本文關(guān)鍵詞：淋球菌por,tbpB基因序列變異和系統(tǒng)進(jìn)化探討

  更多相關(guān)文章： 淋球菌 por基因 tbpB基因 系統(tǒng)進(jìn)化

【摘要】：目的分析遵義地區(qū)淋球菌por,tbp B基因序列變異及系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系。方法對(duì)淋球菌por,tbp B基因進(jìn)行測序鑒定,利用NG-MAST分型法對(duì)por,tbp B基因進(jìn)行比對(duì)編號(hào)。用MEGA5.22軟件中的鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,并以Kimura 2-parameter模型計(jì)算序列間的遺傳距離;Felsenstein法計(jì)算同義替換率(dS)和非同義替換率(dN)。以RDP3軟件對(duì)por,tbp B基因中的基因重組事件進(jìn)行分析。結(jié)果 65株淋球菌共鑒定出19種por基因型和22種tbp B基因型。19種por基因型被劃分為2個(gè)進(jìn)化簇群,基因間平均遺傳距離0.09。22種tbp B基因型被劃分為3個(gè)進(jìn)化簇群,基因間平均遺傳距離0.13。por,tbp B基因的dNdS。在tbp B基因中檢測出8個(gè)基因重組事件,而por基因僅有1個(gè)。結(jié)論本地區(qū)淋球菌por基因與tbp B基因的進(jìn)化速度與方式存在一定差異,其中tbp B基因主要以基因重組的方式參與進(jìn)化,por基因則可能以突變或缺失的方式參與進(jìn)化。純選擇作用是維持本地區(qū)por,tbp B基因多態(tài)性的重要機(jī)制。
【作者單位】： 遵義醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院輸血科;遵義醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)科;遵義醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院核醫(yī)學(xué)科;
【關(guān)鍵詞】： 淋球菌 por基因 tbpB基因 系統(tǒng)進(jìn)化
【基金】：國家自然科學(xué)基金(NO.81460317) 貴州省科技廳資助項(xiàng)目(黔科合J字LKZ[2012]20號(hào)) 遵義市科技局與遵義醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院聯(lián)合基金[遵市科合社字(2014)72號(hào)]
【分類號(hào)】：R378.16
【正文快照】： 表2淋球菌por與tbp B優(yōu)勢等位基因組合情況Tab.2 Combinations of por and tbp B dominant alleles in Neisseria gonorrhoeaepor alleles(n)tbp B alleles(n)1135(22)1132(16)90(5)1053(4)1135(10),1132(4)1132(7),1053(1),1973(1),1793(1)1053(3),1135(1),90(1),581(1),5274

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本文編號(hào)：667976