MassARRAY定量分析法與普通亞硫酸鹽測(cè)序法檢測(cè)心肌梗死大鼠模型低甲基化基因序列的效果比較
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【摘要】:目的通過(guò)比較MassARRAY定量分析法與普通亞硫酸鹽測(cè)序法(BSP)檢測(cè)心肌梗死大鼠乙醛脫氫酶(ALDH2)基因啟動(dòng)子甲基化的效果,為確定適用于低甲基化基因序列檢測(cè)的最佳方法提供依據(jù)。方法取10只平均體重為(200±10)g的雄性Sprague-Dawley大鼠,將其隨機(jī)分入對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組,每組5只。實(shí)驗(yàn)組行心臟冠狀動(dòng)脈左前降支結(jié)扎術(shù),制備心肌梗死模型。常規(guī)飼養(yǎng)7d后,取實(shí)驗(yàn)組大鼠心臟梗死邊緣區(qū)心肌組織,同時(shí)在對(duì)照組的相同區(qū)域取材。提取邊緣區(qū)心肌組織DNA,分別采用MassARRAY定量分析法和普通BSP檢測(cè)兩組大鼠ALDH2基因核心啟動(dòng)子上游同一段DNA序列甲基化情況。結(jié)果 BSP可檢測(cè)顯示目標(biāo)區(qū)域12個(gè)CpG位點(diǎn),但檢測(cè)結(jié)果示對(duì)照組和實(shí)驗(yàn)組均無(wú)DNA甲基化發(fā)生;MassARRAY定量分析法可檢測(cè)顯示目標(biāo)區(qū)域10個(gè)CpG位點(diǎn)(2號(hào)至11號(hào)位點(diǎn)),實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組10個(gè)CpG位點(diǎn)均有低度DNA甲基化(30%),且兩組間5號(hào)、6號(hào)和7號(hào)CpG位點(diǎn)甲基化水平的差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P值均0.05)。結(jié)論對(duì)于低甲基化基因序列,MassARRAY定量分析法較BSP擁有更好的DNA甲基化檢測(cè)精度和檢測(cè)效率。
【作者單位】: 山東大學(xué);復(fù)旦大學(xué)附屬中山醫(yī)院上海市心血管研究所;復(fù)旦大學(xué)生物醫(yī)學(xué)研究院;
【關(guān)鍵詞】: DNA甲基化 MassARRAY定量分析法 普通亞硫酸鹽測(cè)序法 低甲基化基因序列
【分類(lèi)號(hào)】:R542.22;R-332
【正文快照】: DNA甲基化是表觀(guān)遺傳學(xué)的重要組成部分,組行心臟冠狀動(dòng)脈左前降支結(jié)扎術(shù)制備心肌梗死DNA甲基化水平變化會(huì)影響靶基因的表達(dá)水模型。術(shù)后行心臟超聲檢查確定手術(shù)成功,常規(guī)平[1-2]。隨著DNA甲基化在生命科學(xué)研究中地飼養(yǎng)7d后,對(duì)兩組大鼠同時(shí)實(shí)施安樂(lè)死取材。實(shí)位的上升,在方法學(xué)
【共引文獻(xiàn)】
中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 王林;辛鐘成;;防治糖尿病新挑戰(zhàn):代謝記憶[J];中華臨床醫(yī)師雜志(電子版);2014年06期
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條
1 朱漢鋼;內(nèi)皮型一氧化氮合成酶的表觀(guān)遺傳學(xué)改變?cè)诟哐恰按x記憶”中的作用及機(jī)制研究[D];華中科技大學(xué);2013年
2 梁家亮;誘導(dǎo)多能干細(xì)胞向內(nèi)皮細(xì)胞分化的調(diào)控機(jī)制及其對(duì)心肌梗死的治療作用研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2014年
3 劉彥卿;腎細(xì)胞癌中有機(jī)陽(yáng)離子轉(zhuǎn)運(yùn)體OCT2轉(zhuǎn)錄抑制機(jī)理研究—從表觀(guān)遺傳調(diào)控到化學(xué)治療[D];浙江大學(xué);2013年
4 章麗燕;生命早期營(yíng)養(yǎng)不良誘導(dǎo)肺血管內(nèi)皮細(xì)胞功能失調(diào)的表觀(guān)調(diào)控機(jī)制研究[D];浙江大學(xué);2014年
5 徐哲奕;2型糖尿病大血管并發(fā)癥中血管平滑肌細(xì)胞增殖相關(guān)基因DNA甲基化的作用研究[D];華中科技大學(xué);2014年
6 劉世宇;移植外源性MSCs持久恢復(fù)宿主MSCs功能的機(jī)制研究[D];第四軍醫(yī)大學(xué);2015年
中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條
1 羅鴦鴦;系統(tǒng)性硬皮病患者CD4+T細(xì)胞組蛋白修飾異常的研究[D];中南大學(xué);2013年
2 胡淵;DRD5,,MNX1異常甲基化在2型糖尿病大血管并發(fā)癥診斷中的應(yīng)用研究[D];華中科技大學(xué);2013年
3 楊屏日;孕期血液指標(biāo)對(duì)新生兒出生體重的影響分析[D];浙江大學(xué);2013年
4 王佳;鯽魚(yú)Dmrt3基因的克隆和表達(dá)分析[D];浙江大學(xué);2014年
5 勞林江;宮內(nèi)宮外營(yíng)養(yǎng)干預(yù)對(duì)成年期肺血管功能的影響及表觀(guān)調(diào)控機(jī)制探索[D];浙江大學(xué);2015年
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 江成彥;朱同林;;基于圖像特征的膠體金層析定量分析法[A];第五屆全國(guó)幾何設(shè)計(jì)與計(jì)算學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2011年
中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條
1 馬守華;“定量分析法評(píng)價(jià)菱鎂制品抗反鹵研究”通過(guò)鑒定[N];中國(guó)建材報(bào);2007年
本文編號(hào):816219
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