博萊霉素誘導(dǎo)小鼠肺纖維化模型的差異基因表達譜分析
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更多相關(guān)文章: 生物信息學(xué) 肺纖維化 基因表達譜 BRB-Array Tools軟件
【摘要】:目的從分子水平探討博萊霉素誘導(dǎo)肺纖維化小鼠模型的發(fā)病機制,為臨床診療提供新思路。方法從公共基因芯片數(shù)據(jù)庫中下載博萊霉素誘導(dǎo)野生型小鼠肺纖維化的相關(guān)基因芯片數(shù)據(jù),使用BRB-Array Tools軟件對其進行分析,篩選小鼠肺纖維化疾病不同時間點的差異表達基因;并利用DAVID工具進行生物信息學(xué)分析。結(jié)果 BRB分析發(fā)現(xiàn)45 101個差異表達基因,博萊霉素誘導(dǎo)后7 d顯著上調(diào)1 164個基因(P0.05,變化倍數(shù)2),下調(diào)735個;第14 d上調(diào)731個,下調(diào)390個(P0.05,變化倍數(shù)2)。DAVID分析發(fā)現(xiàn)上調(diào)的基因在細胞周期、p53信號、化學(xué)因子信號通路及損傷反應(yīng)、膠原代謝等生物學(xué)過程中有顯著富集;而下調(diào)的基因在藥物代謝信號通路中有顯著富集。結(jié)論利用生物信息學(xué)方法能有效分析基因芯片數(shù)據(jù)并獲取內(nèi)在信息,為深入認識肺纖維化病程的主要分子事件和細胞信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路改變,并進一步發(fā)現(xiàn)肺纖維化的早期診斷標志與治療靶點提供新的思路。
【作者單位】: 第四軍醫(yī)大學(xué)唐都醫(yī)院呼吸和危重醫(yī)學(xué)科;第四軍醫(yī)大學(xué)生物化學(xué)和分子生物學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】: 生物信息學(xué) 肺纖維化 基因表達譜 BRB-Array Tools軟件
【基金】:國家自然科學(xué)基金(編號:30901359) 陜西省社會發(fā)展攻關(guān)課題(編號:2010K01-172)
【分類號】:R563.9;R-332
【正文快照】: 肺纖維化是缺乏特效治療手段的彌漫性肺間質(zhì)疾病,其病理特征是肺泡上皮的損傷和成纖維細胞增殖、胞外基質(zhì)過度沉積,引起進展性肺功能下降[1-3],最終誘發(fā)呼吸衰竭。隨著社會經(jīng)濟的發(fā)展及環(huán)境污染,導(dǎo)致肺損傷因素的逐漸增多,肺纖維化的發(fā)病呈現(xiàn)逐年增加的趨勢,而許多慢性肺疾病,
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本文編號:767617
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