奇異變形桿菌波動(dòng)生長相關(guān)蛋白的篩選與鑒定
本文關(guān)鍵詞:奇異變形桿菌波動(dòng)生長相關(guān)蛋白的篩選與鑒定
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【摘要】:【背景】奇異變形桿菌是一種條件致病菌,但是在過去一個(gè)多世紀(jì)以來,奇異變形桿菌卻以它顯著的同心環(huán)生長模式和細(xì)胞二態(tài)性吸引著大量科學(xué)家的探索,而目前國內(nèi)外研究者主要針對(duì)單一細(xì)菌形態(tài)進(jìn)行某些蛋白表達(dá)的研究,探討的應(yīng)用也是純粹的微生物學(xué)專業(yè)內(nèi)容的探討,未見以之作為模型,聯(lián)系復(fù)雜系統(tǒng)探索的工作。 本室已歷時(shí)20年,完成大量的前期工作,包括菌株、pH、瓊脂含量、接種方式等對(duì)波動(dòng)生長的影響,本研究擬探索波動(dòng)過程中基因調(diào)控的變化,以奇異變形桿菌形態(tài)學(xué)研究為基礎(chǔ),將其生長期分為5個(gè)階段,分別提取其蛋白進(jìn)行篩選及驗(yàn)證,將環(huán)境與機(jī)制探索結(jié)合,為探明波動(dòng)生長機(jī)制奠定一定得基礎(chǔ)。 【方法】首先在培養(yǎng)基中加入呼吸酶指示劑—2,3,5-氯化三苯基四氮唑(TTC),環(huán)上細(xì)菌逐漸變?yōu)榧t色,但是這種改變與環(huán)的形成不具有同步性,而相對(duì)滯后。根據(jù)這一現(xiàn)象,將奇異變形桿菌分為5個(gè)生長階段:遷徙階段、鞏固階段環(huán)上及環(huán)間細(xì)菌、變紅階段環(huán)上及環(huán)外細(xì)菌。分別對(duì)其進(jìn)行結(jié)晶紫染色、鞭毛染色、原子力顯微鏡掃描。得到細(xì)菌在各個(gè)階段的菌體形態(tài),鞭毛、表面特征等指標(biāo)。然后在不同時(shí)間及位置小心刮取各生長階段的細(xì)菌,溶菌酶裂解細(xì)菌,提取蛋白質(zhì),SDS-PAGE分離細(xì)菌全蛋白,并用考馬斯亮藍(lán)R-250染色。之后篩選出差異條帶,酶解,提取肽混合物,進(jìn)行基質(zhì)輔助飛行時(shí)間質(zhì)譜檢測(cè)。最后根據(jù)質(zhì)譜結(jié)果,查閱大量文獻(xiàn),篩選出與奇異變形桿菌波動(dòng)生長機(jī)制相關(guān)蛋白,查閱編碼這些蛋白的基因,提取RNA,實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)其表達(dá)量,驗(yàn)證其與波動(dòng)生長存在相互作用。 【結(jié)果】培養(yǎng)基中加入TTC后,環(huán)上細(xì)菌變?yōu)榧t色;隨著培養(yǎng)基表面水份的增加,菌落環(huán)距減��;遷徙階段細(xì)菌菌體增長,鞭毛增多,鞏固階段菌體開始變短,鞭毛開始脫落;長菌表面粗糙,斷裂的短菌表面平整;與細(xì)菌運(yùn)動(dòng)有關(guān)的基因fusA、fliC1在遷徙階段表達(dá)量顯著性增高,,而tufB表達(dá)量顯著性降低;與抗氧化應(yīng)激有關(guān)的基因hslO、ahpC在在遷徙階段表達(dá)量顯著性增高;與代謝有關(guān)的基因icd表達(dá)量在遷徙階段顯著性增高,鞏固階段及變紅階段的環(huán)上細(xì)菌表達(dá)量顯著性高于環(huán)間細(xì)菌,pyrC遷徙階段顯著性性增高,flaB變紅階段表達(dá)量顯著性增高。 【結(jié)論】1、加入TTC后環(huán)上細(xì)菌變紅,是由細(xì)菌在鞏固階段有氧呼吸恢復(fù)正常,三羧酸循環(huán)的限速酶琥珀酸脫氫酶含量增高,將TTC還原為甲佨而形成紅色。 2、奇異變形桿菌各生長階段細(xì)菌形態(tài)存在顯著性差異,且周期性變化。 3、奇異變形桿菌各生長階段的運(yùn)動(dòng)及代謝方式存在差異,遷徙階段細(xì)菌運(yùn)動(dòng)能力、抗氧化能力增強(qiáng),呼吸功能、代謝能力降低;鞏固階段細(xì)菌繁殖能力、呼吸能力增強(qiáng)。其波動(dòng)生長機(jī)制涉及與運(yùn)動(dòng)相關(guān),與代謝相關(guān)基因多方面調(diào)控。
【關(guān)鍵詞】:奇異變形桿菌 實(shí)時(shí)熒光定量PCR 基質(zhì)輔助飛行時(shí)間質(zhì)譜 原子力顯微鏡掃描
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R378.2
【目錄】:
- 英漢縮略語名詞對(duì)照5-7
- 摘要7-10
- Abstract10-13
- 前言13-17
- 第一部分 奇異變形桿菌不同生長階段的形態(tài)學(xué)變化17-32
- 1 材料與方法17-21
- 2 結(jié)果21-28
- 3 討論28-32
- 第二部分 奇異變形桿菌波動(dòng)生長相關(guān)蛋白篩選與鑒定32-71
- 1 材料與方法32-43
- 2 結(jié)果43-66
- 3 討論66-71
- 全文總結(jié)71-72
- 參考文獻(xiàn)72-78
- 文獻(xiàn)綜述78-87
- 參考文獻(xiàn)83-87
- 致謝87-88
- 攻讀碩士期間發(fā)表的文章88-89
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本文編號(hào):779310
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