本文關(guān)鍵詞：云南省豬戊型肝炎病毒全基因組擴(kuò)增及進(jìn)化分析

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【摘要】：目的對豬戊型肝炎病毒全長基因組進(jìn)行擴(kuò)增,分析其進(jìn)化關(guān)系,為HEV的感染性克隆研究奠定基礎(chǔ)。方法利用巢式逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng)(RT-nPCR)和RACE技術(shù)對豬糞便中HEV樣品進(jìn)行全基因組擴(kuò)增,利用DNAStar和MEGA4.0軟件進(jìn)行同源性比較和進(jìn)化樹分析。結(jié)果 RT-nPCR方法擴(kuò)增出HEV的5段目的基因序列和RACE技術(shù)擴(kuò)增出HEV的5′和3′端,序列比對結(jié)果正確,HEV全長擴(kuò)增成功。同源性分析顯示其與新疆株(GU119961)同源性較高(96.1%)。系統(tǒng)進(jìn)化樹顯示該病毒屬于基因4型h亞型豬HEV。結(jié)論 HEV全基因組序列擴(kuò)增成功,為深入研究HEV奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】： 昆明理工大學(xué)醫(yī)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 豬戊型肝炎病毒 巢式逆轉(zhuǎn)錄PCR 全長基因組分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金資助(No.31360619) 云南省自然科學(xué)基金(No.2013FB032,2011FZ068) 中國博士后科學(xué)基金(No.2014M562672)資助,楊臣臣和龍飛燕同等貢獻(xiàn)~~
【分類號】：R373
【正文快照】： (Medical Faculty,Kunming University of Science and Technology,Kunming650500,China)戊型肝炎病毒(hepatitis E virus,HEV),是一種經(jīng)腸道傳播,嚴(yán)重危害人類健康的病毒性肝炎病原體[1]。HEV主要經(jīng)過糞-口途徑傳播,食用HEV污染的水源和食物是導(dǎo)致HEV暴發(fā)流行的主要原因[2-3]

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 李文貴;佘銳萍;李睿文;舒相華;丁葉;岳卓;;昆明屠宰豬戊型肝炎病毒感染情況的調(diào)查[J];中國獸醫(yī)科學(xué);2010年06期

2 梁靖瑞;韋獻(xiàn)飛;薛城;吉彥莉;馬亞琪;唐榮蘭;朱永紅;莊輝;;豬HEV基因型和亞型的研究[J];中華微生物學(xué)和免疫學(xué)雜志;2007年08期

3 黃芬;禹文海;馬天武;井申榮;曾韋錕;;云南某農(nóng)村豬戊型肝炎病毒分子流行病學(xué)調(diào)查[J];中國人獸共患病學(xué)報;2012年03期

【共引文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前8條

1 李文貴;段新慧;張佳;嚴(yán)紅亞;;戊型肝炎病毒感染模型研究進(jìn)展[J];動物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2014年06期

2 周澤偉;唐啟明;;重慶某地戊型肝炎的臨床特點(diǎn)[J];檢驗醫(yī)學(xué)與臨床;2014年19期

3 劉利強(qiáng);王輝;杜娟;宋慧月;李海芹;佘銳萍;;屠宰豬肝臟的纖維化檢測[J];肉類研究;2012年03期

4 付紅偉;杜剛;朱永紅;李凌君;王玲;耿家寶;薛城;王曉娟;莊輝;;新疆豬戊型肝炎病毒株CHN-XJ-SW33全基因組序列分析[J];中國預(yù)防醫(yī)學(xué)雜志;2010年05期

5 胡鳳姣;李s，

本文編號：545893