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一株新的沙門菌烈性噬菌體IME-SAL1的分離、全基因組測序和比較基因組分析

發(fā)布時間:2017-08-23 09:38

  本文關(guān)鍵詞:一株新的沙門菌烈性噬菌體IME-SAL1的分離、全基因組測序和比較基因組分析


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【摘要】:目的:分離鑒定一株沙門菌的烈性噬菌體,觀察其形態(tài)大小,完成全基因組測序,分析其基因組結(jié)構(gòu)和進(jìn)化關(guān)系,為治療沙門菌感染提供新的策略和實(shí)驗(yàn)依據(jù)。方法:以沙門菌SAL95作為指示菌從醫(yī)院廢水中分離噬菌體,分離到的噬菌體經(jīng)濃縮和純化后采用透射電鏡觀察其形態(tài)大小,提取噬菌體的基因核酸并完成全基因組高通量測序,分析其全基因組的結(jié)構(gòu)特征,通過比較基因組分析研究其進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果:從解放軍307醫(yī)院未經(jīng)消毒處理的廢水中分離到一株烈性沙門菌噬菌體。電鏡觀察顯示,該噬菌體頭部呈立體對稱,有一不收縮的長尾。其基因組全長113 183 bp,比較基因組分析確定該噬菌體為一株新的沙門菌噬菌體,命名為IME-SAL1。結(jié)論:從醫(yī)院廢水中分離到一株烈性沙門菌噬菌體IME-SAL1,研究了該噬菌體的分類、基因組結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系,可為其實(shí)際應(yīng)用提供參考。
【作者單位】: 中南大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院微生物流行病研究所;
【關(guān)鍵詞】沙門菌 烈性噬菌體 全基因組測序 比較基因組分析
【基金】:國家科技重大專項(xiàng)(2011ZX10004001;2013ZX10004607-004;2013ZX10004217-002-003) 國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(2012AA022003,2014AA021402)
【分類號】:R378.22;Q78
【正文快照】: 沙門菌歸類于腸桿菌科沙門菌屬,在自然界分布極為廣泛,幾乎能從所有脊椎動物及昆蟲體內(nèi)分離到[1]。絕大多數(shù)沙門菌對人有致病性,引起發(fā)熱、腸胃炎、腹瀉和敗血癥等[2]。沙門菌主要傳播途徑為消化道,是世界上引起食物中毒最多的病原菌[3]。從20世紀(jì)70年代第一次報道多重耐藥(MD

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 張克斌,金曉琳,陳志瑾,朱軍民,饒賢才,胡福泉;銅綠假單胞菌噬菌體PaP3的密碼使用偏嗜性與tRNA基因[J];第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報;2002年04期

2 顧敬敏;韓文瑜;路榮;雷連成;楊勇軍;馮新;孫長江;杜崇濤;;治療細(xì)菌性疾病的有力武器——噬菌體及其裂解酶[J];河北科技師范學(xué)院學(xué)報;2011年01期

3 范華昊;范俊芬;滑玉會;裴廣倩;張文惠;張博;陳晨;李建彬;王曉娜;安小平;米志強(qiáng);王琳;尹秀云;陳建魁;童貽剛;;快速從醫(yī)院廢水中大規(guī)模分離銅綠假單胞桿菌噬菌體[J];生物技術(shù)通訊;2012年04期

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 武英;;應(yīng)對耐藥菌的新方法—噬菌體制劑[J];國外醫(yī)藥(抗生素分冊);2011年05期

2 李夢琦;周云;陳魏;劉軍軍;李郁;;不同源5株沙門菌在小鼠與雛雞體內(nèi)傳代的毒力比較[J];動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2013年11期

3 趙兵;;噬菌體治療細(xì)菌感染的臨床進(jìn)展[J];中外醫(yī)療;2015年01期

4 尹雅菲;張樂;慶宏;童貽剛;;新廣譜大腸桿菌噬菌體IME11的分離及鑒定[J];生物醫(yī)學(xué)工程與臨床;2013年05期

5 彭帆;童貽剛;柏長青;;多耐藥鮑曼不動桿菌噬菌體IME-AB6的分離、生物特性及保存方法研究[J];生物技術(shù)通訊;2013年05期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 周瑩冰;銅綠假單胞菌噬菌體PaP3生物學(xué)特性的研究與噬菌體基因組改造的技術(shù)準(zhǔn)備[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2006年

2 劉平;分枝桿菌噬菌體的生物學(xué)特性及基因組學(xué)研究[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2012年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 李佳桐;沙門氏菌LAMP檢測方法的建立[D];延邊大學(xué);2014年

2 彭帆;耐藥性鮑曼不動桿菌噬菌體特性和基因組及應(yīng)用效果評價[D];中南大學(xué);2014年

3 曹放;應(yīng)用裂解性噬菌體治療多重耐藥肺炎克雷伯氏菌引起的小鼠肺炎[D];大連理工大學(xué);2014年

【二級參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 呂欣;噬菌體在細(xì)菌性感染治療中的應(yīng)用及展望[J];國外醫(yī)學(xué).病毒學(xué)分冊;2001年06期

2 李藝,楊信怡,游雪甫;耐甲氧西林金葡菌的耐藥分子機(jī)制研究[J];國外醫(yī)藥(抗生素分冊);2005年04期

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 于龍;溫占波;楊文慧;李娜;王潔;鹿建春;李勁松;;一株粘質(zhì)沙雷氏菌烈性噬菌體污水分離及特性[J];微生物學(xué)報;2008年04期

2 ;[J];;年期

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中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 李隴平;張智英;;金黃色葡萄球菌烈性噬菌體的分離鑒定和最佳保存方法研究[A];第五屆中國畜牧科技論壇論文集[C];2011年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 李彥哲;禽源大腸桿菌烈性噬菌體的分離鑒定及功能基因組學(xué)分析[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年



本文編號:724334

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