本文關(guān)鍵詞：2012年江蘇省柯薩奇病毒A組14型分離株全基因序列分析

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【摘要】：目的探討2012年江蘇省手足口病(HFMD)病原體CVA14病毒的全基因序列特點。方法采集江蘇省邳州市2012年HFMD患兒的咽拭子或肛拭子樣本,分離培養(yǎng)得到2株CVA14病毒,利用RT-PCR擴增CVA14全長基因。利用DNAStar軟件包的Meg Align進行核苷酸序列分析,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。結(jié)果擴增得到覆蓋CVA14全基因組的3個片段,拼接后為CVA14全基因組,分別命名為PZ05Y/JS/2012和PZ15G/JS/2012。同源性分析結(jié)果顯示,這2株分離株之間同源性為99.4%,原型株(G-14)的核苷酸同源性為84.4%。進化樹結(jié)果顯示,所有的CVA14形成A、B和C共3個分支。結(jié)論獲得了江蘇省CVA14的全基因序列,分析了該毒株的進化特點,補充了中國CVA14病毒的基因信息。
【作者單位】： 中國食品藥品檢定研究院肝炎病毒疫苗室;江蘇省疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 手足口病(HFMD) 柯薩奇病毒A組型(CVA) 基因型
【基金】：科技部重大專項(2013ZX09304101)
【分類號】：R373.23
【正文快照】： 柯薩奇病毒A組14型(Coxsackievirus A14,CVA14)屬于小RNA病毒科腸道病毒屬。CVA14最早的分離株G14為1950年分離[1]。CVA14基因組是大小為7.4×103bp的單股正鏈RNA,由5'非編碼區(qū)(5'-NTR)、編碼區(qū)、3'非編碼區(qū)(3'-NTR)和一個poly(A)尾部分組成。編碼區(qū)可分為P1、P2和P3區(qū),其中P1

【共引文獻】

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本文編號：716285