本文關(guān)鍵詞：腸道病毒71型疫苗免疫應(yīng)答機(jī)制研究

  更多相關(guān)文章： Meta分析 免疫機(jī)制 系統(tǒng)疫苗學(xué) EV71

【摘要】：目前對(duì)大多數(shù)疫苗的保護(hù)機(jī)制缺乏了解，新型疫苗的研發(fā)設(shè)計(jì)仍停留在依靠“經(jīng)驗(yàn)”階段，導(dǎo)致疫苗研發(fā)時(shí)間長且成本高。近年來系統(tǒng)疫苗學(xué)概念的提出，為疫苗學(xué)發(fā)展開辟了新的思路。腸道病毒71型（EV71）疫苗是我國自主研發(fā)的新型疫苗，目前中國大陸3個(gè)廠家已完成的III期臨床試驗(yàn)，結(jié)果顯示疫苗具有較好的安全性和保護(hù)效果，疫苗對(duì)EV71感染所致手足口病的保護(hù)率達(dá)90%以上，對(duì)EV71感染所引起相關(guān)疾病的保護(hù)率在80%以上。EV71疫苗為我國領(lǐng)先研發(fā)的創(chuàng)新型疫苗，了解該疫苗的免疫機(jī)制對(duì)促進(jìn)EV71疫苗研發(fā)具有重要意義。本研究目的是探討EV71疫苗誘導(dǎo)機(jī)體免疫應(yīng)答機(jī)制，為EV71疫苗研發(fā)和應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。 為了探討疫苗免疫應(yīng)答的共同機(jī)制，運(yùn)用薈萃分析（Meta分析）方法，分析自NCBI GEO數(shù)據(jù)庫和ArrayExpress數(shù)據(jù)庫中下載的疫苗免疫基因芯片表達(dá)譜數(shù)據(jù)，分別探討疫苗免疫機(jī)體后固有免疫和獲得性免疫在轉(zhuǎn)錄水平上共同的基因和通路，并應(yīng)用EV71疫苗免疫人群樣本采用RT-PCR方法進(jìn)行驗(yàn)證。結(jié)果表明疫苗誘導(dǎo)固有免疫共同基因和通路為IFN-I相關(guān)的基因和通路；疫苗誘導(dǎo)獲得性免疫共同基因主要為EEF1A1、IL-18，通路為B細(xì)胞和T細(xì)胞受體信號(hào)激活通路。 在Meta分析的基礎(chǔ)上，為揭示EV71疫苗的免疫機(jī)制，采用基因芯片和蛋白芯片技術(shù)探討EV71疫苗免疫機(jī)制，獲得了EV71疫苗免疫人群應(yīng)答的轉(zhuǎn)錄組譜和蛋白組譜。固有免疫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果表明，IFN-I信號(hào)通路在EV71疫苗誘導(dǎo)的固有免疫應(yīng)答中發(fā)揮重要作用，應(yīng)用小鼠及基因缺陷小鼠模型驗(yàn)證該信號(hào)通路結(jié)果顯示，EV71疫苗誘導(dǎo)固有免疫應(yīng)答中存在一條TLR4→IRF9→IFN-I→Jak-STAT→免疫細(xì)胞活化調(diào)控通路。基因與中和抗體水平關(guān)聯(lián)性分析結(jié)果表明ELL2與中和抗體水平關(guān)聯(lián)性較高，提示該基因有可能作為預(yù)測中和抗體應(yīng)答的標(biāo)志物。獲得性免疫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄組分析結(jié)果表明，差異表達(dá)基因主要參與細(xì)胞因子-細(xì)胞因子相互作用、細(xì)胞粘附作用、抗原加工和提呈作用等通路；基因與中和抗體的關(guān)聯(lián)性分析表明MX1和MX2與抗體持久性應(yīng)答的關(guān)聯(lián)性較高，有可能作為免疫持久性預(yù)測水平的標(biāo)志物。對(duì)20個(gè)基因應(yīng)用RT-PCR方法進(jìn)行驗(yàn)證，結(jié)果顯示芯片檢測結(jié)果可靠。應(yīng)用蛋白芯片檢測獲得EV71疫苗獲得性免疫應(yīng)答的蛋白組譜，差異表達(dá)上調(diào)蛋白主要為炎癥反應(yīng)蛋白、趨化因子、干擾素相關(guān)蛋白和細(xì)胞間粘附分子；差異表達(dá)下調(diào)蛋白主要為免疫調(diào)節(jié)分子和炎癥前因子。蛋白因子與中和抗體水平關(guān)聯(lián)性分析得到ICAM-1和IP-10與中和抗體水平具有較高的相關(guān)性，，提示ICAM-1和IP-10分別有可能作為預(yù)測中和抗體應(yīng)答和免疫持久性的指標(biāo)。 本研究通過Meta分析，研究疫苗誘導(dǎo)固有免疫和獲得性免疫應(yīng)答的共同機(jī)制，通過設(shè)計(jì)疫苗免疫人群和動(dòng)物實(shí)驗(yàn)，獲得EV71疫苗免疫應(yīng)答的轉(zhuǎn)錄組和蛋白組譜，研究結(jié)果為闡明EV71疫苗應(yīng)答機(jī)制以及篩選免疫原性預(yù)測的標(biāo)志物提供了依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】：Meta分析 免疫機(jī)制 系統(tǒng)疫苗學(xué) EV71
【學(xué)位授予單位】：中國食品藥品檢定研究院
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2014
【分類號(hào)】：R392
【目錄】：

