本文關(guān)鍵詞：基于夾角余弦的度量識(shí)別阿爾茨海默病致病基因

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【摘要】：阿爾茨海默病一種神經(jīng)系統(tǒng)功能的持續(xù)性衰退的進(jìn)行性癡呆疾病。據(jù)統(tǒng)計(jì)，我國(guó)阿爾茨海默病的患者大約有900萬人。目前，，阿爾茨海默病并沒有有效的治療藥物。因此，阿爾茨海默病的前期診斷、病理研究、藥物開發(fā)具有非常重要的社會(huì)意義和巨大的經(jīng)濟(jì)效益。2002年基因芯片技術(shù)的應(yīng)用，使研究者們可以借助大量基因表達(dá)數(shù)據(jù)，設(shè)計(jì)算法來識(shí)別致病基因，研究阿爾茨海默病致病機(jī)理，達(dá)到徹底治愈阿爾茨海默病的目的。 本文圍繞已知的致病基因（APOE、presenilins1、 presenilins2等）來設(shè)計(jì)聚類算法，從中識(shí)別這些基因的伴隨基因。識(shí)別出的阿爾茨海默病的伴隨基因很有可能是致病基因，而且可以進(jìn)一步分析其功能作用來揭示阿爾茨海默病的致病機(jī)理或者為生物學(xué)實(shí)驗(yàn)的驗(yàn)證提供候選基因。 傳統(tǒng)的尋找阿爾茨海默病致病基因的算法幾乎都是以歐氏距離或由歐氏距離衍生出的距離為度量方式，而忽視了算法設(shè)計(jì)時(shí)，是否具有或者符合生物學(xué)意義。通過本文的討論，在利用已確認(rèn)致病基因?yàn)橹骰驅(qū)ふ野殡S基因的算法中，夾角余弦是更合理、更有效的度量方式，具有更好的生物學(xué)意義。因此，基于夾角余弦度量提出了分別利用切比雪夫不等式和K-means改進(jìn)算法設(shè)計(jì)兩種不同的聚類算法來識(shí)別阿爾茨海默病的致病基因，找到了一些阿爾茨海默病的致病基因并進(jìn)行了分析。
【關(guān)鍵詞】：阿爾茨海默病 基因芯片 夾角余弦 切比雪夫不等式 K-means算法
【學(xué)位授予單位】：四川師范大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類號(hào)】：R311;R749.16
【目錄】：

• 摘要3-4
• ABSTRACT4-6
• 1 緒論6-11
• 1.1 阿爾茨海默病及其研究現(xiàn)狀6-8
• 1.2 基因芯片技術(shù)的原理及其在阿爾茨海默病中的應(yīng)用8-9
• 1.3 本文研究目的與意義9-10
• 1.4 本文主要工作10-11
• 2 預(yù)備知識(shí)11-19
• 2.1 基因芯片的數(shù)據(jù)格式11-12
• 2.2 伴隨基因和阿爾茨海默病致病基因的識(shí)別原理12-13
• 2.3 常用的度量方式及夾角余弦度量13-17
• 2.4 切比雪夫不等式17-19
• 3 應(yīng)用夾角余弦和切比雪夫不等式識(shí)別致病基因19-31
• 3.1 算法的數(shù)學(xué)模型19-23
• 3.2 算法過程23-24
• 3.3 利用算法識(shí)別致病基因步驟24-25
• 3.4 實(shí)驗(yàn)及結(jié)果分析25-31
• 4 基于夾角余弦的 K-MEANS 改進(jìn)算法識(shí)別致病基因31-39
• 4.1 K-MEANS 聚類算法介紹31
• 4.2 K-MEANS 聚類算法的缺點(diǎn)及改進(jìn)31-33
• 4.3 基于夾角余弦的 K-MEANS 改進(jìn)算法識(shí)別致病基因33-35
• 4.4 實(shí)驗(yàn)及結(jié)果分析35-39
• 5 結(jié)論與展望39-41
• 參考文獻(xiàn)41-46
• 附錄46-54
• 致謝54-56
• 在校期間的科研成果56

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 殷俊;周靜波;金忠;;基于余弦角距離的主成分分析與核主成分分析[J];計(jì)算機(jī)工程與應(yīng)用;2011年03期

2 劉奎;張琨;王翠榮;;利用切比雪夫不等式的背景建模算法[J];計(jì)算機(jī)應(yīng)用與軟件;2012年04期

3 宋麗紅;;K-均值聚類的Matlab仿真設(shè)計(jì)[J];實(shí)驗(yàn)技術(shù)與管理;2010年10期

4 喬生炳;“熵”概念的拓展及應(yīng)用[J];現(xiàn)代物理知識(shí);2001年03期

本文編號(hào)：535500