本文關(guān)鍵詞：基于ISC-SVR方法預(yù)測Th細(xì)胞表位，，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：外源性抗原蛋白被抗原提呈細(xì)胞(APC)攝取送入溶酶體中被降解為長度不一的肽段.在HLA-DM分子輔助下,MHC II類分子相關(guān)恒定鏈多肽(class II-associated invariant chain peptide,CLIP)從MHC II類分子的肽結(jié)合槽解離,使得外源性抗原降解的肽段進(jìn)入MHC II類分子空的肽結(jié)合槽中,形成穩(wěn)定的抗原肽-MHC II類分子復(fù)合物.之后再被提呈到APC細(xì)胞表面供CD4+Th細(xì)胞的TCR識別,激活Th細(xì)胞分泌細(xì)胞因子,促進(jìn)CTL細(xì)胞特異性殺傷靶細(xì)胞或輔助B細(xì)胞產(chǎn)生抗體.Th細(xì)胞的活化對機體的細(xì)胞免疫和體液免疫功能都有重要的輔助作用.本工作基于迭代自洽策略與支持向量回歸機(ISC-SVR)方法建立了MHC II類分子與外源性抗原肽結(jié)合親合力預(yù)測模型,采用13mer擴展核心結(jié)合序列可以提高預(yù)測模型的性能,分別按照均值法、最大值法、結(jié)合法、加權(quán)平均值法4種方法計算MHC II類分子與抗原肽的結(jié)合親合力值.對17種MHC II類分子配型進(jìn)行了回歸分析,與其他預(yù)測模型相比較,本工作模型都得到了最佳AUC值.最后,以HLA DRB1*0101分子為例,分析討論了MHC II類分子與抗原肽的結(jié)合特異性.
【作者單位】： 大連理工大學(xué)高科技研究院;
【關(guān)鍵詞】： T細(xì)胞 表位 外源性抗原 MHCII類分子 支持向量回歸機
【分類號】：R392
【正文快照】： 1引言T細(xì)胞是重要的免疫細(xì)胞之一,它的主要作用是介導(dǎo)特異性免疫應(yīng)答,調(diào)節(jié)機體的免疫功能.外周成熟的T細(xì)胞實際上是由異質(zhì)性群體構(gòu)成的,按功能不同可分為輔助性T細(xì)胞(helper T cell,Th)、細(xì)胞毒性T細(xì)胞(cytotoxic T lymphocyte,CTL)和抑制性T細(xì)胞(suppressor T cell,Ts).CD4+

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本文編號：445968