來處理基因表達數(shù)據(jù)以識別與AD病相關(guān)的候選基因。通過本文所設(shè)計的算法,一共識別出了52個與AD病有關(guān)的候選基因,這52個基因中有27個候選基因的平均偏差是一致增加的,另外25個候選基因的平均偏差是一致減少的。對這些候選基因分析,得出如下結(jié)論:1、基因cnr1、avpr2、agtr1和ptafr是膜上參與信號傳導(dǎo)的基因,它們的表達水平異常與AD病密切相關(guān);2、細胞質(zhì)中的運輸能力逐漸減弱可能與AD病有關(guān);3、基因cacnb2和cacna1e是膜上與鈣離子有關(guān)且與信號傳導(dǎo)相關(guān)的候選基因,它們的表達水平異常可能是導(dǎo)致鈣穩(wěn)態(tài)失衡的重要因素。這些基因的表達水平失衡最終引起A沉積和神經(jīng)元的大量死亡。
【關(guān)鍵詞】:阿爾茨海默病 基因芯片技術(shù) 基因表達水平 候選基因 偏差振幅
【學(xué)位授予單位】:四川師范大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號】:R311;R749.16
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • Abstract4-7
  • 1 緒論7-12
  • 1.1 阿爾茨海默病概述7-8
  • 1.2 阿爾茨海默病致病基因研究現(xiàn)狀8-9
  • 1.3 基因芯片技術(shù)及其在 AD 候選基因識別上的應(yīng)用9-10
  • 1.4 本文研究的內(nèi)容和意義10-11
  • 1.5 本文主要工作11-12
  • 2 阿爾茲海默病的病理特征及部分候選基因?qū)υ摬〉挠绊?/span>12-17
  • 2.1 阿爾茲海默病的病理特征12-13
  • 2.2 候選基因?qū)Π柶澓D〉挠绊?/span>13-16
  • 2.3 本章小結(jié)16-17
  • 3 偏差振幅算法的原理及實現(xiàn)過程17-25
  • 3.1 引言17-18
  • 3.2 數(shù)據(jù)來源和格式18-19
  • 3.3 識別候選基因的基本思想19
  • 3.4 偏差振幅算法的原理19-24
  • 3.5 偏差振幅算法的實現(xiàn)步驟24
  • 3.6 本章小結(jié)24-25
  • 4 實驗結(jié)果25-29
  • 4.1 實驗所得的候選基因25-26
  • 4.2 識別出的候選基因平均偏差的變化趨勢26-28
  • 4.3 本章小結(jié)28-29
  • 5 候選基因分析29-38
  • 5.1 候選基因的特征和分析所得的結(jié)論29-33
  • 5.2 與金屬離子有關(guān)的候選基因分析33-35
  • 5.3 主要結(jié)論35-36
  • 5.4 本章小結(jié)36-38
  • 6 總結(jié)38-40
  • 參考文獻40-46
  • 附錄46-50
  • 致謝50

【參考文獻】

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本文編號:868490

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