• 主要中英文縮略詞4-5
• 摘要5-7
• Abstract7-9
• 前言9-10
• 一、應(yīng)用 Meta 分析篩選疫苗免疫人體誘導(dǎo)的共同基因和通路10-41
• 1. 材料與方法10-23
• 1.1 疫苗固有免疫機(jī)制研究10-22
• 1.1.1 試劑與材料10-11
• 1.1.2 試劑配制11-12
• 1.1.3 儀器12-13
• 1.1.4 方法13-22
• 1.1.4.1 Meta 分析研究樣本來源13
• 1.1.4.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理13
• 1.1.4.3 單個(gè)樣本數(shù)據(jù)合并13
• 1.1.4.4 數(shù)據(jù)處理和分析13-14
• 1.1.4.5 DEG 功能富集14
• 1.1.4.6 單個(gè)數(shù)據(jù)集分析14
• 1.1.4.7 免疫后 3 和 7d 亞組分析14
• 1.1.4.8 Meta 分析結(jié)果驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)14-22
• 1.2 疫苗獲得性免疫機(jī)制研究22-23
• 1.2.1 Meta 分析研究樣本來源22
• 1.2.2 數(shù)據(jù)預(yù)處理22
• 1.2.3 單個(gè)樣本數(shù)據(jù)合并22
• 1.2.4 篩選疫苗免疫機(jī)體的共同 DEG22
• 1.2.5 DEG 的通路富集22-23
• 2. 結(jié)果23-38
• 2.1 疫苗固有免疫應(yīng)答機(jī)制研究23-35
• 2.1.1 Meta 分析入組樣本23-24
• 2.1.2 疫苗誘導(dǎo)機(jī)體早期免疫應(yīng)答 DEG 篩選24-25
• 2.1.3 功能分析25-26
• 2.1.4 單個(gè)數(shù)據(jù)集分析26-29
• 2.1.5 針對(duì)不同時(shí)間點(diǎn)的亞組分析29-32
• 2.1.6 Meta分析獲得的DEG驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)32-35
• 2.2 疫苗獲得性免疫應(yīng)答機(jī)制研究35-38
• 2.2.1 Meta 分析入組樣本35
• 2.2.2 單個(gè)數(shù)據(jù)集數(shù)據(jù)分析35-36
• 2.2.3 共同 DEG 的篩選36
• 2.2.4 共同 DEG 通路富集分析36-38
• 3. 討論38-40
• 4. 小結(jié)40-41
• 二、腸道病毒 71 型疫苗免疫機(jī)制研究41-73
• 1.材料與方法41-51
• 1.1 樣本信息41-42
• 1.1.1 人群樣本41
• 1.1.2 動(dòng)物樣本41-42
• 1.2 試劑與材料42-43
• 1.3 試劑配制43
• 1.3.1 1640 完全培養(yǎng)基43
• 1.3.2 中和抗體檢測所用試劑43
• 1.4 儀器43
• 1.5 方法43-51
• 1.5.1 技術(shù)路線43-44
• 1.5.2 中和抗體檢測44-45
• 1.5.3 基因芯片檢測45-50
• 1.5.4 蛋白芯片檢測50-51
• 1.5.5 流式細(xì)胞檢測51
• 1.5.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法51
• 2. 結(jié)果51-70
• 2.1 中和抗體檢測51-53
• 2.2 轉(zhuǎn)錄組研究53-69
• 2.2.1 疫苗誘導(dǎo)固有免疫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄組譜53-56
• 2.2.2 固有免疫應(yīng)答通路小鼠實(shí)驗(yàn)56-58
• 2.2.3 流式細(xì)胞檢測58-59
• 2.2.4 固有免疫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄組與中和抗體水平關(guān)聯(lián)分析59-60
• 2.2.5 疫苗誘導(dǎo)獲得性免疫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄組譜60-62
• 2.2.6 獲得性免疫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄組與中和抗體水平關(guān)聯(lián)分析62-64
• 2.2.7 固有免疫應(yīng)答與獲得性免疫應(yīng)答轉(zhuǎn)錄組譜的比較64
• 2.2.8 EV71 抗原特異性免疫機(jī)制研究64-66
• 2.2.9 鋁佐劑免疫機(jī)制研究66-67
• 2.2.10 RT-PCR 驗(yàn)證67-69
• 2.3 蛋白組研究69-70
• 2.3.1 疫苗誘導(dǎo)獲得性免疫應(yīng)答蛋白組譜69-70
• 2.3.2 蛋白組與中和抗體水平關(guān)聯(lián)分析70
• 3. 討論70-72
• 4. 小結(jié)72-73
• 總結(jié)73-74
• 參考文獻(xiàn)74-77
• 綜述 177-82
• 參考文獻(xiàn)79-82
• 綜述 282-89
• 參考文獻(xiàn)85-89
• 碩士期間獲獎(jiǎng)及發(fā)表的文章89-90
• 致謝90-91

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 張軍楠;吳星;石大偉;毛群穎;姚昕;高帆;王一平;徐苗;梁爭論;;應(yīng)用Meta分析篩選疫苗免疫人體誘導(dǎo)的獲得性免疫基因和通路[J];中國病毒病雜志;2013年05期

本文編號(hào)：666938