本文關(guān)鍵詞：細粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)組學研究及生物信息學分析

  更多相關(guān)文章： 細粒棘球絳蟲 原頭蚴 蛋白組學 雙向電泳 MALDI-TOF-MS

【摘要】：目的在前期研究的基礎(chǔ)上，通過雙向電泳條件的優(yōu)化，對細粒棘球絳蟲原頭蚴進行蛋白質(zhì)組學和生物信息學分析，進一步研究原頭蚴蛋白質(zhì)的基礎(chǔ)構(gòu)成和功能情況，尋找具有特異性的靶標蛋白，為包蟲病的早期診斷、新藥開發(fā)、疫苗篩選，提供理論依據(jù)。 方法1.取寧夏醫(yī)科大學總醫(yī)院肝膽外科包蟲病人術(shù)后的包囊，經(jīng)無菌分離細粒棘球絳蟲原頭蚴。2.對原頭蚴蛋白質(zhì)樣品并進行雙向電泳分離，并對雙向電泳條件進行優(yōu)化。3.選擇分離的蛋白點進行MALDI-TOF/MS檢測得到肽指紋圖譜PMF。4.將PMF數(shù)據(jù)提交到互聯(lián)網(wǎng)中蛋白信息研究數(shù)據(jù)庫中，與已有的蛋白信息進行匹配分析，初步鑒定出樣本中蛋白質(zhì)，通過COGs（Clustersof Orthologous Groups of proteins）蛋白質(zhì)直系同源簇數(shù)據(jù)庫、 GO （GeneOntology）蛋白質(zhì)功能分類數(shù)據(jù)庫、 KEGG pathway蛋白質(zhì)代謝通路數(shù)據(jù)庫，分析這些蛋白的功能與性質(zhì)。5.利用免疫印跡的方法，用包蟲病人的血清識別原頭蚴抗原，，并進行質(zhì)譜鑒定及生物信息學分析。 結(jié)果1.通過原頭蚴蛋白質(zhì)樣品的雙向電泳分析，獲得了330個蛋白點。2.從雙向電泳凝膠上切下來的蛋白點通過MALDI-TOF MS質(zhì)譜檢測，原頭蚴樣品中有157個蛋白點獲得了肽指紋圖譜（PMF）數(shù)據(jù)。3.初步鑒定了細粒棘球蚴原頭蚴中的部分蛋白點，共有49個蛋白點。4.對鑒定得到的蛋白點，我們進行了生物信息學的初步分析，發(fā)現(xiàn)這些蛋白主要與細胞組成、新陳代謝、信號轉(zhuǎn)導(dǎo)以及物質(zhì)運輸有關(guān)。5.對原頭蚴蛋白利用包蟲病人的血清對對原頭蚴蛋白進行western blot的識別，成功識別了80個蛋白點，并對這些蛋白點進行質(zhì)譜鑒定，最后有28個蛋白點得到鑒定。 結(jié)論通過雙向電泳條件的優(yōu)化，成功建立了細粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)雙向電泳圖譜；利用蛋白質(zhì)組學和生物信息學技術(shù)，進一步研究原頭蚴蛋白質(zhì)的構(gòu)成和功能情況，成功建立了細粒棘球絳蟲原頭蚴蛋白質(zhì)組基礎(chǔ)數(shù)據(jù)庫
【關(guān)鍵詞】：細粒棘球絳蟲 原頭蚴 蛋白組學 雙向電泳 MALDI-TOF-MS
【學位授予單位】：寧夏醫(yī)科大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2013
【分類號】：R383.33;R3411
【目錄】：

• 摘要4-6
• ABSTRACT6-10
• 前言10-14
• 第一部分 原頭蚴蛋白質(zhì)組學分析14-44
• 材料與方法14-23
• 結(jié)果23-36
• 討論36-44
• 第二部分 包蟲病人抗血清對原頭蚴抗原的篩選44-58
• 材料與方法44-47
• 結(jié)果47-55
• 討論55-58
• 結(jié)論58-59
• 參考文獻59-64
• 文獻綜述64-70
• 綜述參考文獻68-70
• 致謝70-71
• 攻讀學位期間發(fā)表的學術(shù)論文71-72
• 個人簡歷72

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本文編號：756650