基于15個STR基因座的廣府、客家、潮汕族群遺傳多態(tài)性研究和罕見嵌合體案例報道
發(fā)布時間:2017-08-16 15:46
本文關(guān)鍵詞:基于15個STR基因座的廣府、客家、潮汕族群遺傳多態(tài)性研究和罕見嵌合體案例報道
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【摘要】:目的調(diào)查廣東地區(qū)廣府、客家、潮汕三大漢族族群15個常染色體STR基因座的遺傳多態(tài)性,以探討他們間的遺傳結(jié)構(gòu)及群體進化關(guān)系。另外,簡單報道了一例罕見嵌合體案例,回顧了以往文獻對先天性嵌合體案例的報道及相關(guān)研究,并在其基礎(chǔ)上綜述了嵌合體的類型、形成機制、檢測方法及診斷策略。 方法采用多地區(qū)、大樣本的方法,利用PowerPlex16熒光標記系統(tǒng),對2174例廣東地區(qū)廣府、客家、潮汕三大漢族族群的15個STR基因座進行復合擴增,經(jīng)ABI3130遺傳分析儀分型,統(tǒng)計15個STR基因座的群體遺傳學參數(shù)。對比分析這些數(shù)據(jù),進一步揭示廣東漢族群體的遺傳結(jié)構(gòu)及多態(tài)性,并計算三者間遺傳距離,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。 結(jié)果在506例廣府族群中共檢出167個等位基因,602種基因型;907例客家族群中共檢出178個等位基因,704種基因型;761例潮汕族群中共檢出169個等位基因,,667種基因型。并分別統(tǒng)計出三大族群各基因座的觀察雜合度(Ho)、匹配概率(Pm)、個體識別率(DP)、多態(tài)信息量(PIC)、非父排除率(PE)。在三大族群的7個STR基因座上共檢出24個稀有等位基因(off-ladder)。POPTREE2軟件分析表明,客家與潮汕族群間的遺傳距離最近(0.002),客家與廣府族群間的遺傳距離稍遠(0.003),而廣府與潮汕族群間的遺傳距離最大(0.004),聚類時客家與潮汕族群首先聚成一支,再與廣府族群聚為一支。 結(jié)論研究獲得了廣東三大漢族族群的基因頻率及群體遺傳學數(shù)據(jù),可為相關(guān)法醫(yī)學研究提供依據(jù)。數(shù)據(jù)顯示,對于三大族群而言,此15個STR基因座均具有良好的鑒別能力,在法醫(yī)學個體識別及親權(quán)鑒定中應用價值較高。分析表明,雖然歷經(jīng)千年的交流和融合,各族群間依然顯示出一定的分化關(guān)系,客家和潮汕族群之間的關(guān)系較近,與廣府族群的分化關(guān)系較遠,這與三大族群遷徙入粵的歷史順序相符。此外,稀有等位基因類型和頻率結(jié)果也進一步支持了此種結(jié)論;15個常染色體STR基因座多態(tài)性,本研究從分子遺傳學角度印證了三大漢族族群之間的群體進化關(guān)系,也為相應的人類學及歷史學研究提供了有力的支撐。
【關(guān)鍵詞】:廣府 客家 潮汕 短串聯(lián)重復序列 遺傳多態(tài)性 嵌合體
【學位授予單位】:暨南大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2014
【分類號】:R394
【目錄】:
- 摘要3-5
- Abstract5-7
- 目錄7-8
- 第一章 廣府、客家、潮汕三大漢族族群 15 個 STR 基因座遺傳多態(tài)性及族源關(guān)系分析8-33
- 1 前言8-15
- 1.1 STR遺傳標記8-10
- 1.2 STR 在群體遺傳學中的應用10-11
- 1.3 廣府、客家、潮汕族群的起源11-12
- 1.4 遺傳學研究及意義12-15
- 2 材料與方法15-21
- 2.1 實驗材料與試劑15-18
- 2.2 實驗方法18-21
- 3 實驗結(jié)果21-27
- 3.1 三大族群 15 個 STR 基因座等位基因頻率分布21-23
- 3.2 三大族群稀有等位基因類型和頻率23-24
- 3.3 三大族群各基因座的群體遺傳學參數(shù)24-25
- 3.4 三大族群間的遺傳距離和系統(tǒng)進化樹25-27
- 4 分析與討論27-32
- 4.1 三大族群 15 個 STR 基因座的法醫(yī)學應用分析27
- 4.2 三大族群 STR 遺傳結(jié)構(gòu)特點及差異27-28
- 4.3 群體遺傳學分析方法的選擇28-29
- 4.4 從分子遺傳學角度討論三大族群的族源關(guān)系29-31
- 4.5 STR 檢測中罕見嵌合體的發(fā)現(xiàn)31-32
- 5 結(jié)論32-33
- 第二章 罕見先天性嵌合體的個案報道與文獻綜述33-42
- 1 個案報道33-34
- 1.1 對象與方法33
- 1.2 結(jié)果與分析33-34
- 2 文獻綜述34-41
- 2.1 嵌合體概述34
- 2.2 先天性嵌合體的類型34-35
- 2.3 形成機制35-37
- 2.4 檢測方法37-39
- 2.5 嵌合體的診斷策略39-40
- 2.6 問題與展望40-41
- 3 結(jié)論41-42
- 參考文獻42-48
- 附錄48-51
- 已發(fā)表文章51-67
- 碩士期間綜合表現(xiàn)67-68
- 致謝68
【參考文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條
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本文編號:684158
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