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應(yīng)用16S rRNA基因序列分析技術(shù)鑒定臨床非典型細(xì)菌

發(fā)布時(shí)間:2017-06-10 21:08

  本文關(guān)鍵詞:應(yīng)用16S rRNA基因序列分析技術(shù)鑒定臨床非典型細(xì)菌,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的:將16S rRNA基因序列分析技術(shù)應(yīng)用于微生物實(shí)驗(yàn)室傳統(tǒng)方法鑒定可靠率低或無法鑒定的15株實(shí)驗(yàn)細(xì)菌,作為細(xì)菌常規(guī)鑒定手段的必要補(bǔ)充。 方法:選擇我院臨床微生物實(shí)驗(yàn)室保存的5株標(biāo)準(zhǔn)菌株驗(yàn)證實(shí)驗(yàn)方法的準(zhǔn)確性后,收集實(shí)驗(yàn)室常規(guī)方法不能準(zhǔn)確鑒定的實(shí)驗(yàn)細(xì)菌15株(涵蓋革蘭陽(yáng)性球菌,革蘭陽(yáng)性桿菌及革蘭陰性桿菌),,提取DNA模板,通用引物PCR擴(kuò)增16S rRNA基因片段,擴(kuò)增產(chǎn)物由華大基因測(cè)序公司測(cè)序,將16S rRNA基因序列與GENBANK數(shù)據(jù)庫(kù)中16S rRNA序列進(jìn)行同源比對(duì)分析后,把16S rRNA序列同源性在95%~99%之間定義為同屬細(xì)菌,大于等于99%則定義為同種細(xì)菌。 結(jié)果:在15株實(shí)驗(yàn)細(xì)菌中,有14株菌(93.3%)的16S rRNA基因序列與GENBANK數(shù)據(jù)庫(kù)16S rRNA序列同源性達(dá)99%以上,成功鑒定到種的水平,包括鼻疽諾卡菌,大腸埃希菌,阿爾萊特葡萄球菌,脆弱擬桿菌,弗氏檸檬酸桿菌,短小芽孢桿菌,河流漫游球菌,極小短小桿菌,伴放線凝聚桿菌,毗鄰顆粒球菌;1株菌(6.6%)的16S rRNA序列同源性為97%,鑒定到屬的水平,歸屬于短狀桿菌屬。 結(jié)論:對(duì)于微生物實(shí)驗(yàn)室利用傳統(tǒng)方法無法準(zhǔn)確鑒定的細(xì)菌,利用16S rRNA基因序列分析技術(shù)鑒定具有準(zhǔn)確、快速及簡(jiǎn)便的特點(diǎn),可適用于臨床非典型菌、少見菌以及新型細(xì)菌的鑒定。
【關(guān)鍵詞】:16S rRNA 核糖體 細(xì)菌 鑒定
【學(xué)位授予單位】:重慶醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2013
【分類號(hào)】:R372
【目錄】:
  • 英漢縮略語名詞對(duì)照5-6
  • 摘要6-8
  • ABSTRACT8-10
  • 前言10-11
  • 實(shí)驗(yàn)材料11-12
  • 實(shí)驗(yàn)方法12-13
  • 實(shí)驗(yàn)結(jié)果13-15
  • 討論15-19
  • 全文總結(jié)19-20
  • 參考文獻(xiàn)20-23
  • 文獻(xiàn)綜述23-29
  • 參考文獻(xiàn)27-29
  • 致謝29-30
  • 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文30-31

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 李仲興;張新華;;乏養(yǎng)球菌與顆粒鏈菌感染的研究進(jìn)展[J];河北醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2006年02期

2 王蓉美;蔡慶;高和;隋東江;張虎;馬文杰;張波;;采用PCR與RFLP方法快速診斷細(xì)菌感染[J];中華實(shí)用診斷與治療雜志;2009年12期

3 李建標(biāo),郭兆彪,林萬明;脆弱擬桿菌DNA探針在臨床上的應(yīng)用[J];臨床檢驗(yàn)雜志;2001年02期

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5 張媛;張媛媛;李振軍;萬康林;;諾卡氏菌研究進(jìn)展[J];中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào);2012年06期


  本文關(guān)鍵詞:應(yīng)用16S rRNA基因序列分析技術(shù)鑒定臨床非典型細(xì)菌,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。



本文編號(hào):439891

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