基于圖元向量的差異共表達(dá)分析研究
本文關(guān)鍵詞:基于圖元向量的差異共表達(dá)分析研究
更多相關(guān)文章: 圖元向量 差異網(wǎng)絡(luò) 小鼠衰老
【摘要】:差異分析對(duì)于揭示生命體的生長(zhǎng)、發(fā)育和衰老過(guò)程及疾病發(fā)生具有重大的意義,基于網(wǎng)絡(luò)的差異分析方法已經(jīng)成為系統(tǒng)生物學(xué)的一個(gè)研究熱點(diǎn).Przulj提出的圖元及圖元向量作為一描述網(wǎng)絡(luò)局部結(jié)構(gòu)信息的方法,已經(jīng)在網(wǎng)絡(luò)分析方法面取得了很多重要的結(jié)果.本文在圖元向量的基礎(chǔ)上提出了二種節(jié)點(diǎn)變化的差距度量方法,通過(guò)聚類可以分別挖掘網(wǎng)絡(luò)中模塊內(nèi)變化基因簇和模塊間變化基因簇.應(yīng)用AGEMAP數(shù)據(jù)庫(kù)中12個(gè)小鼠組織基因表達(dá)數(shù)據(jù)的結(jié)果表明:大部分聚類簇都高度顯著富集與衰老相關(guān)的CO條目.
【作者單位】: 溫州大學(xué)物理與電子信息工程學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 圖元向量 差異網(wǎng)絡(luò) 小鼠衰老
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(No.61572367,No.61272018) 浙江省自然科學(xué)基金(No.R1110261) 浙江省新苗人才計(jì)劃(No.2012R424051)
【分類號(hào)】:TP311.13;R339.38
【正文快照】: j 差異分析確定小鼠受輻射影響的基因簇[5],Oldham等比對(duì)人類和黑猩猩差異網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)渲丿B,挖掘出與進(jìn)化系統(tǒng)生物學(xué)的研究表明·■生命體的生長(zhǎng)、發(fā)育、衰老有關(guān)的基因集合[6],Zhang提出差異相關(guān)子網(wǎng)絡(luò)(DDN),過(guò)程以及疾病的發(fā)生與基因之間相互作用的變化密切檢測(cè)兩個(gè)差異轉(zhuǎn)錄網(wǎng)
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3 陳t,
本文編號(hào):611292
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