用DNAStar軟件預(yù)測Rv1410c結(jié)核分枝桿菌蛋白抗原表位
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【摘要】:目的預(yù)測Rv1410c結(jié)核分枝桿菌(MTB)的抗原表位。方法利用DNAStar軟件包中Editseq軟件將Rv1410c MTB氨基酸序列進(jìn)行編輯保存,然后利用Protean軟件進(jìn)行氨基酸序列分析,預(yù)測Rv1410c MTB的二級結(jié)構(gòu)、B細(xì)胞抗原表位及T細(xì)胞抗原表位,然后再用BLAST分析其與人類抗原表位的同源性。結(jié)果 Rv1410c具有豐富的二級結(jié)構(gòu),含有較多潛在的B細(xì)胞抗原肽表位,主要位于1~10、67~77、129~137、189~205、222~235、253~267、296~306、330~338、359~367、462~467、494~517氨基酸殘基或其附近,這些區(qū)域基本上含有β轉(zhuǎn)角結(jié)構(gòu),親水性、表面可能性和柔韌性指數(shù)都較高;也含有較多潛在的T細(xì)胞表位,主要位于16~37、84~102、108~115、137~160、202~207、219~222、245~263、321~325、355~362、387~391、417~445、486~494氨基酸殘基或其附近。結(jié)論 Rv1410c MTB既含有較多潛在的B細(xì)胞抗原表位,也含有較多潛在的T細(xì)胞抗原表位。
【作者單位】: 河北北方學(xué)院;解放軍第309醫(yī)院全軍結(jié)核病研究所全軍結(jié)核病防治重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 抗原表位 DNAStar軟件 結(jié)核分枝桿菌 Rvc 二級結(jié)構(gòu)
【基金】:國家重大傳染病防治科技重大專項(xiàng)基金(2012ZX10003008002) 軍隊(duì)醫(yī)學(xué)科技“十二五”重點(diǎn)項(xiàng)目(BWS11J050) 北京市科技創(chuàng)新基地培育與發(fā)展工程專項(xiàng)(Z141107004414021)
【分類號】:R378.911
【正文快照】: 結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)是第二大致死性感染性疾病的病原體,以呼吸道感染為主要途徑,一旦侵入宿主體內(nèi)即很難被清除,并且由于缺乏準(zhǔn)確、快速和具有效益的診斷依據(jù),此病的防治仍然是我國需要解決的重大問題之一。1/3的世界人口有MTB的潛伏感染,5%~10%的
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本文編號:486022
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